17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1962 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1962  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5973  hypothetical protein  70.05 
 
 		 218 aa  284  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.342038  normal  0.0834195 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16290  hypothetical protein  47.93 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2459  hypothetical protein  42.6 
 
 		 227 aa  149  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0114173  normal  0.0254112 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3302  hypothetical protein  43.75 
 
 		 230 aa  136  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000309887 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4873  hypothetical protein  40.72 
 
 		 230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2287  hypothetical protein  42.79 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00162453  hitchhiker  0.00283491 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2557  hypothetical protein  47.12 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2284  hypothetical protein  41.46 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.030938  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2020  hypothetical protein  41.52 
 
 		 224 aa  112  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2749  hypothetical protein  40.18 
 
 		 293 aa  111  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0549681 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0803  eRF1 domain 2 protein  34.55 
 
 		 362 aa  57  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  35.96 
 
 		 358 aa  52.4  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3257  hypothetical protein  33.07 
 
 		 298 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.471093 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1602  hypothetical protein  31.78 
 
 		 302 aa  46.2  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0714665 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2291  hypothetical protein  30.77 
 
 		 363 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3407  hypothetical protein  38.04 
 
 		 368 aa  41.6  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.741833  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>