138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1033 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1033  DRTGG domain protein  100 
 
 
355 aa  719    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00622763  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2427  DRTGG domain protein  63.92 
 
 
353 aa  478  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.67559  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1705  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  63.71 
 
 
354 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1641  DRTGG domain-containing protein  63.07 
 
 
354 aa  461  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.163018  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0242  DRTGG domain protein  63.07 
 
 
354 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0636501 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3243  hypothetical protein  53.12 
 
 
353 aa  386  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0645555  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1866  DRTGG domain protein  53.24 
 
 
353 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0342  DRTGG domain-containing protein  51.56 
 
 
363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221378  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0075  DRTGG domain-containing protein  33.82 
 
 
357 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.33059  hitchhiker  0.0000000201295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4533  DRTGG domain-containing protein  34.39 
 
 
357 aa  233  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0863  hypothetical protein  33.98 
 
 
393 aa  215  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00542873  normal  0.0353639 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3835  DRTGG domain protein  31.55 
 
 
356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379504 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3751  DRTGG domain-containing protein  31.88 
 
 
353 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1346  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.85 
 
 
355 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0427  DRTGG domain protein  34.58 
 
 
362 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.857593 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2994  DRTGG domain protein  32.76 
 
 
356 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3126  DRTGG domain protein  33.53 
 
 
355 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3353  DRTGG domain protein  32.39 
 
 
358 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2747  DRTGG  33.05 
 
 
357 aa  192  5e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0443759  normal  0.208128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1998  DRTGG  32.56 
 
 
364 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.253796  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2292  DRTGG domain protein  30.55 
 
 
355 aa  179  5.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04791  phosphotransacetylase domain-containing protein  32.66 
 
 
363 aa  179  8e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3303  DRTGG domain-containing protein  32.02 
 
 
371 aa  176  5e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06871  phosphotransacetylase domain-containing protein  32.31 
 
 
366 aa  176  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1711  hypothetical protein  31.44 
 
 
365 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1638  DRTGG domain protein  30.92 
 
 
396 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2279  DRTGG domain protein  29.06 
 
 
355 aa  172  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0989454  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3476  DRTGG domain protein  31.03 
 
 
420 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152203  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0648  hypothetical protein  30.11 
 
 
371 aa  169  5e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05351  phosphotransacetylase domain-containing protein  30.19 
 
 
363 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.204674 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1811  phosphotransacetylase domain-containing protein  31.15 
 
 
363 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00276331  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0896  DRTGG domain-containing protein  30.81 
 
 
351 aa  163  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.658378  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0316  DRTGG domain protein  28.77 
 
 
353 aa  162  7e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.203818 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0479  BioD-like N-terminal domain of phosphotransacetylase  30.08 
 
 
369 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05421  phosphotransacetylase domain-containing protein  30.08 
 
 
369 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1699  DRTGG domain protein  30.64 
 
 
356 aa  160  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05341  phosphotransacetylase domain-containing protein  30.42 
 
 
369 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05041  phosphotransacetylase domain-containing protein  30.59 
 
 
369 aa  155  9e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2082  DRTGG domain-containing protein  25.42 
 
 
349 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1048  phosphate acetyltransferase  22.29 
 
 
700 aa  72.4  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4480  phosphate acetyltransferase  22.01 
 
 
698 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3476  phosphate acetyltransferase  20.21 
 
 
707 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2640  phosphate acetyltransferase  20.21 
 
 
707 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.193929  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3540  phosphate acetyltransferase  24.68 
 
 
712 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1616  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  21.47 
 
 
363 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0924074  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  23.35 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1864  phosphate acetyltransferase  22.19 
 
 
704 aa  65.9  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2410  phosphate acetyltransferase  26.85 
 
 
726 aa  65.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000273305  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0262  phosphate acetyltransferase  22.16 
 
 
683 aa  65.1  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0344  phosphate acetyltransferase  21.86 
 
 
704 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.072273  normal  0.492419 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1681  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  23.3 
 
 
363 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.307852  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4138  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  22.87 
 
 
370 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2694  phosphate acetyltransferase  25.69 
 
 
717 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000035101  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3312  phosphate acetyltransferase  19.84 
 
 
720 aa  63.2  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4809  phosphate acetyltransferase  20.16 
 
 
701 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932009 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1517  transcription regulator  29.45 
 
 
426 aa  62  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0152362  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2675  phosphate acetyltransferase  25.3 
 
 
717 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000376999  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2394  phosphate acetyltransferase  25.94 
 
 
712 aa  60.8  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00114366  normal  0.608278 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2773  phosphate acetyltransferase  25.3 
 
 
717 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000126217  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1690  phosphate acetyltransferase  25.3 
 
 
717 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000858344  normal  0.0172468 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_50625  predicted protein  24.36 
 
 
495 aa  61.2  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1494  phosphate acetyltransferase  22.75 
 
 
712 aa  60.5  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000825995  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1045  phosphate acetyltransferase  23.32 
 
 
702 aa  60.5  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3241  phosphate acetyltransferase  23.16 
 
 
719 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2997  phosphate acetyltransferase  23.04 
 
 
703 aa  58.9  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.135011  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2382  phosphate acetyltransferase  26.42 
 
 
717 aa  58.9  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000517206  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3529  phosphate acetyltransferase  23.81 
 
 
697 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.682765  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2887  phosphate acetyltransferase  26.88 
 
 
713 aa  58.9  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000745761  decreased coverage  0.0000011303 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2477  phosphate acetyltransferase  25.93 
 
 
715 aa  58.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1551  phosphate acetyltransferase  25.94 
 
 
717 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0542172  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3046  phosphate acetyltransferase  20.8 
 
 
689 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1668  phosphate acetyltransferase  25.6 
 
 
715 aa  58.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000363835  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01780  phosphate acetyltransferase  23.48 
 
 
691 aa  58.5  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0693  phosphate acetyltransferase  22.97 
 
 
699 aa  57.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.206034  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  27.93 
 
 
243 aa  57.4  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2784  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  31.9 
 
 
377 aa  57.4  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.542112  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2398  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  28.45 
 
 
387 aa  57  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000381603  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1704  phosphate acetyltransferase  26.55 
 
 
713 aa  57  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000601428  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2916  phosphate acetyltransferase  25.94 
 
 
717 aa  56.6  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1557  phosphate acetyltransferase  25.47 
 
 
717 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.243482  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0813  phosphate acetyltransferase  23.04 
 
 
695 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0774  phosphate acetyltransferase  23.78 
 
 
695 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.81433  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1490  phosphate acetyltransferase  25.6 
 
 
717 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000130652  normal  0.921429 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41130  phosphate acetyltransferase  22.8 
 
 
691 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735212  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0799  phosphate acetyltransferase  23.78 
 
 
695 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.148954 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  26.32 
 
 
242 aa  54.3  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48580  predicted protein  22.43 
 
 
476 aa  54.3  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0000300421  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1871  phosphate acetyltransferase  20.89 
 
 
691 aa  53.9  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3031  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  20.98 
 
 
363 aa  54.3  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000498688  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2954  phosphate acetyltransferase  24 
 
 
696 aa  53.9  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2543  phosphotransacetylase domain-containing protein  21.92 
 
 
363 aa  53.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4415  phosphate acetyltransferase  23.58 
 
 
695 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259249  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0537  phosphate acetyltransferase  22.5 
 
 
704 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0549  phosphate acetyltransferase  22.5 
 
 
704 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0527  phosphate acetyltransferase  22.5 
 
 
704 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1007  phosphate acetyltransferase  22.59 
 
 
696 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1035  phosphate acetyltransferase  20.06 
 
 
702 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0294331  normal  0.684952 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53480  phosphate acetyltransferase  23.06 
 
 
704 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014166 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1472  phosphate acetyltransferase  20.57 
 
 
699 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.253391 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3645  phosphate acetyltransferase  22.79 
 
 
697 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>