160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0242 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1705  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  87.85 
 
 
354 aa  643    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1641  DRTGG domain-containing protein  93.79 
 
 
354 aa  679    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.163018  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0242  DRTGG domain protein  100 
 
 
354 aa  712    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0636501 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2427  DRTGG domain protein  72.93 
 
 
353 aa  543  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.67559  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1033  DRTGG domain protein  63.07 
 
 
355 aa  462  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00622763  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1866  DRTGG domain protein  49.72 
 
 
353 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3243  hypothetical protein  47.73 
 
 
353 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0645555  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0342  DRTGG domain-containing protein  47.34 
 
 
363 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221378  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3835  DRTGG domain protein  35.23 
 
 
356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379504 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0075  DRTGG domain-containing protein  33.71 
 
 
357 aa  227  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.33059  hitchhiker  0.0000000201295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4533  DRTGG domain-containing protein  34.28 
 
 
357 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3751  DRTGG domain-containing protein  32.95 
 
 
353 aa  223  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1998  DRTGG  32.95 
 
 
364 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.253796  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1346  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.15 
 
 
355 aa  204  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0863  hypothetical protein  32.39 
 
 
393 aa  203  4e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00542873  normal  0.0353639 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3353  DRTGG domain protein  32.73 
 
 
358 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0427  DRTGG domain protein  32.36 
 
 
362 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.857593 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3303  DRTGG domain-containing protein  30.56 
 
 
371 aa  184  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3126  DRTGG domain protein  31.1 
 
 
355 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2994  DRTGG domain protein  31.1 
 
 
356 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2279  DRTGG domain protein  29.15 
 
 
355 aa  182  9.000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0989454  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2747  DRTGG  29.94 
 
 
357 aa  179  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0443759  normal  0.208128 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2292  DRTGG domain protein  30.32 
 
 
355 aa  175  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1711  hypothetical protein  30.14 
 
 
365 aa  174  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0896  DRTGG domain-containing protein  30.03 
 
 
351 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.658378  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04791  phosphotransacetylase domain-containing protein  29.36 
 
 
363 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3476  DRTGG domain protein  30.61 
 
 
420 aa  169  8e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152203  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0316  DRTGG domain protein  29.91 
 
 
353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.203818 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0648  hypothetical protein  29.3 
 
 
371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1638  DRTGG domain protein  29.79 
 
 
396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0479  BioD-like N-terminal domain of phosphotransacetylase  30.75 
 
 
369 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06871  phosphotransacetylase domain-containing protein  28.25 
 
 
366 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1699  DRTGG domain protein  29.6 
 
 
356 aa  156  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1811  phosphotransacetylase domain-containing protein  27.99 
 
 
363 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00276331  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05341  phosphotransacetylase domain-containing protein  29.92 
 
 
369 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05421  phosphotransacetylase domain-containing protein  27.9 
 
 
369 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05041  phosphotransacetylase domain-containing protein  28.93 
 
 
369 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2082  DRTGG domain-containing protein  26.46 
 
 
349 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05351  phosphotransacetylase domain-containing protein  27.67 
 
 
363 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.204674 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4480  phosphate acetyltransferase  23.24 
 
 
698 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1864  phosphate acetyltransferase  23.01 
 
 
704 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3529  phosphate acetyltransferase  23.94 
 
 
697 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.682765  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3046  phosphate acetyltransferase  24.05 
 
 
689 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2543  phosphotransacetylase domain-containing protein  21.31 
 
 
363 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3312  phosphate acetyltransferase  20.31 
 
 
720 aa  72.8  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1132  phosphate acetyltransferase  22.14 
 
 
717 aa  72  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1048  phosphate acetyltransferase  21.19 
 
 
700 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0344  phosphate acetyltransferase  23.08 
 
 
704 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.072273  normal  0.492419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0813  phosphate acetyltransferase  23.78 
 
 
695 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53480  phosphate acetyltransferase  22.87 
 
 
704 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014166 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0537  phosphate acetyltransferase  25.07 
 
 
704 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0549  phosphate acetyltransferase  25.07 
 
 
704 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0527  phosphate acetyltransferase  25.07 
 
 
704 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1035  phosphate acetyltransferase  20.12 
 
 
702 aa  68.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0294331  normal  0.684952 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10413  phosphate acetyltransferase  26.2 
 
 
690 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4685  phosphate acetyltransferase  22.61 
 
 
704 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.633207  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  31.03 
 
 
370 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4138  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  31.03 
 
 
370 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3240  phosphate acetyltransferase  22.78 
 
 
703 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41130  phosphate acetyltransferase  22.84 
 
 
691 aa  67  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735212  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0774  phosphate acetyltransferase  23.51 
 
 
695 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.81433  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01780  phosphate acetyltransferase  23.81 
 
 
691 aa  66.6  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1007  phosphate acetyltransferase  23.85 
 
 
696 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0799  phosphate acetyltransferase  23.51 
 
 
695 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.148954 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4809  phosphate acetyltransferase  21.77 
 
 
701 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932009 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4415  phosphate acetyltransferase  23.58 
 
 
695 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259249  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2640  phosphate acetyltransferase  19.06 
 
 
707 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.193929  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1169  phosphate acetyltransferase  23.58 
 
 
696 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957465  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3645  phosphate acetyltransferase  21.39 
 
 
697 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3476  phosphate acetyltransferase  18.78 
 
 
707 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3241  phosphate acetyltransferase  20.49 
 
 
719 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3540  phosphate acetyltransferase  25 
 
 
712 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48580  predicted protein  24.16 
 
 
476 aa  63.2  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0000300421  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0262  phosphate acetyltransferase  23.05 
 
 
683 aa  62.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1472  phosphate acetyltransferase  23.32 
 
 
699 aa  62.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.253391 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1681  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  20 
 
 
363 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.307852  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1517  transcription regulator  27.61 
 
 
426 aa  61.2  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0152362  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3473  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  26.21 
 
 
363 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0297  phosphate acetyltransferase  20.99 
 
 
702 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.954755  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_50625  predicted protein  22.69 
 
 
495 aa  61.2  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0880  phosphate acetyltransferase  22.76 
 
 
699 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2784  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  20.82 
 
 
377 aa  60.8  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.542112  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3031  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  19.78 
 
 
363 aa  60.8  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000498688  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  27.83 
 
 
242 aa  60.1  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2477  phosphate acetyltransferase  21.51 
 
 
715 aa  60.5  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2395  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  25.52 
 
 
363 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0460096  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1824  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  25.52 
 
 
363 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00447956 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1871  phosphate acetyltransferase  20.66 
 
 
691 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3278  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  25.59 
 
 
364 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0982  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  26.07 
 
 
364 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00173094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1616  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  19.78 
 
 
363 aa  57.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0924074  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  25.98 
 
 
243 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1668  phosphate acetyltransferase  24.7 
 
 
715 aa  57  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000363835  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2887  phosphate acetyltransferase  23.81 
 
 
713 aa  57  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000745761  decreased coverage  0.0000011303 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2410  phosphate acetyltransferase  21.13 
 
 
726 aa  56.6  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000273305  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  22.66 
 
 
244 aa  56.6  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2394  phosphate acetyltransferase  23.49 
 
 
712 aa  56.2  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00114366  normal  0.608278 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0643  phosphate acetyltransferase  21.64 
 
 
687 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4028  phosphotransacetylase domain-containing protein  22.76 
 
 
363 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000311245  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  27.31 
 
 
264 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>