119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3243 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3243  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  716    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0645555  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1866  DRTGG domain protein  67.99 
 
 
353 aa  477  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0342  DRTGG domain-containing protein  64.53 
 
 
363 aa  448  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221378  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1705  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  50.57 
 
 
354 aa  391  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2427  DRTGG domain protein  48.87 
 
 
353 aa  384  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.67559  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1033  DRTGG domain protein  53.12 
 
 
355 aa  386  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00622763  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0242  DRTGG domain protein  47.73 
 
 
354 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0636501 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1641  DRTGG domain-containing protein  47.44 
 
 
354 aa  364  1e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.163018  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3835  DRTGG domain protein  34.55 
 
 
356 aa  211  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379504 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0075  DRTGG domain-containing protein  33.52 
 
 
357 aa  203  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.33059  hitchhiker  0.0000000201295 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3751  DRTGG domain-containing protein  31.92 
 
 
353 aa  202  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4533  DRTGG domain-containing protein  33.52 
 
 
357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1346  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.62 
 
 
355 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0863  hypothetical protein  32.96 
 
 
393 aa  192  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00542873  normal  0.0353639 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3353  DRTGG domain protein  32.95 
 
 
358 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2747  DRTGG  31.36 
 
 
357 aa  172  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0443759  normal  0.208128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0427  DRTGG domain protein  32.18 
 
 
362 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.857593 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2279  DRTGG domain protein  29.91 
 
 
355 aa  168  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0989454  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3303  DRTGG domain-containing protein  30.68 
 
 
371 aa  166  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1998  DRTGG  29.33 
 
 
364 aa  162  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.253796  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2994  DRTGG domain protein  30.75 
 
 
356 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3126  DRTGG domain protein  30.75 
 
 
355 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1638  DRTGG domain protein  31.64 
 
 
396 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04791  phosphotransacetylase domain-containing protein  31.49 
 
 
363 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1699  DRTGG domain protein  33.94 
 
 
356 aa  155  9e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2292  DRTGG domain protein  28.77 
 
 
355 aa  154  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0316  DRTGG domain protein  30.17 
 
 
353 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.203818 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2082  DRTGG domain-containing protein  29.63 
 
 
349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1811  phosphotransacetylase domain-containing protein  32.42 
 
 
363 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00276331  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3476  DRTGG domain protein  31.03 
 
 
420 aa  151  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152203  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05351  phosphotransacetylase domain-containing protein  32.14 
 
 
363 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.204674 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0896  DRTGG domain-containing protein  29.39 
 
 
351 aa  149  6e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.658378  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06871  phosphotransacetylase domain-containing protein  30.22 
 
 
366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0648  hypothetical protein  30.84 
 
 
371 aa  146  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1711  hypothetical protein  30.19 
 
 
365 aa  146  6e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0479  BioD-like N-terminal domain of phosphotransacetylase  28.25 
 
 
369 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05341  phosphotransacetylase domain-containing protein  28.53 
 
 
369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05041  phosphotransacetylase domain-containing protein  28.53 
 
 
369 aa  140  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05421  phosphotransacetylase domain-containing protein  27.82 
 
 
369 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3046  phosphate acetyltransferase  25.74 
 
 
689 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3240  phosphate acetyltransferase  25.3 
 
 
703 aa  69.7  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4480  phosphate acetyltransferase  23.92 
 
 
698 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1681  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  29.17 
 
 
363 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.307852  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3312  phosphate acetyltransferase  22.45 
 
 
720 aa  67.4  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1824  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  21.6 
 
 
363 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00447956 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2395  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  21.33 
 
 
363 aa  62.8  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0460096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2398  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  32.19 
 
 
387 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000381603  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  24.56 
 
 
244 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3529  phosphate acetyltransferase  22.52 
 
 
697 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.682765  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2543  phosphotransacetylase domain-containing protein  27.12 
 
 
363 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3031  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  20.88 
 
 
363 aa  61.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000498688  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0262  phosphate acetyltransferase  24.66 
 
 
683 aa  60.5  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  28.5 
 
 
263 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  26.05 
 
 
242 aa  57.8  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2784  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  28.81 
 
 
377 aa  57  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.542112  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  25.48 
 
 
243 aa  57  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  31.48 
 
 
240 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1616  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  26.71 
 
 
363 aa  56.6  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0924074  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1472  phosphate acetyltransferase  21.77 
 
 
699 aa  56.6  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.253391 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4809  phosphate acetyltransferase  19.73 
 
 
701 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932009 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1045  phosphate acetyltransferase  22.85 
 
 
702 aa  55.8  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0051  phosphate acetyltransferase  23.1 
 
 
703 aa  55.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.833181 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0297  phosphate acetyltransferase  21.99 
 
 
702 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.954755  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1517  transcription regulator  25.34 
 
 
426 aa  54.7  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0152362  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4028  phosphotransacetylase domain-containing protein  32.43 
 
 
363 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000311245  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  25.42 
 
 
370 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4330  dithiobiotin synthetase  26.24 
 
 
228 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112465  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4138  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  25.42 
 
 
370 aa  54.3  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0982  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  26.55 
 
 
364 aa  53.1  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00173094  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1268  CBS domain-containing protein  31.9 
 
 
432 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1048  phosphate acetyltransferase  23.2 
 
 
700 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48580  predicted protein  25.35 
 
 
476 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0000300421  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3278  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  32.43 
 
 
364 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34550  phosphate acetyltransferase  23.08 
 
 
712 aa  51.2  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_50625  predicted protein  22.71 
 
 
495 aa  50.4  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  27.01 
 
 
239 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3476  phosphate acetyltransferase  20.87 
 
 
707 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1864  phosphate acetyltransferase  21.77 
 
 
704 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2410  phosphate acetyltransferase  25.81 
 
 
726 aa  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000273305  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  27.01 
 
 
239 aa  49.7  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0344  phosphate acetyltransferase  22.89 
 
 
704 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.072273  normal  0.492419 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1035  phosphate acetyltransferase  21.99 
 
 
702 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0294331  normal  0.684952 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3473  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  26.35 
 
 
363 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3645  phosphate acetyltransferase  23.67 
 
 
697 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01780  phosphate acetyltransferase  24.57 
 
 
691 aa  48.1  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0643  phosphate acetyltransferase  24.67 
 
 
699 aa  48.5  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.65849  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0033  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  29.63 
 
 
365 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2640  phosphate acetyltransferase  20.33 
 
 
707 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.193929  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2394  phosphate acetyltransferase  25.16 
 
 
712 aa  47.4  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00114366  normal  0.608278 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1761  DRTGG domain-containing protein  24.35 
 
 
432 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.540009  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1795  DRTGG domain-containing protein  24.35 
 
 
432 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  23.76 
 
 
211 aa  46.6  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4072  phosphate acetyltransferase  27.25 
 
 
689 aa  47  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  25.42 
 
 
243 aa  46.6  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41130  phosphate acetyltransferase  25.21 
 
 
691 aa  46.6  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735212  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  22.4 
 
 
364 aa  46.2  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.796519  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  24 
 
 
243 aa  46.2  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3100  phosphate acetyltransferase  23.28 
 
 
711 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1871  phosphate acetyltransferase  19.33 
 
 
691 aa  46.2  0.0009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  27.83 
 
 
241 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.413996 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>