234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1268 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1268  CBS domain-containing protein  100 
 
 
432 aa  874    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1761  DRTGG domain-containing protein  72.33 
 
 
432 aa  655    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.540009  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1795  DRTGG domain-containing protein  72.33 
 
 
432 aa  655    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2695  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  46.9 
 
 
438 aa  435  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0768  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  45.85 
 
 
435 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4744  thioesterase family protein  46.77 
 
 
437 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4505  thioesterase family protein  46.54 
 
 
437 aa  408  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4341  CBS domain-containing cytosolic protein  46.54 
 
 
437 aa  408  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4858  thioesterase family protein  46.54 
 
 
437 aa  408  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4720  thioesterase family protein  46.54 
 
 
437 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4727  thioesterase family protein  46.54 
 
 
437 aa  408  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4739  thioesterase family protein  46.77 
 
 
437 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4353  CBS domain-containing cytosolic protein  46.31 
 
 
437 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0517  thioesterase family protein  46.31 
 
 
437 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4440  signal-transduction protein  46.31 
 
 
437 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3293  DRTGG domain-containing protein  45.62 
 
 
437 aa  405  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.113005  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2357  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  42.17 
 
 
435 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.889148  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1191  DRTGG domain-containing protein  39.4 
 
 
435 aa  322  7e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0546  putative signal-transduction protein with CBS and DRTGG domains  35.94 
 
 
434 aa  299  5e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2409  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  35.71 
 
 
437 aa  288  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000183212  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1517  transcription regulator  35.41 
 
 
426 aa  278  2e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0152362  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0776  transcription regulator  34.18 
 
 
419 aa  263  3e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0845  CBS domain-containing protein  33.65 
 
 
427 aa  250  3e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2027  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  27.56 
 
 
549 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2312  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  26.28 
 
 
549 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0248  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  25.29 
 
 
548 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1712  Inorganic diphosphatase  22.16 
 
 
542 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1250  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  23.43 
 
 
552 aa  61.2  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0944218 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2747  DRTGG  30.16 
 
 
357 aa  61.6  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0443759  normal  0.208128 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0863  hypothetical protein  30.15 
 
 
393 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00542873  normal  0.0353639 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0693  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  27.27 
 
 
539 aa  59.3  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0417548  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3476  DRTGG domain protein  33.64 
 
 
420 aa  58.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152203  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0427  DRTGG domain protein  27.1 
 
 
362 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.857593 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2994  DRTGG domain protein  30.77 
 
 
356 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1346  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.61 
 
 
355 aa  57.8  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3126  DRTGG domain protein  30.77 
 
 
355 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1795  CBS domain-containing protein  31.86 
 
 
251 aa  57.4  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0342  DRTGG domain-containing protein  27.83 
 
 
363 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221378  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1866  DRTGG domain protein  27.87 
 
 
353 aa  57  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1515  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  24.88 
 
 
544 aa  56.6  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1716  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.71 
 
 
489 aa  55.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.626692  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1699  DRTGG domain protein  31.25 
 
 
356 aa  55.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3353  DRTGG domain protein  28.57 
 
 
358 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2230  signal transduction protein  24.77 
 
 
249 aa  55.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3303  DRTGG domain-containing protein  31.62 
 
 
371 aa  55.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2082  DRTGG domain-containing protein  29.27 
 
 
349 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2864  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  24.04 
 
 
548 aa  53.9  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000305712  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  28.38 
 
 
862 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  29.52 
 
 
875 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  33.96 
 
 
223 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0189  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  25.29 
 
 
489 aa  53.9  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133225  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  25.75 
 
 
863 aa  53.5  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2279  DRTGG domain protein  30 
 
 
355 aa  53.5  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0989454  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0826  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  23.98 
 
 
540 aa  53.1  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312517  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0896  DRTGG domain-containing protein  32.71 
 
 
351 aa  53.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.658378  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3243  hypothetical protein  31.9 
 
 
353 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0645555  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  29.91 
 
 
287 aa  52.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3243  CBS domain containing protein  29.35 
 
 
268 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100628  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2292  DRTGG domain protein  27.05 
 
 
355 aa  52.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  28.8 
 
 
227 aa  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1998  DRTGG  29.37 
 
 
364 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.253796  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  24.73 
 
 
879 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1588  CBS  37.5 
 
 
859 aa  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.497223  normal  0.185787 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3835  DRTGG domain protein  28.91 
 
 
356 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379504 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  24.73 
 
 
879 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1382  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.76 
 
 
489 aa  51.6  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.614319 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  27 
 
 
189 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  27 
 
 
189 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  31.13 
 
 
256 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  27 
 
 
189 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2060  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  25.15 
 
 
490 aa  51.2  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  32.63 
 
 
282 aa  51.6  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  29.47 
 
 
272 aa  50.8  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  24.39 
 
 
612 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1082  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.75 
 
 
514 aa  51.2  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1105  putative signal transduction protein with CBS domains  29.67 
 
 
268 aa  50.8  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  29.29 
 
 
219 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1033  DRTGG domain protein  25 
 
 
355 aa  50.4  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00622763  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2351  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
283 aa  50.4  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000984272  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1295  hypothetical protein  28.28 
 
 
512 aa  50.4  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.583611 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0075  DRTGG domain-containing protein  28.3 
 
 
357 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.33059  hitchhiker  0.0000000201295 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1638  DRTGG domain protein  30 
 
 
396 aa  50.1  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3046  phosphate acetyltransferase  25.19 
 
 
689 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  25.38 
 
 
413 aa  50.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2427  DRTGG domain protein  28.07 
 
 
353 aa  49.7  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.67559  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  26.92 
 
 
380 aa  49.7  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6936  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.22 
 
 
490 aa  49.7  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.294111 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  25.38 
 
 
413 aa  49.7  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05421  phosphotransacetylase domain-containing protein  28.23 
 
 
369 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13445  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  28.31 
 
 
529 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0612971  normal  0.0362546 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0296  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  30.23 
 
 
555 aa  49.3  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.079543 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  28.47 
 
 
513 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0316  DRTGG domain protein  28.44 
 
 
353 aa  49.7  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.203818 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  27.82 
 
 
145 aa  49.7  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  32.08 
 
 
513 aa  49.7  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  30.28 
 
 
513 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0348  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  23.11 
 
 
548 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1184  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  28.31 
 
 
517 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1194  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  28.31 
 
 
517 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515075  normal  0.0933798 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  28.47 
 
 
513 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>