151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0342 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0342  DRTGG domain-containing protein  100 
 
 
363 aa  718    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221378  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1866  DRTGG domain protein  73.11 
 
 
353 aa  508  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3243  hypothetical protein  64.53 
 
 
353 aa  448  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0645555  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1705  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  49.86 
 
 
354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1033  DRTGG domain protein  51.56 
 
 
355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00622763  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0242  DRTGG domain protein  47.34 
 
 
354 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0636501 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2427  DRTGG domain protein  44.01 
 
 
353 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.67559  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1641  DRTGG domain-containing protein  46.22 
 
 
354 aa  335  1e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.163018  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3751  DRTGG domain-containing protein  33.98 
 
 
353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0075  DRTGG domain-containing protein  32.23 
 
 
357 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.33059  hitchhiker  0.0000000201295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4533  DRTGG domain-containing protein  32.22 
 
 
357 aa  176  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3835  DRTGG domain protein  31.81 
 
 
356 aa  172  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379504 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2279  DRTGG domain protein  33.92 
 
 
355 aa  172  5.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0989454  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0316  DRTGG domain protein  34.84 
 
 
353 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.203818 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1638  DRTGG domain protein  34.59 
 
 
396 aa  167  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1346  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.94 
 
 
355 aa  160  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3476  DRTGG domain protein  33.43 
 
 
420 aa  159  6e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152203  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2292  DRTGG domain protein  31.56 
 
 
355 aa  157  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0863  hypothetical protein  31.51 
 
 
393 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00542873  normal  0.0353639 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1699  DRTGG domain protein  34.1 
 
 
356 aa  150  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1998  DRTGG  27.3 
 
 
364 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.253796  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2994  DRTGG domain protein  30.56 
 
 
356 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3126  DRTGG domain protein  30.56 
 
 
355 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3353  DRTGG domain protein  29.11 
 
 
358 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3303  DRTGG domain-containing protein  28.49 
 
 
371 aa  139  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0427  DRTGG domain protein  29.31 
 
 
362 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.857593 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0648  hypothetical protein  30.72 
 
 
371 aa  133  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2747  DRTGG  27.81 
 
 
357 aa  133  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0443759  normal  0.208128 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06871  phosphotransacetylase domain-containing protein  34.57 
 
 
366 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1811  phosphotransacetylase domain-containing protein  28.49 
 
 
363 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00276331  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05351  phosphotransacetylase domain-containing protein  28.22 
 
 
363 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.204674 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04791  phosphotransacetylase domain-containing protein  29.11 
 
 
363 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0896  DRTGG domain-containing protein  29.57 
 
 
351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.658378  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1711  hypothetical protein  29.48 
 
 
365 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05421  phosphotransacetylase domain-containing protein  27.93 
 
 
369 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05341  phosphotransacetylase domain-containing protein  31.47 
 
 
369 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0479  BioD-like N-terminal domain of phosphotransacetylase  30.4 
 
 
369 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05041  phosphotransacetylase domain-containing protein  30.8 
 
 
369 aa  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2082  DRTGG domain-containing protein  25.91 
 
 
349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41130  phosphate acetyltransferase  29.62 
 
 
691 aa  76.6  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735212  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3312  phosphate acetyltransferase  22.74 
 
 
720 aa  75.1  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3645  phosphate acetyltransferase  26.25 
 
 
697 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53480  phosphate acetyltransferase  26.17 
 
 
704 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014166 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1169  phosphate acetyltransferase  26.87 
 
 
696 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957465  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1007  phosphate acetyltransferase  26.87 
 
 
696 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4685  phosphate acetyltransferase  25.97 
 
 
704 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.633207  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0774  phosphate acetyltransferase  27.3 
 
 
695 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.81433  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0813  phosphate acetyltransferase  27.08 
 
 
695 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0799  phosphate acetyltransferase  27.3 
 
 
695 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.148954 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1494  phosphate acetyltransferase  23.45 
 
 
712 aa  64.3  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000825995  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2477  phosphate acetyltransferase  27.01 
 
 
715 aa  63.9  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4415  phosphate acetyltransferase  27.03 
 
 
695 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259249  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2410  phosphate acetyltransferase  23.79 
 
 
726 aa  63.5  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000273305  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3540  phosphate acetyltransferase  23.76 
 
 
712 aa  62.8  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4480  phosphate acetyltransferase  24.25 
 
 
698 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1557  phosphate acetyltransferase  26.37 
 
 
717 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.243482  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2675  phosphate acetyltransferase  22.82 
 
 
717 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000376999  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2694  phosphate acetyltransferase  22.82 
 
 
717 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000035101  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1690  phosphate acetyltransferase  22.82 
 
 
717 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000858344  normal  0.0172468 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2773  phosphate acetyltransferase  22.82 
 
 
717 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000126217  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0802  phosphate acetyltransferase  23.43 
 
 
712 aa  60.8  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1490  phosphate acetyltransferase  26.37 
 
 
717 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000130652  normal  0.921429 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1704  phosphate acetyltransferase  22.76 
 
 
713 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000601428  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2394  phosphate acetyltransferase  27.01 
 
 
712 aa  60.5  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00114366  normal  0.608278 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1668  phosphate acetyltransferase  26.44 
 
 
715 aa  60.8  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000363835  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34550  phosphate acetyltransferase  23.56 
 
 
712 aa  60.5  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2887  phosphate acetyltransferase  25.99 
 
 
713 aa  60.1  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000745761  decreased coverage  0.0000011303 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1551  phosphate acetyltransferase  25.87 
 
 
717 aa  59.7  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0542172  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2382  phosphate acetyltransferase  27.59 
 
 
717 aa  59.7  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000517206  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2916  phosphate acetyltransferase  25.87 
 
 
717 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0880  phosphate acetyltransferase  26.36 
 
 
699 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1268  CBS domain-containing protein  27.83 
 
 
432 aa  57.4  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0196  phosphate acetyltransferase  23.88 
 
 
718 aa  55.5  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.027036 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0216  phosphate acetyltransferase  23.88 
 
 
718 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1517  transcription regulator  28.1 
 
 
426 aa  53.9  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0152362  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2784  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  23.71 
 
 
377 aa  53.5  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.542112  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2543  phosphotransacetylase domain-containing protein  22.57 
 
 
363 aa  53.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4809  phosphate acetyltransferase  19.51 
 
 
701 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932009 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1132  phosphate acetyltransferase  24.4 
 
 
717 aa  53.5  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3100  phosphate acetyltransferase  26.2 
 
 
711 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2398  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  27.27 
 
 
387 aa  52.8  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000381603  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  28.57 
 
 
243 aa  52.8  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  25.23 
 
 
370 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3240  phosphate acetyltransferase  24.19 
 
 
703 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1761  DRTGG domain-containing protein  26.61 
 
 
432 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.540009  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1795  DRTGG domain-containing protein  26.61 
 
 
432 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4138  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  26.61 
 
 
370 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2640  phosphate acetyltransferase  20 
 
 
707 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.193929  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  28.37 
 
 
243 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0615  phosphate acetyltransferase  22.92 
 
 
714 aa  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3046  phosphate acetyltransferase  31.58 
 
 
689 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1616  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  21.64 
 
 
363 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0924074  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0297  phosphate acetyltransferase  22.35 
 
 
702 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.954755  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1824  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  22.6 
 
 
363 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00447956 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1048  phosphate acetyltransferase  24.04 
 
 
700 aa  51.2  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  28.17 
 
 
239 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  26.19 
 
 
244 aa  50.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2395  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  22.1 
 
 
363 aa  50.8  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0460096  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3031  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  22.39 
 
 
363 aa  50.4  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000498688  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0345  phosphate acetyltransferase  23.72 
 
 
715 aa  50.4  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00951543  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>