More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0021 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  100 
 
 
244 aa  494  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  42.42 
 
 
243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  38.57 
 
 
228 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  37.39 
 
 
242 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0823  dethiobiotin synthase  35.95 
 
 
228 aa  141  7e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  35.87 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  37.8 
 
 
240 aa  135  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4330  dithiobiotin synthetase  36.89 
 
 
228 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112465  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  36.95 
 
 
211 aa  135  5e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  35.44 
 
 
244 aa  135  8e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  36.06 
 
 
242 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  36.06 
 
 
242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  36.06 
 
 
242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  36.06 
 
 
242 aa  132  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  34.88 
 
 
243 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2946  dethiobiotin synthase  32.08 
 
 
239 aa  131  9e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00040484  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1097  dethiobiotin synthase  34.9 
 
 
190 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110147  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0820  dethiobiotin synthase  35.08 
 
 
186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.22019  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  35.1 
 
 
242 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  35.1 
 
 
242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  37.14 
 
 
241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  34.6 
 
 
241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  35.1 
 
 
242 aa  126  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  35.1 
 
 
242 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  34.58 
 
 
230 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  35.87 
 
 
212 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  33.65 
 
 
239 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0003  dethiobiotin synthase  35.08 
 
 
186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  33.97 
 
 
243 aa  125  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  35.1 
 
 
242 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  35.1 
 
 
242 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  36.82 
 
 
217 aa  125  7e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  34.11 
 
 
230 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  33.74 
 
 
242 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  32.26 
 
 
243 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  33.33 
 
 
239 aa  122  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  33.65 
 
 
228 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  33.18 
 
 
245 aa  121  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  31.48 
 
 
264 aa  121  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  33.18 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  33.65 
 
 
228 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  33.18 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3096  dethiobiotin synthase  32.55 
 
 
238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  32.7 
 
 
240 aa  118  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  32.21 
 
 
226 aa  118  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  30.43 
 
 
225 aa  118  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18711  putative dethiobiotin synthase  34.1 
 
 
216 aa  118  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  30.43 
 
 
225 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  30.43 
 
 
225 aa  116  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  31.28 
 
 
249 aa  116  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  30.92 
 
 
225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  30.43 
 
 
225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  30.92 
 
 
225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  30.92 
 
 
225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1002  dethiobiotin synthase  33.64 
 
 
216 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  30.92 
 
 
225 aa  115  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0304  dethiobiotin synthase  33.49 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  31.86 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1255  dithiobiotin synthetase  36.71 
 
 
209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.52735 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  29.95 
 
 
225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  30.77 
 
 
227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  33.04 
 
 
210 aa  111  9e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3643  dethiobiotin synthase  28.57 
 
 
236 aa  111  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  29.03 
 
 
230 aa  111  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2051  dethiobiotin synthase  33.49 
 
 
219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366532  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  31.22 
 
 
228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0036  dethiobiotin synthase  30.56 
 
 
206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  32.08 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  32.06 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1752  dethiobiotin synthase  31.05 
 
 
222 aa  109  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00909358  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2098  dithiobiotin synthetase  34.25 
 
 
209 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.250318  normal  0.47001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1568  dethiobiotin synthase  34.67 
 
 
231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248853  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4836  dithiobiotin synthetase  31.34 
 
 
226 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.519377 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15911  putative dethiobiotin synthase  32.58 
 
 
242 aa  108  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.454357  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0498  dethiobiotin synthetase  33.18 
 
 
226 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  29.86 
 
 
216 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  31.07 
 
 
226 aa  108  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  31.03 
 
 
266 aa  108  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0621  dethiobiotin synthase  31.34 
 
 
219 aa  108  9.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  31.53 
 
 
226 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  32.24 
 
 
226 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0323  dethiobiotin synthase  31.22 
 
 
227 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0117307 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5172  dithiobiotin synthetase  32.08 
 
 
226 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0206613  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4239  dithiobiotin synthetase  32.35 
 
 
212 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.528424 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2815  dithiobiotin synthetase  33.5 
 
 
212 aa  107  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  33.01 
 
 
254 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  31.53 
 
 
248 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  28.91 
 
 
238 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0030  dethiobiotin synthase  32.38 
 
 
210 aa  106  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82628  normal  0.806655 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2918  dithiobiotin synthetase  35.18 
 
 
202 aa  106  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.295464  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  30.09 
 
 
226 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1804  dethiobiotin synthase  33.99 
 
 
221 aa  105  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511205  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4343  dithiobiotin synthetase  31.25 
 
 
213 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0906504 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0366  dithiobiotin synthetase  30.56 
 
 
226 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.55843  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  29.54 
 
 
242 aa  104  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  31.13 
 
 
248 aa  104  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0392  dithiobiotin synthetase  30.56 
 
 
226 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2773  dethiobiotin synthase  29.25 
 
 
226 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0046697  hitchhiker  0.00857242 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2396  dethiobiotin synthase  31 
 
 
223 aa  103  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1722  dethiobiotin synthase  30.52 
 
 
237 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000192281  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>