168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2395 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1824  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  99.45 
 
 		 363 aa  739    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00447956 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2395  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  100 
 
 		 363 aa  740    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0460096  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2543  phosphotransacetylase domain-containing protein  75.21 
 
 		 363 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1681  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  66.94 
 
 		 363 aa  508  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.307852  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1616  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  66.67 
 
 		 363 aa  504  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0924074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4028  phosphotransacetylase domain-containing protein  62.26 
 
 		 363 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000311245  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2733  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  60.88 
 
 		 369 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3031  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  55.65 
 
 		 363 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000498688  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  58.4 
 
 		 364 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.796519  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2398  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  54.67 
 
 		 387 aa  402  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000381603  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0033  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  57.3 
 
 		 365 aa  403  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0982  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  60.5 
 
 		 364 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00173094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3278  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  60.22 
 
 		 364 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2784  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  53.85 
 
 		 377 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.542112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3473  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  53.72 
 
 		 363 aa  391  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4138  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  52.35 
 
 		 370 aa  391  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  51.8 
 
 		 370 aa  388  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_50625  predicted protein  29.8 
 
 		 495 aa  151  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48580  predicted protein  28.84 
 
 		 476 aa  143  4e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0000300421  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1472  phosphate acetyltransferase  23.45 
 
 		 699 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.253391 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3751  DRTGG domain-containing protein  21.7 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3529  phosphate acetyltransferase  24.14 
 
 		 697 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.682765  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2292  DRTGG domain protein  25.23 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0316  DRTGG domain protein  29.89 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.203818 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4533  DRTGG domain-containing protein  23.27 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0075  DRTGG domain-containing protein  24.49 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.33059  hitchhiker  0.0000000201295 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1638  DRTGG domain protein  26.09 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4809  phosphate acetyltransferase  20.42 
 
 		 701 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932009 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3353  DRTGG domain protein  21.45 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0344  phosphate acetyltransferase  22.97 
 
 		 704 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.072273  normal  0.492419 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2427  DRTGG domain protein  24.52 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.67559  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1035  phosphate acetyltransferase  23.28 
 
 		 702 aa  67.8  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0294331  normal  0.684952 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1132  phosphate acetyltransferase  22.08 
 
 		 717 aa  67.8  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  29.95 
 
 		 239 aa  67  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0643  phosphate acetyltransferase  22.28 
 
 		 699 aa  67  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.65849  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1864  phosphate acetyltransferase  20.53 
 
 		 704 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3476  phosphate acetyltransferase  20.17 
 
 		 707 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3476  DRTGG domain protein  27.08 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152203  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2640  phosphate acetyltransferase  20.17 
 
 		 707 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.193929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3835  DRTGG domain protein  17.86 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379504 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2279  DRTGG domain protein  24 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0989454  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  29.17 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3241  phosphate acetyltransferase  22.97 
 
 		 719 aa  62.8  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3243  hypothetical protein  21.33 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0645555  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1705  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  21.1 
 
 		 354 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0802  phosphate acetyltransferase  22.19 
 
 		 712 aa  62.4  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  29.41 
 
 		 239 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1048  phosphate acetyltransferase  21.41 
 
 		 700 aa  61.2  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1045  phosphate acetyltransferase  20.16 
 
 		 702 aa  60.8  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1866  DRTGG domain protein  24.53 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  23.78 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1099  hypothetical protein  29.29 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.840319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0242  DRTGG domain protein  25.52 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0636501 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0262  phosphate acetyltransferase  21.68 
 
 		 683 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1641  DRTGG domain-containing protein  20.38 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.163018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0216  phosphate acetyltransferase  24.62 
 
 		 718 aa  58.2  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0196  phosphate acetyltransferase  23.86 
 
 		 718 aa  57  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.027036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1842  dithiobiotin synthetase  25.13 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.709275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2747  DRTGG  20.28 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0443759  normal  0.208128 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  26.92 
 
 		 263 aa  57  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0643  phosphate acetyltransferase  23.99 
 
 		 687 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  28.5 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1346  cobyrinic acid ac-diamide synthase  20.94 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  27.87 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0297  phosphate acetyltransferase  21.43 
 
 		 702 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.954755  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1998  DRTGG  23.38 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.253796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3240  phosphate acetyltransferase  23.37 
 
 		 703 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3645  phosphate acetyltransferase  24.05 
 
 		 697 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  26.46 
 
 		 227 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  26.44 
 
 		 211 aa  55.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2997  phosphate acetyltransferase  21.86 
 
 		 703 aa  54.3  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.135011  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45576  predicted protein  23.2 
 
 		 490 aa  54.3  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  25.26 
 
 		 225 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1871  phosphate acetyltransferase  21.43 
 
 		 691 aa  53.9  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  28.11 
 
 		 217 aa  53.9  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  26.18 
 
 		 225 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  26.18 
 
 		 225 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  29.44 
 
 		 249 aa  53.5  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0245  dethiobiotin synthase  26.2 
 
 		 230 aa  53.5  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.67584  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  25.99 
 
 		 242 aa  53.1  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2577  phosphate acetyltransferase  20.55 
 
 		 695 aa  53.1  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.901463 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  26.55 
 
 		 243 aa  53.1  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  26.18 
 
 		 225 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  25.77 
 
 		 243 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  26.18 
 
 		 225 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11260  phosphotransacetylase  24.5 
 
 		 695 aa  52.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.182034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10413  phosphate acetyltransferase  20.14 
 
 		 690 aa  52  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  25.82 
 
 		 228 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  27.23 
 
 		 212 aa  52.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  26.18 
 
 		 225 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  26.18 
 
 		 225 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  26.18 
 
 		 225 aa  52.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  25.27 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  25.27 
 
 		 228 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  26.18 
 
 		 225 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0823  dethiobiotin synthase  26.97 
 
 		 228 aa  52  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0498  dethiobiotin synthetase  25.7 
 
 		 226 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  26.78 
 
 		 232 aa  50.8  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0342  DRTGG domain-containing protein  22.1 
 
 		 363 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221378  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0003  dethiobiotin synthase  25.81 
 
 		 186 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>