87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2733 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2733  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  100 
 
 		 369 aa  755    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  81.82 
 
 		 364 aa  599  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.796519  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4028  phosphotransacetylase domain-containing protein  67.49 
 
 		 363 aa  520  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000311245  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3031  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  64.46 
 
 		 363 aa  500  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000498688  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1824  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  60.61 
 
 		 363 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00447956 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2395  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  60.88 
 
 		 363 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0460096  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2543  phosphotransacetylase domain-containing protein  60.33 
 
 		 363 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3278  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  62.43 
 
 		 364 aa  432  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1681  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  57.02 
 
 		 363 aa  428  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.307852  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0982  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  62.71 
 
 		 364 aa  430  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00173094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1616  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  57.58 
 
 		 363 aa  430  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0924074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3473  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  53.44 
 
 		 363 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  53.97 
 
 		 370 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0033  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  57.69 
 
 		 365 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4138  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  53.42 
 
 		 370 aa  411  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2784  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  54.4 
 
 		 377 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.542112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2398  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  52.75 
 
 		 387 aa  385  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000381603  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_50625  predicted protein  27.89 
 
 		 495 aa  154  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48580  predicted protein  28.8 
 
 		 476 aa  141  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0000300421  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0316  DRTGG domain protein  25.9 
 
 		 353 aa  84.7  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.203818 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3529  phosphate acetyltransferase  25.54 
 
 		 697 aa  82  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.682765  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3751  DRTGG domain-containing protein  22.68 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0075  DRTGG domain-containing protein  21.97 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.33059  hitchhiker  0.0000000201295 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3835  DRTGG domain protein  20.49 
 
 		 356 aa  79  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379504 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4533  DRTGG domain-containing protein  21.13 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4809  phosphate acetyltransferase  21.87 
 
 		 701 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932009 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2427  DRTGG domain protein  20.94 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.67559  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1472  phosphate acetyltransferase  24.12 
 
 		 699 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.253391 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1638  DRTGG domain protein  22.56 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2292  DRTGG domain protein  22.12 
 
 		 355 aa  69.3  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4480  phosphate acetyltransferase  21.77 
 
 		 698 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1705  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  22.58 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2279  DRTGG domain protein  24.03 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0989454  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3476  DRTGG domain protein  27.81 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152203  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3240  phosphate acetyltransferase  22.19 
 
 		 703 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0242  DRTGG domain protein  21.65 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0636501 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3353  DRTGG domain protein  19.34 
 
 		 358 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1035  phosphate acetyltransferase  21.01 
 
 		 702 aa  59.3  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0294331  normal  0.684952 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3645  phosphate acetyltransferase  24.93 
 
 		 697 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1048  phosphate acetyltransferase  20 
 
 		 700 aa  57.4  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1641  DRTGG domain-containing protein  21.74 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.163018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4685  phosphate acetyltransferase  23.28 
 
 		 704 aa  57  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.633207  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53480  phosphate acetyltransferase  23.02 
 
 		 704 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3476  phosphate acetyltransferase  20.9 
 
 		 707 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2640  phosphate acetyltransferase  21.02 
 
 		 707 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.193929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2747  DRTGG  20.82 
 
 		 357 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0443759  normal  0.208128 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1132  phosphate acetyltransferase  20.65 
 
 		 717 aa  53.1  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0342  DRTGG domain-containing protein  21.24 
 
 		 363 aa  52.8  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221378  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1346  cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.19 
 
 		 355 aa  51.6  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1866  DRTGG domain protein  23.26 
 
 		 353 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41130  phosphate acetyltransferase  25.7 
 
 		 691 aa  51.2  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735212  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0774  phosphate acetyltransferase  23.93 
 
 		 695 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.81433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0799  phosphate acetyltransferase  23.1 
 
 		 695 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.148954 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1033  DRTGG domain protein  19.41 
 
 		 355 aa  51.2  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00622763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0813  phosphate acetyltransferase  22.25 
 
 		 695 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3692  phosphate acetyltransferase  21.83 
 
 		 691 aa  50.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  25.11 
 
 		 243 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1842  dithiobiotin synthetase  23.66 
 
 		 244 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.709275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3046  phosphate acetyltransferase  21.43 
 
 		 689 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1752  dethiobiotin synthase  26.51 
 
 		 222 aa  48.1  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00909358  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0802  phosphate acetyltransferase  20.21 
 
 		 712 aa  47.8  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3243  hypothetical protein  26.89 
 
 		 353 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0645555  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2577  phosphate acetyltransferase  20.44 
 
 		 695 aa  47.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.901463 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0051  phosphate acetyltransferase  21.39 
 
 		 703 aa  47  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.833181 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0857  phosphate acetyltransferase  23.48 
 
 		 699 aa  47  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.816812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4415  phosphate acetyltransferase  21.7 
 
 		 695 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  21.51 
 
 		 227 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4072  phosphate acetyltransferase  22.02 
 
 		 689 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1007  phosphate acetyltransferase  22.69 
 
 		 696 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  20.93 
 
 		 243 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  22.28 
 
 		 240 aa  45.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  26.92 
 
 		 243 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  24.46 
 
 		 228 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0863  hypothetical protein  19.57 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00542873  normal  0.0353639 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0880  phosphate acetyltransferase  22.44 
 
 		 699 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0245  dethiobiotin synthase  23.78 
 
 		 230 aa  45.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.67584  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1998  DRTGG  21.33 
 
 		 364 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.253796  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0498  dethiobiotin synthetase  23.42 
 
 		 226 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0262  phosphate acetyltransferase  21.62 
 
 		 683 aa  44.3  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  24.05 
 
 		 226 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  24.62 
 
 		 239 aa  44.3  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  24.62 
 
 		 239 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1220  phosphate acetyltransferase  22.19 
 
 		 685 aa  43.9  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.415624  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  27.73 
 
 		 241 aa  43.5  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  22.94 
 
 		 264 aa  43.5  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  22.33 
 
 		 646 aa  43.1  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0297  phosphate acetyltransferase  20.56 
 
 		 702 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.954755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>