175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0982 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0982  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  100 
 
 		 364 aa  742    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00173094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3278  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  98.63 
 
 		 364 aa  734    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4028  phosphotransacetylase domain-containing protein  67.96 
 
 		 363 aa  503  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000311245  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3031  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  62.71 
 
 		 363 aa  475  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000498688  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2733  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  62.71 
 
 		 369 aa  448  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1824  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  60.77 
 
 		 363 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00447956 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2395  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  60.5 
 
 		 363 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0460096  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1681  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  59.39 
 
 		 363 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.307852  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2543  phosphotransacetylase domain-containing protein  60.5 
 
 		 363 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1616  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  57.73 
 
 		 363 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0924074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  60.5 
 
 		 364 aa  422  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.796519  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3473  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  56.91 
 
 		 363 aa  423  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0033  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  61.05 
 
 		 365 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2784  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  56.47 
 
 		 377 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.542112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2398  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  52.89 
 
 		 387 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000381603  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4138  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  52.63 
 
 		 370 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  52.63 
 
 		 370 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48580  predicted protein  30.83 
 
 		 476 aa  158  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0000300421  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_50625  predicted protein  28.57 
 
 		 495 aa  155  9e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2292  DRTGG domain protein  25.67 
 
 		 355 aa  86.7  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0316  DRTGG domain protein  29.65 
 
 		 353 aa  84  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.203818 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1638  DRTGG domain protein  25.68 
 
 		 396 aa  82.8  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3835  DRTGG domain protein  24.38 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379504 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1864  phosphate acetyltransferase  24.23 
 
 		 704 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0344  phosphate acetyltransferase  24.24 
 
 		 704 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.072273  normal  0.492419 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2427  DRTGG domain protein  26.34 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.67559  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1705  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  26.59 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1035  phosphate acetyltransferase  24.59 
 
 		 702 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0294331  normal  0.684952 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3751  DRTGG domain-containing protein  25.2 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2279  DRTGG domain protein  21.86 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0989454  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3241  phosphate acetyltransferase  23.9 
 
 		 719 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1132  phosphate acetyltransferase  24.39 
 
 		 717 aa  74.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3529  phosphate acetyltransferase  25.54 
 
 		 697 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.682765  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4480  phosphate acetyltransferase  23.88 
 
 		 698 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1472  phosphate acetyltransferase  23.62 
 
 		 699 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.253391 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4809  phosphate acetyltransferase  22.25 
 
 		 701 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932009 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0802  phosphate acetyltransferase  22.54 
 
 		 712 aa  73.9  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4533  DRTGG domain-containing protein  23.67 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0242  DRTGG domain protein  24.21 
 
 		 354 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0636501 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0075  DRTGG domain-containing protein  24.08 
 
 		 357 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.33059  hitchhiker  0.0000000201295 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1641  DRTGG domain-containing protein  23.81 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.163018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002967  phosphate acetyltransferase  22.03 
 
 		 714 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.596051  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3476  phosphate acetyltransferase  21.68 
 
 		 707 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0297  phosphate acetyltransferase  23.33 
 
 		 702 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.954755  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28500  phosphotransacetylase  25.07 
 
 		 731 aa  67.4  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.157422 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2640  phosphate acetyltransferase  21.04 
 
 		 707 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.193929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01780  phosphate acetyltransferase  21.68 
 
 		 691 aa  67  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1871  phosphate acetyltransferase  24.52 
 
 		 691 aa  64.3  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2997  phosphate acetyltransferase  25.55 
 
 		 703 aa  64.3  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.135011  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3476  DRTGG domain protein  23.39 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152203  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1048  phosphate acetyltransferase  21.6 
 
 		 700 aa  63.9  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3240  phosphate acetyltransferase  24.84 
 
 		 703 aa  63.2  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3645  phosphate acetyltransferase  27 
 
 		 697 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1007  phosphate acetyltransferase  25.99 
 
 		 696 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1045  phosphate acetyltransferase  21.16 
 
 		 702 aa  61.6  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  29.57 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0774  phosphate acetyltransferase  25 
 
 		 695 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.81433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0579  phosphate acetyltransferase  24.67 
 
 		 697 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0799  phosphate acetyltransferase  25 
 
 		 695 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.148954 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2577  phosphate acetyltransferase  22.85 
 
 		 695 aa  60.5  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.901463 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02943  phosphate acetyltransferase  21.23 
 
 		 716 aa  60.8  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3048  phosphate acetyltransferase  22.43 
 
 		 701 aa  59.7  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0392547 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0051  phosphate acetyltransferase  23.86 
 
 		 703 aa  59.7  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.833181 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0643  phosphate acetyltransferase  23.41 
 
 		 699 aa  58.9  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.65849  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41130  phosphate acetyltransferase  25.9 
 
 		 691 aa  59.3  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735212  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0813  phosphate acetyltransferase  25 
 
 		 695 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1169  phosphate acetyltransferase  25 
 
 		 696 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957465  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1998  DRTGG  24.26 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.253796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0880  phosphate acetyltransferase  24.34 
 
 		 699 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0262  phosphate acetyltransferase  23.74 
 
 		 683 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53480  phosphate acetyltransferase  22.93 
 
 		 704 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1220  phosphate acetyltransferase  23.01 
 
 		 685 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.415624  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0615  phosphate acetyltransferase  21.92 
 
 		 714 aa  58.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45576  predicted protein  26.42 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4415  phosphate acetyltransferase  25.58 
 
 		 695 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1033  DRTGG domain protein  23.08 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00622763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0896  DRTGG domain-containing protein  22.07 
 
 		 351 aa  57  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.658378  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0693  phosphate acetyltransferase  22.25 
 
 		 699 aa  57  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.206034  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3243  hypothetical protein  27.12 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0645555  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  27.5 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  28.65 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  28.65 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0196  phosphate acetyltransferase  21.91 
 
 		 718 aa  56.2  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.027036 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34550  phosphate acetyltransferase  25.58 
 
 		 712 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2747  DRTGG  20.67 
 
 		 357 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0443759  normal  0.208128 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2954  phosphate acetyltransferase  21.17 
 
 		 696 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0245  dethiobiotin synthase  28.12 
 
 		 230 aa  55.1  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.67584  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0216  phosphate acetyltransferase  22.11 
 
 		 718 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2591  phosphate acetyltransferase  21.7 
 
 		 714 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.171095  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  30.26 
 
 		 212 aa  55.5  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4685  phosphate acetyltransferase  22.4 
 
 		 704 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.633207  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  25.13 
 
 		 240 aa  55.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3643  dethiobiotin synthase  23.53 
 
 		 236 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0643  phosphate acetyltransferase  22.51 
 
 		 687 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2113  phosphate acetyltransferase  21.29 
 
 		 723 aa  53.5  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.330408  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  22.58 
 
 		 227 aa  53.1  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  27.23 
 
 		 240 aa  53.1  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  22.56 
 
 		 232 aa  53.1  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3353  DRTGG domain protein  19.44 
 
 		 358 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  24.6 
 
 		 240 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>