259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4138 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_4138  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  100 
 
 		 370 aa  744    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  97.57 
 
 		 370 aa  732    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2784  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  74.53 
 
 		 377 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.542112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4028  phosphotransacetylase domain-containing protein  58.45 
 
 		 363 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000311245  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2398  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  55.49 
 
 		 387 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000381603  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3031  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  53.57 
 
 		 363 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000498688  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2543  phosphotransacetylase domain-containing protein  53.85 
 
 		 363 aa  403  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1616  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  51.65 
 
 		 363 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0924074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1824  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  52.63 
 
 		 363 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00447956 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  55.19 
 
 		 364 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.796519  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1681  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  52.91 
 
 		 363 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.307852  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2395  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  52.35 
 
 		 363 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0460096  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2733  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  53.42 
 
 		 369 aa  388  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3473  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  51.1 
 
 		 363 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0033  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  53.53 
 
 		 365 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3278  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  53.19 
 
 		 364 aa  349  5e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0982  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  52.63 
 
 		 364 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00173094  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48580  predicted protein  31.82 
 
 		 476 aa  160  4e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0000300421  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_50625  predicted protein  28.32 
 
 		 495 aa  145  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2292  DRTGG domain protein  30.04 
 
 		 355 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0316  DRTGG domain protein  32.33 
 
 		 353 aa  100  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.203818 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3476  DRTGG domain protein  32.96 
 
 		 420 aa  93.2  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152203  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2279  DRTGG domain protein  27.5 
 
 		 355 aa  92.8  9e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0989454  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1638  DRTGG domain protein  30.68 
 
 		 396 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3240  phosphate acetyltransferase  25.68 
 
 		 703 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4533  DRTGG domain-containing protein  27.14 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3529  phosphate acetyltransferase  24.35 
 
 		 697 aa  83.6  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.682765  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1472  phosphate acetyltransferase  23.82 
 
 		 699 aa  83.2  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.253391 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4809  phosphate acetyltransferase  20.79 
 
 		 701 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932009 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3835  DRTGG domain protein  25.82 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379504 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3476  phosphate acetyltransferase  22.79 
 
 		 707 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2640  phosphate acetyltransferase  22.45 
 
 		 707 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.193929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0075  DRTGG domain-containing protein  26.43 
 
 		 357 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.33059  hitchhiker  0.0000000201295 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2427  DRTGG domain protein  26.19 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.67559  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1132  phosphate acetyltransferase  24.03 
 
 		 717 aa  76.3  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4480  phosphate acetyltransferase  21.01 
 
 		 698 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28500  phosphotransacetylase  25.66 
 
 		 731 aa  70.1  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.157422 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3046  phosphate acetyltransferase  22.79 
 
 		 689 aa  70.1  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1871  phosphate acetyltransferase  23.01 
 
 		 691 aa  69.3  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1705  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  23.75 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0643  phosphate acetyltransferase  25.13 
 
 		 699 aa  68.6  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.65849  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1035  phosphate acetyltransferase  23.74 
 
 		 702 aa  67.8  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0294331  normal  0.684952 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0242  DRTGG domain protein  31.03 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0636501 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1641  DRTGG domain-containing protein  31.03 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.163018  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0774  phosphate acetyltransferase  27.52 
 
 		 695 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.81433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0813  phosphate acetyltransferase  27.52 
 
 		 695 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3645  phosphate acetyltransferase  25.95 
 
 		 697 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0196  phosphate acetyltransferase  23.88 
 
 		 718 aa  65.9  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.027036 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1048  phosphate acetyltransferase  22.14 
 
 		 700 aa  65.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1346  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.73 
 
 		 355 aa  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0799  phosphate acetyltransferase  26.6 
 
 		 695 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.148954 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01780  phosphate acetyltransferase  25.52 
 
 		 691 aa  65.1  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3751  DRTGG domain-containing protein  22.29 
 
 		 353 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  27.63 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1033  DRTGG domain protein  22.87 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00622763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41130  phosphate acetyltransferase  27.6 
 
 		 691 aa  63.9  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735212  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0880  phosphate acetyltransferase  25.45 
 
 		 699 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1045  phosphate acetyltransferase  19.42 
 
 		 702 aa  63.9  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0802  phosphate acetyltransferase  19.9 
 
 		 712 aa  63.5  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2577  phosphate acetyltransferase  24.83 
 
 		 695 aa  62.4  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.901463 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0693  phosphate acetyltransferase  23.2 
 
 		 699 aa  61.6  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.206034  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4685  phosphate acetyltransferase  24.92 
 
 		 704 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.633207  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1864  phosphate acetyltransferase  21.99 
 
 		 704 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  28.73 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4415  phosphate acetyltransferase  25.76 
 
 		 695 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0216  phosphate acetyltransferase  22.89 
 
 		 718 aa  60.8  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53480  phosphate acetyltransferase  24.92 
 
 		 704 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014166 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  28.02 
 
 		 506 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1007  phosphate acetyltransferase  26.26 
 
 		 696 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  28.02 
 
 		 506 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0863  hypothetical protein  22.1 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00542873  normal  0.0353639 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  30.6 
 
 		 243 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  28.02 
 
 		 506 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1099  hypothetical protein  28.79 
 
 		 277 aa  59.3  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.840319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  27.78 
 
 		 239 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1169  phosphate acetyltransferase  25.7 
 
 		 696 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957465  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3241  phosphate acetyltransferase  22.22 
 
 		 719 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1866  DRTGG domain protein  25.1 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  28.02 
 
 		 513 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3048  phosphate acetyltransferase  23.24 
 
 		 701 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0392547 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  28.02 
 
 		 506 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  30.9 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2451  cobyric acid synthase  30.43 
 
 		 504 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0760496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3762  phosphate acetyltransferase  22.56 
 
 		 709 aa  57  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  27.22 
 
 		 239 aa  57  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2997  phosphate acetyltransferase  25.35 
 
 		 703 aa  56.2  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.135011  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2560  phosphate acetyltransferase  23.66 
 
 		 713 aa  55.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00240878  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5777  cobyric acid synthase  30.87 
 
 		 511 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  24.93 
 
 		 481 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2494  cobyric acid synthase  30 
 
 		 500 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123831  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0344  phosphate acetyltransferase  22.96 
 
 		 704 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.072273  normal  0.492419 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2362  cobyric acid synthase  30 
 
 		 500 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  28.63 
 
 		 517 aa  54.7  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1842  dithiobiotin synthetase  23.71 
 
 		 244 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.709275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3243  hypothetical protein  25.42 
 
 		 353 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0645555  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2747  DRTGG  22.04 
 
 		 357 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0443759  normal  0.208128 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0205  phosphate acetyltransferase  22.3 
 
 		 707 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0580706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  27.32 
 
 		 513 aa  53.9  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  27.44 
 
 		 243 aa  53.1  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  29.91 
 
 		 504 aa  53.1  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>