154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1641 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1705  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  86.72 
 
 		 354 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1641  DRTGG domain-containing protein  100 
 
 		 354 aa  715    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.163018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0242  DRTGG domain protein  93.79 
 
 		 354 aa  679    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0636501 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2427  DRTGG domain protein  73.5 
 
 		 353 aa  543  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.67559  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1033  DRTGG domain protein  63.07 
 
 		 355 aa  461  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00622763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1866  DRTGG domain protein  49.43 
 
 		 353 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3243  hypothetical protein  47.44 
 
 		 353 aa  364  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0645555  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0342  DRTGG domain-containing protein  46.22 
 
 		 363 aa  335  1e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221378  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3835  DRTGG domain protein  35.98 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379504 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3751  DRTGG domain-containing protein  35.13 
 
 		 353 aa  235  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0075  DRTGG domain-containing protein  33.99 
 
 		 357 aa  230  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.33059  hitchhiker  0.0000000201295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4533  DRTGG domain-containing protein  34.28 
 
 		 357 aa  226  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1346  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.43 
 
 		 355 aa  205  9e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1998  DRTGG  31.46 
 
 		 364 aa  203  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.253796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0863  hypothetical protein  32.21 
 
 		 393 aa  203  4e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00542873  normal  0.0353639 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3353  DRTGG domain protein  30.77 
 
 		 358 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0427  DRTGG domain protein  32.17 
 
 		 362 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.857593 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3303  DRTGG domain-containing protein  31.11 
 
 		 371 aa  186  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2994  DRTGG domain protein  31.59 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3126  DRTGG domain protein  31.59 
 
 		 355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2747  DRTGG  29.86 
 
 		 357 aa  179  7e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0443759  normal  0.208128 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2279  DRTGG domain protein  28.24 
 
 		 355 aa  178  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0989454  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2292  DRTGG domain protein  29.39 
 
 		 355 aa  176  7e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04791  phosphotransacetylase domain-containing protein  30.68 
 
 		 363 aa  175  9e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0896  DRTGG domain-containing protein  30.31 
 
 		 351 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.658378  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0316  DRTGG domain protein  29.77 
 
 		 353 aa  168  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.203818 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1711  hypothetical protein  27.49 
 
 		 365 aa  164  3e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1699  DRTGG domain protein  30.34 
 
 		 356 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06871  phosphotransacetylase domain-containing protein  27.88 
 
 		 366 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3476  DRTGG domain protein  28.29 
 
 		 420 aa  160  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152203  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0648  hypothetical protein  27.87 
 
 		 371 aa  159  5e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1638  DRTGG domain protein  28.91 
 
 		 396 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0479  BioD-like N-terminal domain of phosphotransacetylase  29 
 
 		 369 aa  153  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05351  phosphotransacetylase domain-containing protein  27.95 
 
 		 363 aa  152  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.204674 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1811  phosphotransacetylase domain-containing protein  27.37 
 
 		 363 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00276331  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05421  phosphotransacetylase domain-containing protein  27.62 
 
 		 369 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2082  DRTGG domain-containing protein  25.71 
 
 		 349 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05341  phosphotransacetylase domain-containing protein  28.93 
 
 		 369 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05041  phosphotransacetylase domain-containing protein  27.91 
 
 		 369 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4480  phosphate acetyltransferase  23.22 
 
 		 698 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3046  phosphate acetyltransferase  24.56 
 
 		 689 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3529  phosphate acetyltransferase  25.07 
 
 		 697 aa  76.6  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.682765  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1035  phosphate acetyltransferase  21.29 
 
 		 702 aa  75.5  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0294331  normal  0.684952 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1864  phosphate acetyltransferase  21.92 
 
 		 704 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53480  phosphate acetyltransferase  23.67 
 
 		 704 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014166 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1132  phosphate acetyltransferase  22.4 
 
 		 717 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4685  phosphate acetyltransferase  23.4 
 
 		 704 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.633207  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2640  phosphate acetyltransferase  20.89 
 
 		 707 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.193929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01780  phosphate acetyltransferase  24.7 
 
 		 691 aa  70.9  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3240  phosphate acetyltransferase  23.67 
 
 		 703 aa  69.7  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1048  phosphate acetyltransferase  22.35 
 
 		 700 aa  69.7  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3476  phosphate acetyltransferase  21.64 
 
 		 707 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3312  phosphate acetyltransferase  20.41 
 
 		 720 aa  68.6  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0344  phosphate acetyltransferase  21.76 
 
 		 704 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.072273  normal  0.492419 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2543  phosphotransacetylase domain-containing protein  21.04 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0813  phosphate acetyltransferase  23.64 
 
 		 695 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  31.03 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4138  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  31.03 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4809  phosphate acetyltransferase  20.43 
 
 		 701 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932009 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0774  phosphate acetyltransferase  23.37 
 
 		 695 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.81433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1007  phosphate acetyltransferase  24.39 
 
 		 696 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3241  phosphate acetyltransferase  22.06 
 
 		 719 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1472  phosphate acetyltransferase  24.2 
 
 		 699 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.253391 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10413  phosphate acetyltransferase  25.3 
 
 		 690 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4415  phosphate acetyltransferase  23.64 
 
 		 695 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0799  phosphate acetyltransferase  23.37 
 
 		 695 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.148954 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3645  phosphate acetyltransferase  22.19 
 
 		 697 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3540  phosphate acetyltransferase  26.44 
 
 		 712 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0262  phosphate acetyltransferase  23.05 
 
 		 683 aa  63.2  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1169  phosphate acetyltransferase  23.85 
 
 		 696 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957465  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41130  phosphate acetyltransferase  22.28 
 
 		 691 aa  62.4  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735212  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_50625  predicted protein  24.37 
 
 		 495 aa  62.4  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0693  phosphate acetyltransferase  23.71 
 
 		 699 aa  62  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.206034  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48580  predicted protein  23.28 
 
 		 476 aa  62  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0000300421  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0880  phosphate acetyltransferase  22.83 
 
 		 699 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1517  transcription regulator  27.61 
 
 		 426 aa  62  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0152362  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2784  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  22.22 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.542112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  27.09 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1681  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  21.24 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.307852  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0537  phosphate acetyltransferase  23.82 
 
 		 704 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0549  phosphate acetyltransferase  23.82 
 
 		 704 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0527  phosphate acetyltransferase  23.82 
 
 		 704 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0297  phosphate acetyltransferase  21.16 
 
 		 702 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.954755  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0643  phosphate acetyltransferase  22.33 
 
 		 687 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0051  phosphate acetyltransferase  21.89 
 
 		 703 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.833181 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1824  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  20.38 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00447956 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2395  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  20.38 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0460096  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2477  phosphate acetyltransferase  21.73 
 
 		 715 aa  57.8  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1871  phosphate acetyltransferase  20.78 
 
 		 691 aa  57.4  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1616  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  20.05 
 
 		 363 aa  57  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0924074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3473  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  24.83 
 
 		 363 aa  57  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  22.87 
 
 		 244 aa  57  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2887  phosphate acetyltransferase  24.4 
 
 		 713 aa  57  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000745761  decreased coverage  0.0000011303 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3278  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  25.12 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0982  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  25.59 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00173094  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2577  phosphate acetyltransferase  26.2 
 
 		 695 aa  56.6  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.901463 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3031  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  19.24 
 
 		 363 aa  56.2  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000498688  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34550  phosphate acetyltransferase  21.47 
 
 		 712 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  26.19 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1668  phosphate acetyltransferase  24.1 
 
 		 715 aa  55.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000363835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>