226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2784 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2784  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  100 
 
 		 377 aa  764    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.542112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4138  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  74.53 
 
 		 370 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  73.44 
 
 		 370 aa  557  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4028  phosphotransacetylase domain-containing protein  57.14 
 
 		 363 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000311245  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2398  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  55.22 
 
 		 387 aa  423  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000381603  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2543  phosphotransacetylase domain-containing protein  56.32 
 
 		 363 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0033  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  57.26 
 
 		 365 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3031  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  54.12 
 
 		 363 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000498688  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1616  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  53.57 
 
 		 363 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0924074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1824  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  54.12 
 
 		 363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00447956 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1681  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  54.4 
 
 		 363 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.307852  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2395  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  53.85 
 
 		 363 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0460096  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  57.14 
 
 		 364 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.796519  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2733  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  54.4 
 
 		 369 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3278  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  57.02 
 
 		 364 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0982  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  56.47 
 
 		 364 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00173094  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3473  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  52.75 
 
 		 363 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48580  predicted protein  31.91 
 
 		 476 aa  161  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0000300421  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_50625  predicted protein  32.08 
 
 		 495 aa  144  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2292  DRTGG domain protein  25.62 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1472  phosphate acetyltransferase  24.53 
 
 		 699 aa  97.8  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.253391 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4809  phosphate acetyltransferase  23.04 
 
 		 701 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932009 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3240  phosphate acetyltransferase  26.29 
 
 		 703 aa  96.7  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0316  DRTGG domain protein  32.42 
 
 		 353 aa  92  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.203818 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1638  DRTGG domain protein  27.73 
 
 		 396 aa  92.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2279  DRTGG domain protein  25 
 
 		 355 aa  90.9  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0989454  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4533  DRTGG domain-containing protein  25.21 
 
 		 357 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0075  DRTGG domain-containing protein  25.82 
 
 		 357 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.33059  hitchhiker  0.0000000201295 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1035  phosphate acetyltransferase  23.31 
 
 		 702 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0294331  normal  0.684952 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3835  DRTGG domain protein  22.55 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379504 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3476  DRTGG domain protein  31.94 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152203  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28500  phosphotransacetylase  26.52 
 
 		 731 aa  80.9  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.157422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3476  phosphate acetyltransferase  21.88 
 
 		 707 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2640  phosphate acetyltransferase  21.59 
 
 		 707 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.193929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2427  DRTGG domain protein  23.37 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.67559  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3529  phosphate acetyltransferase  23.72 
 
 		 697 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.682765  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3046  phosphate acetyltransferase  24.18 
 
 		 689 aa  77  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4480  phosphate acetyltransferase  23.68 
 
 		 698 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01780  phosphate acetyltransferase  24.19 
 
 		 691 aa  75.5  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2577  phosphate acetyltransferase  26.28 
 
 		 695 aa  73.6  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.901463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3751  DRTGG domain-containing protein  22.7 
 
 		 353 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1045  phosphate acetyltransferase  21.9 
 
 		 702 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0643  phosphate acetyltransferase  24.67 
 
 		 699 aa  70.9  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.65849  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1871  phosphate acetyltransferase  21.61 
 
 		 691 aa  69.3  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1864  phosphate acetyltransferase  22.79 
 
 		 704 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1048  phosphate acetyltransferase  20.97 
 
 		 700 aa  68.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1705  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  22.67 
 
 		 354 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3241  phosphate acetyltransferase  22.7 
 
 		 719 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3353  DRTGG domain protein  24.18 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0196  phosphate acetyltransferase  24.18 
 
 		 718 aa  67.8  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.027036 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1998  DRTGG  22.19 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.253796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0863  hypothetical protein  23.2 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00542873  normal  0.0353639 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1132  phosphate acetyltransferase  23.64 
 
 		 717 aa  68.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1866  DRTGG domain protein  25 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0344  phosphate acetyltransferase  23.53 
 
 		 704 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.072273  normal  0.492419 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0297  phosphate acetyltransferase  23.64 
 
 		 702 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.954755  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3762  phosphate acetyltransferase  24.24 
 
 		 709 aa  63.5  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11260  phosphotransacetylase  25.77 
 
 		 695 aa  63.2  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.182034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2997  phosphate acetyltransferase  27.08 
 
 		 703 aa  63.2  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.135011  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0216  phosphate acetyltransferase  23.43 
 
 		 718 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0802  phosphate acetyltransferase  21.84 
 
 		 712 aa  60.8  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1346  cobyrinic acid ac-diamide synthase  20.55 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0242  DRTGG domain protein  26.71 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0636501 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10413  phosphate acetyltransferase  23.08 
 
 		 690 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1641  DRTGG domain-containing protein  28.08 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.163018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  29 
 
 		 517 aa  57.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0537  phosphate acetyltransferase  23.71 
 
 		 704 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0549  phosphate acetyltransferase  23.71 
 
 		 704 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1033  DRTGG domain protein  23.02 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00622763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0527  phosphate acetyltransferase  23.71 
 
 		 704 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0205  phosphate acetyltransferase  22.26 
 
 		 707 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0580706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0896  DRTGG domain-containing protein  23.45 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.658378  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3243  hypothetical protein  28.81 
 
 		 353 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0645555  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0693  phosphate acetyltransferase  22.28 
 
 		 699 aa  56.6  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.206034  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  28.05 
 
 		 239 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08770  phosphotransacetylase  25.45 
 
 		 691 aa  55.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2747  DRTGG  20.27 
 
 		 357 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0443759  normal  0.208128 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4398  phosphate acetyltransferase  24.24 
 
 		 706 aa  56.2  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0579  phosphate acetyltransferase  25.08 
 
 		 697 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0427  DRTGG domain protein  21.61 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.857593 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2954  phosphate acetyltransferase  23.53 
 
 		 696 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  24.46 
 
 		 264 aa  55.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1842  dithiobiotin synthetase  25.13 
 
 		 244 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.709275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4072  phosphate acetyltransferase  24.91 
 
 		 689 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  26.37 
 
 		 506 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1099  hypothetical protein  29.44 
 
 		 277 aa  54.3  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.840319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  26.37 
 
 		 506 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0813  phosphate acetyltransferase  24.49 
 
 		 695 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  26.37 
 
 		 506 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0774  phosphate acetyltransferase  24.49 
 
 		 695 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.81433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0342  DRTGG domain-containing protein  23.72 
 
 		 363 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221378  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  25.25 
 
 		 513 aa  53.5  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1699  DRTGG domain protein  23.86 
 
 		 356 aa  53.9  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0799  phosphate acetyltransferase  25.08 
 
 		 695 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.148954 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  27.66 
 
 		 239 aa  53.1  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3645  phosphate acetyltransferase  24.33 
 
 		 697 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  26.37 
 
 		 513 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  23.58 
 
 		 243 aa  53.1  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4685  phosphate acetyltransferase  22.28 
 
 		 704 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.633207  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53480  phosphate acetyltransferase  22.28 
 
 		 704 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>