127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2398 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2398  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  100 
 
 
387 aa  791    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000381603  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1616  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  56.32 
 
 
363 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0924074  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4138  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  55.49 
 
 
370 aa  421  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  54.95 
 
 
370 aa  419  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1681  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  55.22 
 
 
363 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.307852  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2784  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  55.22 
 
 
377 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.542112  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2543  phosphotransacetylase domain-containing protein  54.4 
 
 
363 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2395  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  54.67 
 
 
363 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0460096  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1824  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  54.95 
 
 
363 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00447956 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4028  phosphotransacetylase domain-containing protein  54.12 
 
 
363 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000311245  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3031  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  53.57 
 
 
363 aa  391  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000498688  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3473  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  50.82 
 
 
363 aa  378  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2733  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  52.75 
 
 
369 aa  363  3e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0033  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  52.2 
 
 
365 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3278  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  53.44 
 
 
364 aa  356  5e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0982  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  52.89 
 
 
364 aa  351  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00173094  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  51.1 
 
 
364 aa  349  4e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.796519  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_50625  predicted protein  29.9 
 
 
495 aa  152  8.999999999999999e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48580  predicted protein  29.89 
 
 
476 aa  139  8.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0000300421  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3476  DRTGG domain protein  34.04 
 
 
420 aa  92.8  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152203  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2292  DRTGG domain protein  26.47 
 
 
355 aa  92  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1472  phosphate acetyltransferase  23.32 
 
 
699 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.253391 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1638  DRTGG domain protein  31.41 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0316  DRTGG domain protein  32.64 
 
 
353 aa  81.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.203818 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0075  DRTGG domain-containing protein  27.87 
 
 
357 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.33059  hitchhiker  0.0000000201295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4533  DRTGG domain-containing protein  26.72 
 
 
357 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2279  DRTGG domain protein  25.69 
 
 
355 aa  70.9  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0989454  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3240  phosphate acetyltransferase  25.99 
 
 
703 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3835  DRTGG domain protein  23.59 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379504 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1871  phosphate acetyltransferase  24.59 
 
 
691 aa  69.3  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2427  DRTGG domain protein  22.74 
 
 
353 aa  66.2  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.67559  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3241  phosphate acetyltransferase  23.66 
 
 
719 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2640  phosphate acetyltransferase  20.55 
 
 
707 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.193929  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3243  hypothetical protein  32.19 
 
 
353 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0645555  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  26.47 
 
 
264 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3476  phosphate acetyltransferase  21.1 
 
 
707 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3751  DRTGG domain-containing protein  22.4 
 
 
353 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4480  phosphate acetyltransferase  21.55 
 
 
698 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1035  phosphate acetyltransferase  21.19 
 
 
702 aa  60.8  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0294331  normal  0.684952 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4809  phosphate acetyltransferase  20.11 
 
 
701 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932009 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28500  phosphotransacetylase  24.93 
 
 
731 aa  60.1  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.157422 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3046  phosphate acetyltransferase  24.29 
 
 
689 aa  60.1  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3529  phosphate acetyltransferase  21.41 
 
 
697 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.682765  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0216  phosphate acetyltransferase  22.78 
 
 
718 aa  57.8  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  26.37 
 
 
242 aa  57.4  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1033  DRTGG domain protein  28.45 
 
 
355 aa  57  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00622763  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1048  phosphate acetyltransferase  21.25 
 
 
700 aa  57  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0196  phosphate acetyltransferase  22.28 
 
 
718 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.027036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1842  dithiobiotin synthetase  24.32 
 
 
244 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.709275  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4685  phosphate acetyltransferase  21.66 
 
 
704 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.633207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  29.17 
 
 
243 aa  54.7  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0643  phosphate acetyltransferase  22.67 
 
 
699 aa  54.7  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.65849  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1866  DRTGG domain protein  27.46 
 
 
353 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2577  phosphate acetyltransferase  22.77 
 
 
695 aa  53.5  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.901463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3353  DRTGG domain protein  21.25 
 
 
358 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0242  DRTGG domain protein  29.31 
 
 
354 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0636501 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1346  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.33 
 
 
355 aa  53.1  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1132  phosphate acetyltransferase  22.7 
 
 
717 aa  53.1  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0342  DRTGG domain-containing protein  27.27 
 
 
363 aa  52.8  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221378  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53480  phosphate acetyltransferase  21.12 
 
 
704 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014166 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  28.11 
 
 
226 aa  52.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3762  phosphate acetyltransferase  22.1 
 
 
709 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3645  phosphate acetyltransferase  23.41 
 
 
697 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  30.49 
 
 
233 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1220  phosphate acetyltransferase  20.63 
 
 
685 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.415624  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11260  phosphotransacetylase  22.63 
 
 
695 aa  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.182034  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1864  phosphate acetyltransferase  19.67 
 
 
704 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0863  hypothetical protein  20.98 
 
 
393 aa  50.8  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00542873  normal  0.0353639 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0643  phosphate acetyltransferase  26.95 
 
 
687 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  25.93 
 
 
239 aa  50.1  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  25.93 
 
 
239 aa  50.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1705  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  26.09 
 
 
354 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1641  DRTGG domain-containing protein  26.96 
 
 
354 aa  49.7  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.163018  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0693  phosphate acetyltransferase  21.76 
 
 
699 aa  50.1  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.206034  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2997  phosphate acetyltransferase  23.83 
 
 
703 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.135011  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0802  phosphate acetyltransferase  20.05 
 
 
712 aa  48.9  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0813  phosphate acetyltransferase  23.26 
 
 
695 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0774  phosphate acetyltransferase  23.43 
 
 
695 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.81433  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0799  phosphate acetyltransferase  24.59 
 
 
695 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.148954 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0823  dethiobiotin synthase  21.71 
 
 
228 aa  48.5  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4370  dethiobiotin synthase  22.33 
 
 
225 aa  48.9  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.497713  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  29.55 
 
 
230 aa  48.5  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1998  DRTGG  22.75 
 
 
364 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.253796  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  28.3 
 
 
232 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  26.82 
 
 
212 aa  47.8  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  26.21 
 
 
243 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1640  dethiobiotin synthase  30 
 
 
224 aa  47.4  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.915447  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2310  phosphate acetyltransferase  22.55 
 
 
699 aa  47.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3643  dethiobiotin synthase  28.82 
 
 
236 aa  47.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1007  phosphate acetyltransferase  25.33 
 
 
696 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0344  phosphate acetyltransferase  21.22 
 
 
704 aa  47  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.072273  normal  0.492419 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  24.48 
 
 
227 aa  47  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1169  phosphate acetyltransferase  25.08 
 
 
696 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957465  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6277  dithiobiotin synthetase  32 
 
 
239 aa  46.6  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  25 
 
 
263 aa  46.6  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0648  hypothetical protein  23.4 
 
 
371 aa  46.2  0.0009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0857  phosphate acetyltransferase  24.74 
 
 
699 aa  46.2  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.816812  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  25.65 
 
 
243 aa  46.2  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0880  phosphate acetyltransferase  24.09 
 
 
699 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  27.43 
 
 
211 aa  45.8  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>