More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1640 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1640  dethiobiotin synthase  100 
 
 		 224 aa  454  1e-127  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.915447  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0460  dethiobiotin synthase  41.86 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00232018  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  39.39 
 
 		 217 aa  102  7e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  34.39 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3711  dethiobiotin synthase  35.84 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00204232  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2053  dithiobiotin synthetase  36.9 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0534973 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  30.24 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0682  dethiobiotin synthase  35.33 
 
 		 241 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.199224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  34.74 
 
 		 240 aa  92  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  30.95 
 
 		 646 aa  91.7  9e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  32.96 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  33.33 
 
 		 243 aa  90.1  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  32.37 
 
 		 228 aa  90.1  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  30.9 
 
 		 239 aa  89.7  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  36.09 
 
 		 234 aa  89  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  31.33 
 
 		 264 aa  87.8  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0857  dithiobiotin synthetase  31.98 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  34.57 
 
 		 263 aa  86.7  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  30.34 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1300  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  33.53 
 
 		 708 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0734897  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  31.98 
 
 		 226 aa  85.9  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  30.91 
 
 		 211 aa  86.3  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  30.23 
 
 		 225 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  34.71 
 
 		 243 aa  84.7  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1009  dethiobiotin synthase  33.88 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997802 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  29.65 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  29.65 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  29.65 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  29.65 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0823  dethiobiotin synthase  27.27 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  29.07 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  29.65 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  29.65 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01810  dithiobiotin synthetase  31.25 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  31.21 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  31.79 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  32.54 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  29.07 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003868  dethiobiotin synthetase  30.68 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2454  dethiobiotin synthase  34.97 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.101684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  31.43 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1431  dethiobiotin synthetase  32.58 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0329  dithiobiotin synthetase  29.86 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  27.92 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1345  dethiobiotin synthase  31.74 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.408659  normal  0.0545266 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  29.61 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  28.89 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  30.46 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  31.61 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1553  dethiobiotin synthetase  30.9 
 
 		 212 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  30.86 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0517  dethiobiotin synthase  33.54 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0354098  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6277  dithiobiotin synthetase  25.51 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  31.33 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  24.49 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0362  dithiobiotin synthetase  29.21 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356251  normal  0.0664813 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1921  dethiobiotin synthase  28.21 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0147663  decreased coverage  0.00139462 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  27.91 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  28.33 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  28.33 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  27.18 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2597  dethiobiotin synthase  27.5 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.204799  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0323  dethiobiotin synthase  30.54 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0117307 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  31.78 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  29.08 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1887  dethiobiotin synthase  27.9 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3643  dethiobiotin synthase  26.87 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  26.56 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0389  dithiobiotin synthetase  27.01 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0572  dithiobiotin synthetase  27.01 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0410  dithiobiotin synthetase  27.01 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  31.03 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  31.03 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  29.78 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  31.48 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  29.48 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  29.48 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0249  dithiobiotin synthetase  30.1 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2554  dethiobiotin synthase  29.96 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0309873  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  30.06 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  30.65 
 
 		 474 aa  73.9  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  30.32 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  30.46 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  26.02 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1804  dethiobiotin synthase  30.65 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511205  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3096  dethiobiotin synthase  32.94 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1129  dethiobiotin synthetase  32.37 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2186  dethiobiotin synthase  31.9 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  28.9 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  29.48 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  29.48 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2133  dethiobiotin synthase  29.77 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0116  dithiobiotin synthetase  34.36 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85593  dethiobiotin synthetase  33.52 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  27.84 
 
 		 254 aa  72  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  30.72 
 
 		 262 aa  72  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0304  dethiobiotin synthase  31.33 
 
 		 225 aa  72  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2453  dethiobiotin synthase  36.81 
 
 		 228 aa  72  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5172  dithiobiotin synthetase  30.11 
 
 		 226 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0206613  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  30.72 
 
 		 251 aa  72  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>