More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1129 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1129  dethiobiotin synthetase  100 
 
 		 228 aa  456  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  46.98 
 
 		 243 aa  186  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  46.57 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  41.2 
 
 		 230 aa  175  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4084  dithiobiotin synthetase  46.12 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  42.13 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4836  dithiobiotin synthetase  45.15 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.519377 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  44.88 
 
 		 226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5172  dithiobiotin synthetase  45.15 
 
 		 226 aa  169  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0206613  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  41.43 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  42.11 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  46.4 
 
 		 239 aa  167  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  40.93 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  40.93 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  45.37 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  40.65 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  40.93 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  42.4 
 
 		 226 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  40.93 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0323  dethiobiotin synthase  51.22 
 
 		 227 aa  166  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0117307 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  40.36 
 
 		 227 aa  166  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  43.4 
 
 		 226 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  40.93 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  40.47 
 
 		 225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  40.47 
 
 		 225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  40.93 
 
 		 225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0392  dithiobiotin synthetase  43.87 
 
 		 226 aa  164  8e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45930  dithiobiotin synthetase  42.33 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  45.24 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  40 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  41.95 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0857  dithiobiotin synthetase  38.43 
 
 		 227 aa  162  5.0000000000000005e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  41.86 
 
 		 226 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  45.63 
 
 		 226 aa  161  7e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0366  dithiobiotin synthetase  43.4 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.55843  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0498  dethiobiotin synthetase  41.4 
 
 		 226 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  43.52 
 
 		 247 aa  158  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2737  dithiobiotin synthetase  41.83 
 
 		 231 aa  158  7e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2356  dithiobiotin synthetase  41.83 
 
 		 231 aa  155  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2516  dithiobiotin synthetase  41.35 
 
 		 231 aa  154  7e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000238987 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2554  dethiobiotin synthase  40.57 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0309873  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01810  dithiobiotin synthetase  37.73 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  39.23 
 
 		 240 aa  153  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003868  dethiobiotin synthetase  38.43 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2428  dithiobiotin synthetase  41.35 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1804  dethiobiotin synthase  38.54 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511205  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  38.22 
 
 		 221 aa  151  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  38.76 
 
 		 240 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  38.35 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  38.35 
 
 		 228 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  38.35 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  39.11 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  37.8 
 
 		 238 aa  149  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  39.02 
 
 		 245 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0633  dithiobiotin synthetase  38.89 
 
 		 238 aa  149  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  38.61 
 
 		 230 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  45.27 
 
 		 266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  44.55 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0292  dethiobiotin synthase  46.31 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0765643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1921  dethiobiotin synthase  36.95 
 
 		 235 aa  146  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0147663  decreased coverage  0.00139462 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0249  dithiobiotin synthetase  38.76 
 
 		 225 aa  145  6e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1798  dithiobiotin synthetase  35.96 
 
 		 246 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121118  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1637  dithiobiotin synthetase  45.19 
 
 		 226 aa  144  8.000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1163  dethiobiotin synthase  40.64 
 
 		 237 aa  144  9e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0529  dethiobiotin synthase  46.95 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.256581  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3643  dethiobiotin synthase  42.52 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2132  putative dithiobiotin synthetase  39.42 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2773  dethiobiotin synthase  38.24 
 
 		 226 aa  143  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0046697  hitchhiker  0.00857242 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  43.63 
 
 		 248 aa  142  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  43.86 
 
 		 233 aa  142  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1580  dithiobiotin synthetase  45.15 
 
 		 270 aa  141  7e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0294479  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2753  dithiobiotin synthetase  41.75 
 
 		 234 aa  141  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1869  dethiobiotin synthase  34.25 
 
 		 222 aa  141  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  decreased coverage  0.000000281099 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6277  dithiobiotin synthetase  48.94 
 
 		 239 aa  141  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1895  putative dithiobiotin synthetase  38.94 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0959  dethiobiotin synthase  46.45 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1373  dithiobiotin synthetase  43.35 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.409918  normal  0.0708007 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1980  putative dithiobiotin synthetase  36.87 
 
 		 222 aa  138  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1868  putative dithiobiotin synthetase  36.87 
 
 		 222 aa  138  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218738  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4031  dethiobiotin synthase  44.85 
 
 		 240 aa  137  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.677394 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  40.48 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  40.48 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1722  dethiobiotin synthase  38.21 
 
 		 237 aa  135  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000192281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06570  dithiobiotin synthetase  45.07 
 
 		 228 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2045  putative dithiobiotin synthetase  39.42 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.154785  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0171  dithiobiotin synthetase  49.23 
 
 		 239 aa  135  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0604  dithiobiotin synthetase  45.63 
 
 		 228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2346  putative dithiobiotin synthetase  39.42 
 
 		 221 aa  135  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.237745  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0410  dithiobiotin synthetase  49.47 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0572  dithiobiotin synthetase  49.47 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0389  dithiobiotin synthetase  49.47 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  41.55 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1437  dithiobiotin synthetase  42.86 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.581627 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1761  dithiobiotin synthetase  35.53 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1754  dithiobiotin synthetase  35.53 
 
 		 246 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.235022  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01562  predicted dethiobiotin synthetase  36.77 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1667  putative dithiobiotin synthetase  36.77 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1778  putative dithiobiotin synthetase  36.77 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2037  putative dithiobiotin synthetase  36.77 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2302  putative dithiobiotin synthetase  36.77 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0414413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>