More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6892 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  100 
 
 		 234 aa  458  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  43.86 
 
 		 244 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  42.86 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  42.25 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  41.78 
 
 		 242 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  41.15 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  40.85 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  40.85 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  41.78 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  40.85 
 
 		 242 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  43.89 
 
 		 264 aa  137  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  41.83 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  40 
 
 		 239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0070  dethiobiotin synthase  47.42 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338425  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0088  dethiobiotin synthase  47.89 
 
 		 223 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.021607  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  43.11 
 
 		 240 aa  135  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  40.38 
 
 		 242 aa  135  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  40.38 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  40.38 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  40.38 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  42.18 
 
 		 263 aa  132  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  45.24 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0076  dethiobiotin synthase  47.42 
 
 		 223 aa  128  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  37.16 
 
 		 243 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  38.83 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  39.17 
 
 		 242 aa  125  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  42.71 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  37.95 
 
 		 249 aa  122  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  36.09 
 
 		 217 aa  123  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  42.71 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2133  dethiobiotin synthase  39.46 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  44.89 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4836  dithiobiotin synthetase  43.27 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.519377 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  36.67 
 
 		 646 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3711  dethiobiotin synthase  38.28 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00204232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  42.11 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45930  dithiobiotin synthetase  42.49 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  41.35 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  33.49 
 
 		 238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0261  dethiobiotin synthase  35.58 
 
 		 219 aa  115  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.909674  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  44.29 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4084  dithiobiotin synthetase  44.44 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  34.62 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0392  dithiobiotin synthetase  37.55 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2778  dithiobiotin synthetase  37.84 
 
 		 210 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.352107  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  39.74 
 
 		 241 aa  112  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  37.16 
 
 		 220 aa  112  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  36.41 
 
 		 225 aa  111  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  35.81 
 
 		 221 aa  111  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  35.24 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  34.62 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1474  dithiobiotin synthetase  36.61 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0304  dethiobiotin synthase  34.3 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  34.62 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  32.08 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  34.62 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2384  dethiobiotin synthase  41.87 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.393597  normal  0.141052 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  34.62 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0366  dithiobiotin synthetase  37.12 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.55843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  38.86 
 
 		 245 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  35.71 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  34.62 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  34.13 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  34.13 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  34.62 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  37.2 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0490  dithiobiotin synthetase  38.99 
 
 		 212 aa  108  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0428  dithiobiotin synthetase  38.99 
 
 		 212 aa  108  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  35.24 
 
 		 245 aa  108  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  37.39 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  32.37 
 
 		 211 aa  108  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02208  cobyrinic acid a,c-diamide synthase:dethiobiotin synthase  37.17 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.020926  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  42.7 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  35.24 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5562  dethiobiotin synthase  41.48 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  34.29 
 
 		 228 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  34.29 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2946  dethiobiotin synthase  31.67 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00040484  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1910  dethiobiotin synthase  34.78 
 
 		 204 aa  105  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2554  dethiobiotin synthase  38.46 
 
 		 287 aa  105  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0309873  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  38.39 
 
 		 234 aa  105  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  38.39 
 
 		 234 aa  105  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1002  dethiobiotin synthase  32.89 
 
 		 216 aa  105  9e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0498  dethiobiotin synthetase  35.14 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  33.81 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  32.11 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  26.7 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  34.7 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18711  putative dethiobiotin synthase  32.44 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  33.81 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2821  dithiobiotin synthetase  37.84 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0811  dethiobiotin synthase  34.18 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.624971  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  32.57 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  33.81 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0682  dethiobiotin synthase  40.26 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.199224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5172  dithiobiotin synthetase  36.09 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0206613  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1117  dethiobiotin synthase  35.75 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  34.86 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2753  dithiobiotin synthetase  38.57 
 
 		 234 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  34.6 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>