More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0116 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  100 
 
 		 254 aa  509  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  73.39 
 
 		 248 aa  332  5e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  58.11 
 
 		 266 aa  235  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  52.38 
 
 		 245 aa  218  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  50.65 
 
 		 247 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  54.84 
 
 		 233 aa  205  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1373  dithiobiotin synthetase  52.79 
 
 		 235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.409918  normal  0.0708007 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  51.44 
 
 		 221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  49.05 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  48.92 
 
 		 239 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1437  dithiobiotin synthetase  51.93 
 
 		 235 aa  195  7e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.581627 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  52.49 
 
 		 232 aa  190  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3643  dethiobiotin synthase  50.24 
 
 		 236 aa  184  9e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4031  dethiobiotin synthase  51.26 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.677394 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1479  dithiobiotin synthetase  53.65 
 
 		 229 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0324532  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  47.83 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  45.22 
 
 		 243 aa  178  5.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0171  dithiobiotin synthetase  51.29 
 
 		 239 aa  176  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  46.63 
 
 		 230 aa  171  9e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  44.69 
 
 		 230 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  44.69 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6277  dithiobiotin synthetase  48.1 
 
 		 239 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  44.25 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  44.69 
 
 		 228 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  44.25 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  42.31 
 
 		 238 aa  166  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003868  dethiobiotin synthetase  41.13 
 
 		 228 aa  165  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  38.36 
 
 		 242 aa  165  6.9999999999999995e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01810  dithiobiotin synthetase  39.91 
 
 		 227 aa  164  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  42.26 
 
 		 238 aa  164  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  45.15 
 
 		 226 aa  164  9e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  41.59 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0633  dithiobiotin synthetase  45.12 
 
 		 238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45930  dithiobiotin synthetase  44.74 
 
 		 231 aa  162  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  43.56 
 
 		 226 aa  162  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2356  dithiobiotin synthetase  41.35 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  41.59 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0529  dethiobiotin synthase  51.43 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.256581  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  41.59 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  41.59 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  41.07 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02208  cobyrinic acid a,c-diamide synthase:dethiobiotin synthase  41.2 
 
 		 233 aa  158  6e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.020926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  41.15 
 
 		 225 aa  158  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  41.15 
 
 		 225 aa  158  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  41.15 
 
 		 225 aa  158  8e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  43.11 
 
 		 226 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2428  dithiobiotin synthetase  40.51 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  41.15 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0392  dithiobiotin synthetase  43.56 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1798  dithiobiotin synthetase  38.37 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121118  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0249  dithiobiotin synthetase  40.44 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0857  dithiobiotin synthetase  40 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1804  dethiobiotin synthase  41.83 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511205  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  43.42 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  41.74 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  41.56 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0292  dethiobiotin synthase  44.49 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0765643  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0366  dithiobiotin synthetase  43.11 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.55843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0572  dithiobiotin synthetase  49.56 
 
 		 240 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5172  dithiobiotin synthetase  45.75 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0206613  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0410  dithiobiotin synthetase  49.56 
 
 		 240 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0389  dithiobiotin synthetase  49.56 
 
 		 240 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2948  dithiobiotin synthetase  47.41 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1722  dethiobiotin synthase  39.48 
 
 		 237 aa  152  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000192281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2845  dithiobiotin synthetase  47.62 
 
 		 239 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2319  dithiobiotin synthetase  46.98 
 
 		 239 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0506133  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2933  dithiobiotin synthetase  46.98 
 
 		 239 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  42.22 
 
 		 227 aa  151  8e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4836  dithiobiotin synthetase  42.67 
 
 		 226 aa  151  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.519377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4084  dithiobiotin synthetase  44.98 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2554  dethiobiotin synthase  36.44 
 
 		 287 aa  149  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0309873  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2516  dithiobiotin synthetase  38.82 
 
 		 231 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000238987 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0498  dethiobiotin synthetase  41.78 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2982  dithiobiotin synthetase  49.05 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2737  dithiobiotin synthetase  37.87 
 
 		 231 aa  149  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  42.72 
 
 		 227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1441  dithiobiotin synthetase  41.74 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00254947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3842  dethiobiotin synthase  51.65 
 
 		 194 aa  146  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  41.55 
 
 		 245 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1580  dithiobiotin synthetase  43.69 
 
 		 270 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0294479  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  41.55 
 
 		 240 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  42.25 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  41.06 
 
 		 240 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1637  dithiobiotin synthetase  43.27 
 
 		 226 aa  142  5e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2773  dethiobiotin synthase  37.39 
 
 		 226 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0046697  hitchhiker  0.00857242 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1754  dithiobiotin synthetase  37.96 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.235022  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1761  dithiobiotin synthetase  37.8 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1980  putative dithiobiotin synthetase  39.11 
 
 		 222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1868  putative dithiobiotin synthetase  39.11 
 
 		 222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218738  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2524  dithiobiotin synthetase  37.4 
 
 		 246 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.161209  normal  0.3539 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2753  dithiobiotin synthetase  38.59 
 
 		 234 aa  139  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  41.87 
 
 		 234 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  41.87 
 
 		 234 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1869  dethiobiotin synthase  36.44 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  decreased coverage  0.000000281099 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1553  dethiobiotin synthetase  37.98 
 
 		 212 aa  133  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0338  dithiobiotin synthetase  46.86 
 
 		 240 aa  133  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724911  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2016  dithiobiotin synthetase  49.56 
 
 		 240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2270  dithiobiotin synthetase  49.56 
 
 		 240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1921  dethiobiotin synthase  37.02 
 
 		 235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0147663  decreased coverage  0.00139462 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3078  dithiobiotin synthetase  49.56 
 
 		 240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>