More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0329 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0329  dithiobiotin synthetase  100 
 
 
239 aa  489  1e-137  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0362  dithiobiotin synthetase  84.1 
 
 
239 aa  427  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356251  normal  0.0664813 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1163  dethiobiotin synthase  52.7 
 
 
255 aa  249  3e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2454  dethiobiotin synthase  47.84 
 
 
224 aa  206  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.101684  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2186  dethiobiotin synthase  47.53 
 
 
227 aa  204  7e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1160  dethiobiotin synthase  44.17 
 
 
296 aa  202  3e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0082  dithiobiotin synthetase  52.43 
 
 
227 aa  199  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2053  dithiobiotin synthetase  47.09 
 
 
217 aa  191  1e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0534973 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2426  dithiobiotin synthetase  46.85 
 
 
229 aa  186  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2835  dethiobiotin synthase  50 
 
 
225 aa  186  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2066  dithiobiotin synthetase  46.12 
 
 
231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0116  dithiobiotin synthetase  44.5 
 
 
224 aa  170  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  34.78 
 
 
646 aa  118  9e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  37.22 
 
 
263 aa  115  6e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  35.86 
 
 
242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  32.27 
 
 
228 aa  112  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0261  dethiobiotin synthase  36.32 
 
 
219 aa  106  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.909674  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  32.47 
 
 
242 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  35.83 
 
 
213 aa  105  5e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  37.16 
 
 
238 aa  105  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  33.33 
 
 
242 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  32.43 
 
 
244 aa  104  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  33.33 
 
 
242 aa  102  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  32.73 
 
 
234 aa  102  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  34.08 
 
 
210 aa  102  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  32.73 
 
 
234 aa  102  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  32.07 
 
 
211 aa  100  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  34.92 
 
 
243 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  31.52 
 
 
243 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  30.92 
 
 
234 aa  99.4  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4031  dethiobiotin synthase  33.8 
 
 
240 aa  99.4  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.677394 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  35 
 
 
242 aa  98.6  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2946  dethiobiotin synthase  30.62 
 
 
239 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00040484  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  35.71 
 
 
226 aa  97.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  33.16 
 
 
228 aa  97.8  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  33.15 
 
 
242 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  33.15 
 
 
242 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  36.98 
 
 
223 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  33.33 
 
 
249 aa  97.4  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  32.46 
 
 
239 aa  97.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  32.04 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  32.04 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0857  dithiobiotin synthetase  31.89 
 
 
227 aa  96.7  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  30.89 
 
 
243 aa  96.7  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  32.04 
 
 
242 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  32.04 
 
 
242 aa  95.5  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  32.04 
 
 
242 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1553  dethiobiotin synthetase  31.4 
 
 
212 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  30.65 
 
 
230 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  31.22 
 
 
254 aa  94.4  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  32.97 
 
 
239 aa  94.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  30.11 
 
 
228 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2133  dethiobiotin synthase  31.75 
 
 
223 aa  94  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  29.44 
 
 
247 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  30.65 
 
 
228 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  30.65 
 
 
228 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  30.56 
 
 
238 aa  93.2  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0813  dethiobiotin synthase  30.65 
 
 
229 aa  92.8  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.448575  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  27.78 
 
 
233 aa  92.8  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  27.57 
 
 
239 aa  92.4  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  30.11 
 
 
230 aa  92.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  30.77 
 
 
245 aa  92.4  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  31.35 
 
 
240 aa  92  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1002  dethiobiotin synthase  36.46 
 
 
216 aa  92  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  32.79 
 
 
266 aa  92  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1431  dethiobiotin synthetase  31.4 
 
 
212 aa  91.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0621  dethiobiotin synthase  33.85 
 
 
219 aa  90.9  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0529  dethiobiotin synthase  31.03 
 
 
237 aa  90.1  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.256581  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  31.46 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16611  putative dethiobiotin synthase  34.08 
 
 
232 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  31.51 
 
 
230 aa  90.1  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  29.83 
 
 
225 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1564  dethiobiotin synthase  33.15 
 
 
221 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003868  dethiobiotin synthetase  31.18 
 
 
228 aa  90.1  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3096  dethiobiotin synthase  30.53 
 
 
238 aa  89.7  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3711  dethiobiotin synthase  29.27 
 
 
237 aa  89.7  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00204232  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0030  dethiobiotin synthase  33.51 
 
 
210 aa  89.7  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82628  normal  0.806655 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01810  dithiobiotin synthetase  30.27 
 
 
227 aa  89.7  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18711  putative dethiobiotin synthase  35.36 
 
 
216 aa  89.7  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1009  dethiobiotin synthase  30.53 
 
 
247 aa  89.4  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997802 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16731  putative dethiobiotin synthase  33.52 
 
 
221 aa  89  6e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  30.39 
 
 
264 aa  89  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15911  putative dethiobiotin synthase  29.63 
 
 
242 aa  89  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.454357  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  34.05 
 
 
241 aa  88.6  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0682  dethiobiotin synthase  32.96 
 
 
241 aa  88.6  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.199224  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  30.93 
 
 
251 aa  87.8  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0823  dethiobiotin synthase  27.42 
 
 
228 aa  87.8  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  34.78 
 
 
474 aa  87.8  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  28.42 
 
 
244 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  29.28 
 
 
225 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2778  dithiobiotin synthetase  31.22 
 
 
210 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.352107  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  31.38 
 
 
221 aa  87.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  29.28 
 
 
225 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  29.28 
 
 
225 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  30.93 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  30.39 
 
 
227 aa  87  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85593  dethiobiotin synthetase  31.47 
 
 
217 aa  86.7  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  29.83 
 
 
225 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1867  dethiobiotin synthase  33.15 
 
 
223 aa  86.3  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2051  dethiobiotin synthase  33.52 
 
 
219 aa  86.3  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366532  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>