295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1867 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1867  dethiobiotin synthase  100 
 
 
223 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2133  dethiobiotin synthase  47.03 
 
 
223 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0040  dethiobiotin synthase  49.03 
 
 
215 aa  175  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0813  dethiobiotin synthase  46.43 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.448575  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0738  dethiobiotin synthase  46.93 
 
 
223 aa  145  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.232851  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5169  dethiobiotin synthase  47.34 
 
 
225 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456743  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6356  dethiobiotin synthase  45.85 
 
 
225 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2332  dethiobiotin synthase  44.22 
 
 
225 aa  132  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.323651  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1345  dethiobiotin synthase  39.29 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.408659  normal  0.0545266 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2611  dethiobiotin synthase  43.22 
 
 
225 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2287  dethiobiotin synthase  42.29 
 
 
225 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1110  dethiobiotin synthetase  34.33 
 
 
230 aa  124  8.000000000000001e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.588199  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2876  dethiobiotin synthase  43.14 
 
 
230 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0888  dethiobiotin synthase  33.52 
 
 
231 aa  118  7e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  33.18 
 
 
228 aa  105  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  40.66 
 
 
232 aa  102  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2384  dethiobiotin synthase  38.29 
 
 
238 aa  99.8  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.393597  normal  0.141052 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  32.74 
 
 
262 aa  99.4  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  32.74 
 
 
251 aa  99  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  30.35 
 
 
646 aa  98.2  9e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  36.52 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  34.27 
 
 
242 aa  96.7  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1431  dethiobiotin synthetase  29.83 
 
 
212 aa  97.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1300  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  35.2 
 
 
708 aa  95.9  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0734897  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  34.83 
 
 
242 aa  96.3  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  35.98 
 
 
263 aa  94.7  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  30.69 
 
 
242 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  32.68 
 
 
225 aa  94  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  31.37 
 
 
242 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1553  dethiobiotin synthetase  28.73 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  30.2 
 
 
242 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  36.95 
 
 
247 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0529  dethiobiotin synthase  34.52 
 
 
237 aa  93.2  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.256581  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  29.21 
 
 
242 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  35 
 
 
226 aa  93.2  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  30.2 
 
 
242 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  35.87 
 
 
249 aa  92.8  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  32.69 
 
 
225 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  36.22 
 
 
234 aa  92.4  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  32.69 
 
 
225 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  34.55 
 
 
220 aa  92.4  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  28.71 
 
 
242 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  32.69 
 
 
225 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  31.67 
 
 
238 aa  92  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  32.69 
 
 
225 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  32.21 
 
 
225 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  37.3 
 
 
216 aa  90.9  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  32.21 
 
 
225 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  36.11 
 
 
239 aa  90.9  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  30.88 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  30.88 
 
 
242 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  30.88 
 
 
242 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0304  dethiobiotin synthase  30.65 
 
 
225 aa  90.1  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  30.39 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4084  dithiobiotin synthetase  34.5 
 
 
228 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610971  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  30.88 
 
 
242 aa  89.7  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  34.17 
 
 
266 aa  89.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  30.88 
 
 
242 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  35.35 
 
 
245 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  33.89 
 
 
221 aa  88.6  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  30.43 
 
 
226 aa  88.2  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  30.26 
 
 
230 aa  88.2  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1163  dethiobiotin synthase  33.51 
 
 
255 aa  87.4  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0366  dithiobiotin synthetase  32.99 
 
 
226 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.55843  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2053  dithiobiotin synthetase  30.29 
 
 
217 aa  86.7  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0534973 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0392  dithiobiotin synthetase  32.99 
 
 
226 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0329  dithiobiotin synthetase  33.15 
 
 
239 aa  86.3  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  33.01 
 
 
254 aa  86.3  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1373  dithiobiotin synthetase  35.12 
 
 
235 aa  86.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.409918  normal  0.0708007 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16511  putative dethiobiotin synthase  30.43 
 
 
221 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  32.99 
 
 
226 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  32.99 
 
 
248 aa  85.9  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1163  dethiobiotin synthase  31.87 
 
 
237 aa  85.1  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45930  dithiobiotin synthetase  36.46 
 
 
231 aa  84.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  30.59 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1911  dethiobiotin synthase  32.64 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2753  dithiobiotin synthetase  33.5 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  36.84 
 
 
248 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0088  dethiobiotin synthase  39.56 
 
 
223 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.021607  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  30.3 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1437  dithiobiotin synthetase  34.63 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.581627 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  32.34 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0070  dethiobiotin synthase  38.46 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338425  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0362  dithiobiotin synthetase  32.07 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356251  normal  0.0664813 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0036  dethiobiotin synthase  29.76 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4031  dethiobiotin synthase  37.95 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.677394 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0498  dethiobiotin synthetase  32.68 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  34.29 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  28.7 
 
 
238 aa  82  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  31.28 
 
 
227 aa  82  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5172  dithiobiotin synthetase  34.2 
 
 
226 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0206613  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02208  cobyrinic acid a,c-diamide synthase:dethiobiotin synthase  28.77 
 
 
233 aa  81.6  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.020926  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  32.8 
 
 
243 aa  81.6  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  34.83 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  34.25 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  28.28 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  32.4 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  31.35 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2977  dethiobiotin synthetase  32.5 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1804  dethiobiotin synthase  31.44 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>