More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0396 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  100 
 
 		 226 aa  454  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0392  dithiobiotin synthetase  96.9 
 
 		 226 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0366  dithiobiotin synthetase  96.46 
 
 		 226 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.55843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4836  dithiobiotin synthetase  90.27 
 
 		 226 aa  410  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.519377 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5172  dithiobiotin synthetase  77.43 
 
 		 226 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0206613  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0498  dethiobiotin synthetase  72.57 
 
 		 226 aa  332  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  71.11 
 
 		 226 aa  327  6e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4084  dithiobiotin synthetase  72.44 
 
 		 228 aa  322  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45930  dithiobiotin synthetase  70.27 
 
 		 231 aa  317  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0604  dithiobiotin synthetase  72.6 
 
 		 228 aa  278  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06570  dithiobiotin synthetase  70.78 
 
 		 228 aa  278  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1722  dethiobiotin synthase  55.26 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000192281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1804  dethiobiotin synthase  56.56 
 
 		 221 aa  239  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511205  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  51.98 
 
 		 230 aa  235  4e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2773  dethiobiotin synthase  52.47 
 
 		 226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0046697  hitchhiker  0.00857242 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1869  dethiobiotin synthase  53.64 
 
 		 222 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  decreased coverage  0.000000281099 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2516  dithiobiotin synthetase  52.42 
 
 		 231 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000238987 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2737  dithiobiotin synthetase  52.23 
 
 		 231 aa  229  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2356  dithiobiotin synthetase  52.23 
 
 		 231 aa  229  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1163  dethiobiotin synthase  54.15 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1798  dithiobiotin synthetase  49.36 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121118  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2428  dithiobiotin synthetase  51.34 
 
 		 231 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  48 
 
 		 226 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1478  dithiobiotin synthetase  48.94 
 
 		 236 aa  209  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  50.48 
 
 		 228 aa  209  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  48.46 
 
 		 227 aa  208  6e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2342  dithiobiotin synthetase  50.21 
 
 		 247 aa  208  7e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  46.9 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1761  dithiobiotin synthetase  49.36 
 
 		 246 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  46.9 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  50.97 
 
 		 225 aa  205  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  47.35 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  47.35 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  47.35 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  47.35 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1754  dithiobiotin synthetase  49.36 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.235022  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  47.35 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  46.9 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  46.9 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2554  dethiobiotin synthase  49.77 
 
 		 287 aa  202  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0309873  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  45.78 
 
 		 226 aa  201  7e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  49.05 
 
 		 225 aa  201  9e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2524  dithiobiotin synthetase  48.5 
 
 		 246 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.161209  normal  0.3539 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0633  dithiobiotin synthetase  46.67 
 
 		 238 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  46.02 
 
 		 227 aa  200  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  48.02 
 
 		 242 aa  201  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  51.2 
 
 		 240 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  46.85 
 
 		 238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  50.72 
 
 		 245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003868  dethiobiotin synthetase  46.22 
 
 		 228 aa  198  5e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  50.72 
 
 		 240 aa  198  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01810  dithiobiotin synthetase  47.64 
 
 		 227 aa  198  6e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1441  dithiobiotin synthetase  52.86 
 
 		 230 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00254947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  47.32 
 
 		 228 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  47.32 
 
 		 228 aa  195  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  46.26 
 
 		 230 aa  194  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  48.56 
 
 		 228 aa  194  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  45.81 
 
 		 230 aa  193  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  47.75 
 
 		 221 aa  193  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  44.8 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1661  dithiobiotin synthetase  46.52 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1921  dethiobiotin synthase  41.82 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0147663  decreased coverage  0.00139462 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2753  dithiobiotin synthetase  50 
 
 		 234 aa  192  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0292  dethiobiotin synthase  48.64 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0765643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0249  dithiobiotin synthetase  46.4 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  44.34 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0857  dithiobiotin synthetase  40.89 
 
 		 227 aa  184  9e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1895  putative dithiobiotin synthetase  43.11 
 
 		 221 aa  179  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  45.98 
 
 		 245 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1580  dithiobiotin synthetase  48.53 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0294479  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01562  predicted dethiobiotin synthetase  42.98 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2050  dethiobiotin synthase  42.98 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.583234  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01552  hypothetical protein  42.98 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1667  putative dithiobiotin synthetase  42.98 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2037  putative dithiobiotin synthetase  42.98 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02208  cobyrinic acid a,c-diamide synthase:dethiobiotin synthase  45.33 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.020926  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2302  putative dithiobiotin synthetase  42.98 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0414413 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1608  putative dithiobiotin synthetase  42.98 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1778  putative dithiobiotin synthetase  42.98 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1799  putative dithiobiotin synthetase  42.98 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1637  dithiobiotin synthetase  48.06 
 
 		 226 aa  175  5e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0959  dethiobiotin synthase  51.6 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0323  dethiobiotin synthase  46.48 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0117307 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  43.89 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  45.41 
 
 		 266 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2284  dethiobiotin synthase  41.82 
 
 		 223 aa  172  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.165561 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1920  putative dithiobiotin synthetase  41.48 
 
 		 231 aa  171  9e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2045  putative dithiobiotin synthetase  42.79 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.154785  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  47.34 
 
 		 232 aa  170  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2346  putative dithiobiotin synthetase  41.89 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.237745  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  42.48 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2132  putative dithiobiotin synthetase  40.09 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1600  putative dithiobiotin synthetase  40.79 
 
 		 231 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1850  putative dithiobiotin synthetase  40.79 
 
 		 231 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1591  putative dithiobiotin synthetase  40.79 
 
 		 231 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0571345 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1659  putative dithiobiotin synthetase  40.79 
 
 		 231 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1683  putative dithiobiotin synthetase  40.79 
 
 		 231 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.809322  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  45.19 
 
 		 226 aa  167  9e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1980  putative dithiobiotin synthetase  43.32 
 
 		 222 aa  165  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1868  putative dithiobiotin synthetase  43.32 
 
 		 222 aa  165  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>