More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2876 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2876  dethiobiotin synthase  100 
 
 
230 aa  444  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2133  dethiobiotin synthase  50 
 
 
223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0813  dethiobiotin synthase  48.5 
 
 
229 aa  158  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.448575  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0738  dethiobiotin synthase  50.54 
 
 
223 aa  145  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.232851  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0888  dethiobiotin synthase  41.9 
 
 
231 aa  140  9.999999999999999e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1345  dethiobiotin synthase  44.83 
 
 
221 aa  141  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.408659  normal  0.0545266 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0040  dethiobiotin synthase  42.25 
 
 
215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1867  dethiobiotin synthase  43.14 
 
 
223 aa  132  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2287  dethiobiotin synthase  43.87 
 
 
225 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2611  dethiobiotin synthase  46.35 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1110  dethiobiotin synthetase  42.44 
 
 
230 aa  129  3e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.588199  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2332  dethiobiotin synthase  47.06 
 
 
225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.323651  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5169  dethiobiotin synthase  45.95 
 
 
225 aa  122  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456743  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6356  dethiobiotin synthase  47.5 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  40.44 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  36.76 
 
 
248 aa  106  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  39.44 
 
 
234 aa  102  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0030  dethiobiotin synthase  42.29 
 
 
210 aa  102  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82628  normal  0.806655 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  39.71 
 
 
262 aa  102  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1300  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  37.97 
 
 
708 aa  101  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0734897  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  39.71 
 
 
251 aa  101  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  42.44 
 
 
216 aa  98.6  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  41.86 
 
 
210 aa  98.2  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  37.08 
 
 
225 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  37.08 
 
 
225 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  37.08 
 
 
225 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  37.08 
 
 
225 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  37.08 
 
 
225 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1910  dethiobiotin synthase  35.84 
 
 
204 aa  96.7  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  37.08 
 
 
225 aa  96.7  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  36.52 
 
 
225 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  36.52 
 
 
225 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  33.5 
 
 
242 aa  95.5  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  36.52 
 
 
225 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  36.97 
 
 
249 aa  94  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  35.53 
 
 
242 aa  94  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  34.53 
 
 
240 aa  93.2  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  39.67 
 
 
223 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  38.95 
 
 
244 aa  92.4  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  35.18 
 
 
243 aa  92  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  34.93 
 
 
226 aa  90.9  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0529  dethiobiotin synthase  37.62 
 
 
237 aa  90.9  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.256581  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  33.68 
 
 
211 aa  91.3  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  41.61 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  30.85 
 
 
242 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0261  dethiobiotin synthase  32.43 
 
 
219 aa  89.7  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.909674  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2098  dithiobiotin synthetase  36.99 
 
 
209 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.250318  normal  0.47001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  33.01 
 
 
243 aa  89.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  30.85 
 
 
242 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2051  dethiobiotin synthase  36.31 
 
 
219 aa  89.7  4e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366532  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  30.85 
 
 
242 aa  89  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  31.34 
 
 
242 aa  89  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  41.77 
 
 
247 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  34.54 
 
 
239 aa  88.6  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  33.63 
 
 
239 aa  87.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  32.76 
 
 
238 aa  88.2  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04561  putative dethiobiotin synthase  34.88 
 
 
232 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85593  dethiobiotin synthetase  31.47 
 
 
217 aa  87.4  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0621  dethiobiotin synthase  35.63 
 
 
219 aa  87  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  31.76 
 
 
217 aa  87.4  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  32.7 
 
 
226 aa  86.7  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  29.74 
 
 
210 aa  86.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2554  dethiobiotin synthase  33.03 
 
 
287 aa  86.7  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0309873  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  29.63 
 
 
646 aa  85.9  4e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  29.85 
 
 
242 aa  85.9  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0811  dethiobiotin synthase  27.72 
 
 
210 aa  85.9  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.624971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  30 
 
 
242 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5562  dethiobiotin synthase  34.09 
 
 
210 aa  85.5  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  28.16 
 
 
243 aa  85.5  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05390  dethiobiotin synthetase  32.37 
 
 
205 aa  85.1  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.198587  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  34.46 
 
 
212 aa  85.1  9e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15911  putative dethiobiotin synthase  31.07 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.454357  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  30 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1431  dethiobiotin synthetase  31.61 
 
 
212 aa  84.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2384  dethiobiotin synthase  36.71 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.393597  normal  0.141052 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  30 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  34.66 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  41.14 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1002  dethiobiotin synthase  33 
 
 
216 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  37.42 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  37.14 
 
 
264 aa  84  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  37.42 
 
 
228 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0362  dithiobiotin synthetase  31.4 
 
 
239 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356251  normal  0.0664813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  35.59 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2977  dethiobiotin synthetase  34.46 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  35.21 
 
 
238 aa  83.6  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  32.06 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16511  putative dethiobiotin synthase  32.78 
 
 
221 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18711  putative dethiobiotin synthase  33 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1690  dethiobiotin synthase  33.14 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.439314  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0392  dithiobiotin synthetase  32.74 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  31.96 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  36.81 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  36.81 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0245  dethiobiotin synthase  36.56 
 
 
230 aa  82  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.67584  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0088  dethiobiotin synthase  38.86 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.021607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  31.66 
 
 
240 aa  82  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  36.81 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02208  cobyrinic acid a,c-diamide synthase:dethiobiotin synthase  35.03 
 
 
233 aa  82  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.020926  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  37.65 
 
 
230 aa  82  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>