293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6356 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6356  dethiobiotin synthase  100 
 
 		 225 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5169  dethiobiotin synthase  87.95 
 
 		 225 aa  350  8e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456743  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2287  dethiobiotin synthase  70.7 
 
 		 225 aa  264  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2611  dethiobiotin synthase  69.77 
 
 		 225 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2332  dethiobiotin synthase  68.84 
 
 		 225 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.323651  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0738  dethiobiotin synthase  69.3 
 
 		 223 aa  234  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.232851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2133  dethiobiotin synthase  51.87 
 
 		 223 aa  175  6e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0040  dethiobiotin synthase  47.96 
 
 		 215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0813  dethiobiotin synthase  43.13 
 
 		 229 aa  158  8e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.448575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1867  dethiobiotin synthase  45.85 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1345  dethiobiotin synthase  43.13 
 
 		 221 aa  153  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.408659  normal  0.0545266 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0888  dethiobiotin synthase  35.44 
 
 		 231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1110  dethiobiotin synthetase  35.47 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.588199  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2876  dethiobiotin synthase  47.76 
 
 		 230 aa  124  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  41.85 
 
 		 262 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  41.85 
 
 		 251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1910  dethiobiotin synthase  34.47 
 
 		 204 aa  108  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1300  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  38.21 
 
 		 708 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0734897  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2384  dethiobiotin synthase  42.78 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.393597  normal  0.141052 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1431  dethiobiotin synthetase  35.63 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  38.39 
 
 		 234 aa  99.8  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1553  dethiobiotin synthetase  34.48 
 
 		 212 aa  99  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  40.7 
 
 		 230 aa  95.9  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  38.12 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  34.56 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  37.13 
 
 		 247 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  37.74 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  37.89 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  33.69 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  32.42 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  38.36 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  38.36 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1163  dethiobiotin synthase  33.68 
 
 		 255 aa  86.3  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0823  dethiobiotin synthase  25.48 
 
 		 228 aa  86.3  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  34.26 
 
 		 248 aa  85.9  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  37.74 
 
 		 228 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  37.74 
 
 		 228 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  32.42 
 
 		 242 aa  85.5  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  35.12 
 
 		 238 aa  85.1  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  37.11 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  33.69 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  33.69 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  33.69 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  33.69 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0329  dithiobiotin synthetase  31.18 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  33.72 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  33.69 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  33.69 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  34.78 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  33.69 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  31.32 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  30.77 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0362  dithiobiotin synthetase  31.18 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356251  normal  0.0664813 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  33.69 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  29.9 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  33.19 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2186  dethiobiotin synthase  34.81 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  35.22 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  29.9 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  31.03 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  32.09 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4084  dithiobiotin synthetase  41.57 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  30.77 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  39.75 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  33.86 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  25.37 
 
 		 646 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1690  dethiobiotin synthase  32.86 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.439314  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  32.4 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  32.78 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  29.67 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  31.4 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  29.67 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  33.74 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  32.78 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  25.81 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  33.16 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  32.78 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5562  dethiobiotin synthase  31.82 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  26.09 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  29.67 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  29.67 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0857  dithiobiotin synthetase  30.11 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0392  dithiobiotin synthetase  35.84 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  29.67 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  32.81 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02208  cobyrinic acid a,c-diamide synthase:dethiobiotin synthase  33.33 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.020926  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1911  dethiobiotin synthase  32.04 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003868  dethiobiotin synthetase  32.09 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  37.65 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0030  dethiobiotin synthase  34.15 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82628  normal  0.806655 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  39.75 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  37.65 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  34.88 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1373  dithiobiotin synthetase  38.22 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.409918  normal  0.0708007 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  33.01 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  32.75 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1163  dethiobiotin synthase  38.24 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0529  dethiobiotin synthase  35.75 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.256581  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  36.48 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0261  dethiobiotin synthase  26.37 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.909674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>