More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3135 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 230 aa  467  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2516  dithiobiotin synthetase  53.51 
 
 		 231 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000238987 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2737  dithiobiotin synthetase  51.75 
 
 		 231 aa  238  5e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5172  dithiobiotin synthetase  52.86 
 
 		 226 aa  238  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0206613  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0392  dithiobiotin synthetase  52.42 
 
 		 226 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1869  dethiobiotin synthase  53.18 
 
 		 222 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  decreased coverage  0.000000281099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2356  dithiobiotin synthetase  51.32 
 
 		 231 aa  236  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2753  dithiobiotin synthetase  53.07 
 
 		 234 aa  236  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  51.98 
 
 		 226 aa  235  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0366  dithiobiotin synthetase  51.98 
 
 		 226 aa  234  6e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.55843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2428  dithiobiotin synthetase  50.88 
 
 		 231 aa  234  6e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4084  dithiobiotin synthetase  52.63 
 
 		 228 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4836  dithiobiotin synthetase  51.54 
 
 		 226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.519377 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  51.58 
 
 		 225 aa  231  7.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  52 
 
 		 226 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45930  dithiobiotin synthetase  52.89 
 
 		 231 aa  230  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2773  dethiobiotin synthase  50 
 
 		 226 aa  230  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0046697  hitchhiker  0.00857242 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0498  dethiobiotin synthetase  51.8 
 
 		 226 aa  229  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1804  dethiobiotin synthase  51.58 
 
 		 221 aa  229  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511205  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1798  dithiobiotin synthetase  47.9 
 
 		 246 aa  228  7e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121118  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  47.32 
 
 		 242 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1163  dethiobiotin synthase  48.7 
 
 		 237 aa  215  5e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1722  dethiobiotin synthase  46.55 
 
 		 237 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000192281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1754  dithiobiotin synthetase  47.9 
 
 		 246 aa  210  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.235022  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1661  dithiobiotin synthetase  46.75 
 
 		 231 aa  210  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06570  dithiobiotin synthetase  55.66 
 
 		 228 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1761  dithiobiotin synthetase  47.11 
 
 		 246 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0604  dithiobiotin synthetase  55.66 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2524  dithiobiotin synthetase  46.69 
 
 		 246 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.161209  normal  0.3539 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01810  dithiobiotin synthetase  46.19 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1921  dethiobiotin synthase  48.54 
 
 		 235 aa  202  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0147663  decreased coverage  0.00139462 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  46.88 
 
 		 228 aa  201  8e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  46.19 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  45.18 
 
 		 240 aa  199  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  47.77 
 
 		 243 aa  198  5e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  45.5 
 
 		 227 aa  198  7e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2342  dithiobiotin synthetase  46.64 
 
 		 247 aa  197  9e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  44.74 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  46.22 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2554  dethiobiotin synthase  49.07 
 
 		 287 aa  196  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0309873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  44.69 
 
 		 245 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1441  dithiobiotin synthetase  49.11 
 
 		 230 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00254947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  44.14 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003868  dethiobiotin synthetase  43.95 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0857  dithiobiotin synthetase  43.36 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0292  dethiobiotin synthase  50.68 
 
 		 237 aa  192  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0765643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1478  dithiobiotin synthetase  43.4 
 
 		 236 aa  192  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  47.22 
 
 		 225 aa  191  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  47.81 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  47.22 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  47.22 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  47.22 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2284  dethiobiotin synthase  44.05 
 
 		 223 aa  188  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.165561 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02208  cobyrinic acid a,c-diamide synthase:dethiobiotin synthase  46.98 
 
 		 233 aa  188  5.999999999999999e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.020926  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  47.22 
 
 		 225 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  47.22 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  46.76 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  46.76 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  46.22 
 
 		 221 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  46.76 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  43.36 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  42.92 
 
 		 228 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  43.3 
 
 		 230 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  42.92 
 
 		 228 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  46.7 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1895  putative dithiobiotin synthetase  45.13 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  42.86 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  44.2 
 
 		 238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2132  putative dithiobiotin synthetase  44.25 
 
 		 223 aa  181  9.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0633  dithiobiotin synthetase  43.42 
 
 		 238 aa  181  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2346  putative dithiobiotin synthetase  44.84 
 
 		 221 aa  180  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.237745  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  45.81 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  45.19 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2045  putative dithiobiotin synthetase  42.31 
 
 		 221 aa  179  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.154785  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1920  putative dithiobiotin synthetase  42.98 
 
 		 231 aa  179  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  44.8 
 
 		 230 aa  177  9e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  44.55 
 
 		 266 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1373  dithiobiotin synthetase  45.18 
 
 		 235 aa  174  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.409918  normal  0.0708007 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1637  dithiobiotin synthetase  48.54 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1580  dithiobiotin synthetase  47.6 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0294479  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1437  dithiobiotin synthetase  45.61 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.581627 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1600  putative dithiobiotin synthetase  42.4 
 
 		 231 aa  168  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1850  putative dithiobiotin synthetase  42.4 
 
 		 231 aa  168  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01562  predicted dethiobiotin synthetase  42.86 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2050  dethiobiotin synthase  42.86 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.583234  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1667  putative dithiobiotin synthetase  42.86 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1799  putative dithiobiotin synthetase  42.86 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2302  putative dithiobiotin synthetase  42.86 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0414413 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  43.89 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2037  putative dithiobiotin synthetase  42.86 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1778  putative dithiobiotin synthetase  42.86 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1608  putative dithiobiotin synthetase  42.86 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01552  hypothetical protein  42.86 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1868  putative dithiobiotin synthetase  41.33 
 
 		 222 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218738  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1980  putative dithiobiotin synthetase  41.33 
 
 		 222 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1659  putative dithiobiotin synthetase  40.43 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  45.54 
 
 		 232 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1591  putative dithiobiotin synthetase  40.43 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0571345 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1683  putative dithiobiotin synthetase  40.43 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.809322  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4031  dethiobiotin synthase  48.23 
 
 		 240 aa  164  6.9999999999999995e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.677394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>