294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2186 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2186  dethiobiotin synthase  100 
 
 		 227 aa  451  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2454  dethiobiotin synthase  62.5 
 
 		 224 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.101684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0082  dithiobiotin synthetase  56.44 
 
 		 227 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2835  dethiobiotin synthase  57.66 
 
 		 225 aa  241  9e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2426  dithiobiotin synthetase  60.27 
 
 		 229 aa  238  4e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2066  dithiobiotin synthetase  55.34 
 
 		 231 aa  218  3.9999999999999997e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1163  dethiobiotin synthase  51.58 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0116  dithiobiotin synthetase  50.93 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0329  dithiobiotin synthetase  47.53 
 
 		 239 aa  204  6e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0362  dithiobiotin synthetase  47.25 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356251  normal  0.0664813 
 
 
-
 
NC_002950  PG2053  dithiobiotin synthetase  51.56 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0534973 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1160  dethiobiotin synthase  43.43 
 
 		 296 aa  156  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  36.17 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  34.67 
 
 		 646 aa  111  7.000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  38.1 
 
 		 242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  34.6 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  34.48 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  35.26 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  35.84 
 
 		 227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  34.48 
 
 		 225 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  34.48 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  34.48 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  34.48 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  34.48 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  34.1 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  33.91 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  33.91 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  37.43 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  35.06 
 
 		 226 aa  105  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  35.09 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  35.84 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  32.6 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  35.26 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  35.26 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3711  dethiobiotin synthase  33.91 
 
 		 237 aa  101  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00204232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  38.46 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  33.14 
 
 		 217 aa  101  8e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0490  dithiobiotin synthetase  40.48 
 
 		 212 aa  101  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0428  dithiobiotin synthetase  40.48 
 
 		 212 aa  101  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  37.71 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  34.68 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  34.68 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  34.68 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  32.8 
 
 		 243 aa  99.8  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2946  dethiobiotin synthase  32.33 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00040484  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0621  dethiobiotin synthase  38.15 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0823  dethiobiotin synthase  31.07 
 
 		 228 aa  99.4  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  33.68 
 
 		 238 aa  99.4  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16611  putative dethiobiotin synthase  35.29 
 
 		 232 aa  99  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  32.37 
 
 		 240 aa  99  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  34.3 
 
 		 211 aa  99  6e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2051  dethiobiotin synthase  36.84 
 
 		 219 aa  98.6  7e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1300  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  35.63 
 
 		 708 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0734897  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2420  dithiobiotin synthetase  37.78 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.401456  normal  0.0742626 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1564  dethiobiotin synthase  35.47 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2821  dithiobiotin synthetase  39.29 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  31.61 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  31.79 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1002  dethiobiotin synthase  38.37 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  34.1 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5562  dethiobiotin synthase  40.35 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4239  dithiobiotin synthetase  38.55 
 
 		 212 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.528424 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1009  dethiobiotin synthase  36.99 
 
 		 247 aa  95.9  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997802 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  35.39 
 
 		 248 aa  95.9  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16731  putative dethiobiotin synthase  34.32 
 
 		 221 aa  95.5  5e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  31.67 
 
 		 243 aa  95.5  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3319  dithiobiotin synthetase  41.76 
 
 		 212 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  32.61 
 
 		 239 aa  95.5  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  36.55 
 
 		 216 aa  95.1  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1553  dethiobiotin synthetase  34.86 
 
 		 212 aa  95.1  8e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0857  dithiobiotin synthetase  32.76 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18711  putative dethiobiotin synthase  37.79 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  33.71 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  32.97 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2133  dethiobiotin synthase  37.43 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1431  dethiobiotin synthetase  34.29 
 
 		 212 aa  94  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2815  dithiobiotin synthetase  36.52 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1474  dithiobiotin synthetase  35.16 
 
 		 202 aa  93.2  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  32.37 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2919  dithiobiotin synthetase  37.57 
 
 		 213 aa  92.8  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  33.97 
 
 		 251 aa  92.8  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  32.06 
 
 		 226 aa  92.4  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  33.52 
 
 		 228 aa  92.8  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  33.97 
 
 		 262 aa  92.8  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15911  putative dethiobiotin synthase  34.32 
 
 		 242 aa  92  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.454357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0682  dethiobiotin synthase  35.26 
 
 		 241 aa  92  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.199224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2098  dithiobiotin synthetase  37.65 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.250318  normal  0.47001 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  35.43 
 
 		 266 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2918  dithiobiotin synthetase  41.71 
 
 		 202 aa  91.3  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.295464  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  32.16 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04561  putative dethiobiotin synthase  38.73 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  35 
 
 		 241 aa  89.7  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  30.67 
 
 		 474 aa  89.4  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3096  dethiobiotin synthase  35.16 
 
 		 238 aa  89  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  31.22 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16511  putative dethiobiotin synthase  34.71 
 
 		 221 aa  89.4  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4343  dithiobiotin synthetase  39.41 
 
 		 213 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0906504 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  30.29 
 
 		 212 aa  89  6e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  32.81 
 
 		 234 aa  89  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2778  dithiobiotin synthetase  36.63 
 
 		 210 aa  88.6  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.352107  normal  0.487969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>