233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1160 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1160  dethiobiotin synthase  100 
 
 		 296 aa  618  1e-176  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0329  dithiobiotin synthetase  44.17 
 
 		 239 aa  202  5e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1163  dethiobiotin synthase  44.86 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0362  dithiobiotin synthetase  43.32 
 
 		 239 aa  198  9e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356251  normal  0.0664813 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2454  dethiobiotin synthase  39.22 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.101684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0082  dithiobiotin synthetase  45.99 
 
 		 227 aa  167  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2186  dethiobiotin synthase  43.43 
 
 		 227 aa  156  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2835  dethiobiotin synthase  36.1 
 
 		 225 aa  149  7e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2053  dithiobiotin synthetase  34.62 
 
 		 217 aa  141  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0534973 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2066  dithiobiotin synthetase  38.3 
 
 		 231 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2426  dithiobiotin synthetase  37.78 
 
 		 229 aa  140  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0116  dithiobiotin synthetase  37.37 
 
 		 224 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  30.98 
 
 		 646 aa  92.4  8e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  29.61 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  30 
 
 		 226 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0813  dethiobiotin synthase  31.31 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.448575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  26.06 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  26.82 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15911  putative dethiobiotin synthase  28.49 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.454357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  24.43 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  29.89 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2946  dethiobiotin synthase  28.18 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00040484  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  25.14 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1867  dethiobiotin synthase  30.1 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  24.73 
 
 		 228 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  26.64 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  26.44 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  28.96 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  28.18 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0261  dethiobiotin synthase  28.88 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.909674  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  25.57 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2133  dethiobiotin synthase  27.84 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0738  dethiobiotin synthase  30 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.232851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  23.96 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  25.57 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16611  putative dethiobiotin synthase  26.83 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0682  dethiobiotin synthase  27.37 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.199224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  26.67 
 
 		 239 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1553  dethiobiotin synthetase  25.76 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1564  dethiobiotin synthase  27.32 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5739  dethiobiotin synthase  29.28 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.945686  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16731  putative dethiobiotin synthase  26.34 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  29.65 
 
 		 474 aa  68.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1431  dethiobiotin synthetase  25.76 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  24.43 
 
 		 227 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  26.11 
 
 		 239 aa  67  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  25.85 
 
 		 245 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  27.47 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3096  dethiobiotin synthase  26.87 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  25.41 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1002  dethiobiotin synthase  28.73 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3711  dethiobiotin synthase  26.19 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00204232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  25.67 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  24.42 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2384  dethiobiotin synthase  29.94 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.393597  normal  0.141052 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2051  dethiobiotin synthase  27.27 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  24.87 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18711  putative dethiobiotin synthase  28.18 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  27.62 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  24.47 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0968  dithiobiotin synthetase  30.9 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1632  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0823  dethiobiotin synthase  23.37 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1752  dethiobiotin synthase  21.74 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00909358  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0621  dethiobiotin synthase  26.34 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1009  dethiobiotin synthase  28.09 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997802 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0245  dethiobiotin synthase  25.53 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.67584  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  25.13 
 
 		 234 aa  62  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  26.97 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  25.13 
 
 		 234 aa  62  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  26.63 
 
 		 243 aa  62  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  25.71 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  24.42 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  25.71 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003868  dethiobiotin synthetase  26.11 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  28 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  24.02 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1568  dethiobiotin synthase  27.32 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248853  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  25.71 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  23.66 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4330  dithiobiotin synthetase  22.7 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0304  dethiobiotin synthase  24.21 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2821  dithiobiotin synthetase  29.91 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  28.74 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1390  dethiobiotin synthetase  24.32 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  25.84 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1804  dethiobiotin synthase  24.87 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511205  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  24.16 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5169  dethiobiotin synthase  27.51 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456743  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2611  dethiobiotin synthase  28.33 
 
 		 225 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  23.84 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1097  dethiobiotin synthase  21.3 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110147  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  25 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0888  dethiobiotin synthase  23.6 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2287  dethiobiotin synthase  27.66 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0460  dethiobiotin synthase  24.29 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00232018  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  23.46 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1921  dethiobiotin synthase  22.29 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0147663  decreased coverage  0.00139462 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04561  putative dethiobiotin synthase  28.16 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2332  dethiobiotin synthase  27.96 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.323651  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0392  dithiobiotin synthetase  27.37 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>