299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0968 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0968  dithiobiotin synthetase  100 
 
 
238 aa  447  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1632  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3762  dithiobiotin synthetase  70.97 
 
 
238 aa  284  7e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.531948  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3699  dethiobiotin synthase  61.97 
 
 
240 aa  266  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0969414  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7723  dithiobiotin synthetase  63.98 
 
 
242 aa  258  8e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8310  Dethiobiotin synthase  61.44 
 
 
240 aa  240  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10780  dethiobiotin synthase  59.83 
 
 
240 aa  222  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5739  dethiobiotin synthase  56.03 
 
 
242 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.945686  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0613  dethiobiotin synthase  60.17 
 
 
245 aa  201  9e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661073  normal  0.951436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2790  dithiobiotin synthetase  49.1 
 
 
226 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.615305  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2973  dethiobiotin synthase  50.95 
 
 
272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.109922  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1571  dethiobiotin synthase  48.03 
 
 
246 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.706287 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1052  dethiobiotin synthase  45.06 
 
 
238 aa  143  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.802225  normal  0.0589723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0472  dethiobiotin synthase  44.29 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3627  dithiobiotin synthetase  47.75 
 
 
226 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3412  dethiobiotin synthase  43.46 
 
 
281 aa  139  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3093  dithiobiotin synthetase  49.55 
 
 
229 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842884  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3076  dithiobiotin synthetase  49.55 
 
 
229 aa  134  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3136  dithiobiotin synthetase  49.55 
 
 
229 aa  134  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1520  dethiobiotin synthase  48.47 
 
 
234 aa  128  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000244558 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  44.93 
 
 
241 aa  123  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2000  dethiobiotin synthase  45.3 
 
 
236 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  45.41 
 
 
244 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  35.98 
 
 
242 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  37 
 
 
264 aa  105  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  35.43 
 
 
242 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  34.98 
 
 
242 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  34.53 
 
 
242 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  37.78 
 
 
240 aa  99.8  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  33.93 
 
 
242 aa  99.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  33.89 
 
 
242 aa  98.2  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  46.51 
 
 
234 aa  97.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  46.51 
 
 
234 aa  97.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  34.98 
 
 
242 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  35.94 
 
 
221 aa  95.9  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  34.53 
 
 
242 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  34.67 
 
 
242 aa  95.9  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  34.53 
 
 
242 aa  95.5  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  34.67 
 
 
242 aa  95.9  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  37.93 
 
 
242 aa  94.7  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  35.24 
 
 
243 aa  94.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  35.07 
 
 
263 aa  92  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  36.87 
 
 
234 aa  91.7  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  30.14 
 
 
244 aa  90.9  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1752  dethiobiotin synthase  32.93 
 
 
222 aa  91.7  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00909358  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0329  dithiobiotin synthetase  36.56 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  36.45 
 
 
243 aa  90.1  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  40.4 
 
 
228 aa  90.1  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  39.55 
 
 
249 aa  87.4  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  44 
 
 
223 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  42.13 
 
 
216 aa  87  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  29.95 
 
 
646 aa  85.9  6e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11602  dithiobiotin synthetase  42.51 
 
 
226 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000527679  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0617  dethiobiotin synthase  29.08 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0451088  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0682  dethiobiotin synthase  37.74 
 
 
241 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.199224  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  37.43 
 
 
239 aa  84  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  35.27 
 
 
239 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18711  putative dethiobiotin synthase  30.77 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  28.88 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1009  dethiobiotin synthase  35.35 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997802 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0362  dithiobiotin synthetase  34.95 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356251  normal  0.0664813 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0304  dethiobiotin synthase  31.34 
 
 
225 aa  82  0.000000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  37.56 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1911  dethiobiotin synthase  38.16 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  34.48 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1002  dethiobiotin synthase  29.81 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  30.81 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0036  dethiobiotin synthase  33 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  37.57 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  36.82 
 
 
226 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2946  dethiobiotin synthase  27.94 
 
 
239 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00040484  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4330  dithiobiotin synthetase  27.62 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112465  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1474  dithiobiotin synthetase  30.04 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  37.36 
 
 
474 aa  75.5  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0460  dethiobiotin synthase  33.75 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00232018  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0070  dethiobiotin synthase  42.71 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338425  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0823  dethiobiotin synthase  26.57 
 
 
228 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  39.2 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  40.8 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1910  dethiobiotin synthase  31.65 
 
 
204 aa  74.7  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2426  dithiobiotin synthetase  36.11 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2051  dethiobiotin synthase  32.23 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366532  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  33.33 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0076  dethiobiotin synthase  43.5 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2053  dithiobiotin synthetase  33.69 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0534973 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  33.68 
 
 
248 aa  72  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0088  dethiobiotin synthase  44.55 
 
 
223 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.021607  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2454  dethiobiotin synthase  29.83 
 
 
224 aa  72  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.101684  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  27.17 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0030  dethiobiotin synthase  35.71 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82628  normal  0.806655 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  30.92 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1163  dethiobiotin synthase  35.27 
 
 
237 aa  71.6  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16611  putative dethiobiotin synthase  28.82 
 
 
232 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2554  dethiobiotin synthase  32.11 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0309873  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85593  dethiobiotin synthetase  32.37 
 
 
217 aa  71.6  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5562  dethiobiotin synthase  36.26 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0261  dethiobiotin synthase  30 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.909674  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0717  dithiobiotin synthetase  32.2 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  35.71 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  23.2 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16731  putative dethiobiotin synthase  28 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>