291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0682 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0682  dethiobiotin synthase  100 
 
 
241 aa  482  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.199224  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1009  dethiobiotin synthase  76.44 
 
 
247 aa  346  2e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997802 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2663  dethiobiotin synthase  55.65 
 
 
238 aa  244  8e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265102  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3711  dethiobiotin synthase  51.87 
 
 
237 aa  224  8e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00204232  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1117  dethiobiotin synthase  42.53 
 
 
232 aa  123  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1564  dethiobiotin synthase  34.59 
 
 
221 aa  108  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  29.86 
 
 
211 aa  108  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16731  putative dethiobiotin synthase  33.87 
 
 
221 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16511  putative dethiobiotin synthase  36.16 
 
 
221 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16611  putative dethiobiotin synthase  34.24 
 
 
232 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  37.68 
 
 
242 aa  105  8e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  34.74 
 
 
263 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  40.26 
 
 
234 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  33.48 
 
 
243 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15911  putative dethiobiotin synthase  37.11 
 
 
242 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.454357  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1002  dethiobiotin synthase  36.22 
 
 
216 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18711  putative dethiobiotin synthase  36.22 
 
 
216 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  36.99 
 
 
264 aa  102  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  32.17 
 
 
242 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0517  dethiobiotin synthase  32.58 
 
 
221 aa  101  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0354098  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2821  dithiobiotin synthetase  34.95 
 
 
212 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  36.71 
 
 
243 aa  99.8  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  33.65 
 
 
244 aa  99.8  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  31.52 
 
 
646 aa  98.6  7e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  34.59 
 
 
217 aa  97.8  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  34.76 
 
 
240 aa  97.1  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  33.5 
 
 
242 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  33.5 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  34.13 
 
 
242 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85593  dethiobiotin synthetase  33.84 
 
 
217 aa  95.5  6e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4330  dithiobiotin synthetase  29.19 
 
 
228 aa  95.5  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112465  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  33.01 
 
 
242 aa  94  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2835  dethiobiotin synthase  30.33 
 
 
225 aa  93.2  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1097  dethiobiotin synthase  29.8 
 
 
190 aa  92.8  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110147  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2454  dethiobiotin synthase  33.33 
 
 
224 aa  92.4  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.101684  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0490  dithiobiotin synthetase  35.83 
 
 
212 aa  92.8  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  33.01 
 
 
242 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0811  dethiobiotin synthase  32.22 
 
 
210 aa  92.4  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.624971  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  30.77 
 
 
210 aa  92.4  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0428  dithiobiotin synthetase  35.83 
 
 
212 aa  92.8  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  37.57 
 
 
249 aa  92  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2186  dethiobiotin synthase  35.26 
 
 
227 aa  92  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  33.01 
 
 
242 aa  91.7  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  36.61 
 
 
244 aa  91.7  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  33.01 
 
 
242 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4239  dithiobiotin synthetase  40.34 
 
 
212 aa  91.7  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.528424 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  31.21 
 
 
212 aa  91.7  9e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  33.01 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  33.01 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0030  dethiobiotin synthase  38.64 
 
 
210 aa  91.3  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82628  normal  0.806655 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  30.67 
 
 
242 aa  90.9  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2051  dethiobiotin synthase  38.46 
 
 
219 aa  90.5  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366532  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0040  dethiobiotin synthase  33.66 
 
 
215 aa  90.5  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2426  dithiobiotin synthetase  35.67 
 
 
229 aa  89.4  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0082  dithiobiotin synthetase  32.54 
 
 
227 aa  89.7  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  42.35 
 
 
220 aa  89.7  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2815  dithiobiotin synthetase  40.8 
 
 
212 aa  89.7  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1910  dethiobiotin synthase  31.43 
 
 
204 aa  89.4  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0329  dithiobiotin synthetase  32.96 
 
 
239 aa  88.6  8e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1345  dethiobiotin synthase  36.42 
 
 
221 aa  88.6  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.408659  normal  0.0545266 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04561  putative dethiobiotin synthase  34.05 
 
 
232 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0717  dithiobiotin synthetase  40.8 
 
 
206 aa  88.2  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1640  dethiobiotin synthase  35.95 
 
 
224 aa  87.8  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.915447  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8310  Dethiobiotin synthase  34.47 
 
 
240 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3699  dethiobiotin synthase  37.14 
 
 
240 aa  87  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0969414  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  26.43 
 
 
228 aa  87  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2918  dithiobiotin synthetase  41.86 
 
 
202 aa  87.8  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.295464  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  31.43 
 
 
241 aa  86.7  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0820  dethiobiotin synthase  27.98 
 
 
186 aa  86.7  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.22019  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2098  dithiobiotin synthetase  37.43 
 
 
209 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.250318  normal  0.47001 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5562  dethiobiotin synthase  40.34 
 
 
210 aa  86.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  32.86 
 
 
248 aa  86.3  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2919  dithiobiotin synthetase  34.63 
 
 
213 aa  86.3  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1568  dethiobiotin synthase  37.93 
 
 
231 aa  85.9  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248853  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  40.12 
 
 
223 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2420  dithiobiotin synthetase  38.89 
 
 
213 aa  85.5  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.401456  normal  0.0742626 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0362  dithiobiotin synthetase  29.38 
 
 
239 aa  85.1  8e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356251  normal  0.0664813 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  35.96 
 
 
251 aa  85.1  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  35.96 
 
 
262 aa  85.1  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0621  dethiobiotin synthase  32.86 
 
 
219 aa  85.1  9e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0304  dethiobiotin synthase  26.7 
 
 
225 aa  85.1  9e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  34.86 
 
 
210 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  32.69 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4343  dithiobiotin synthetase  38.15 
 
 
213 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0906504 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0076  dethiobiotin synthase  45.05 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1911  dethiobiotin synthase  32.91 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2066  dithiobiotin synthetase  33.66 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  37.99 
 
 
474 aa  84  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0070  dethiobiotin synthase  45.11 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338425  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2384  dethiobiotin synthase  34.13 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.393597  normal  0.141052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  39.71 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  31.32 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0088  dethiobiotin synthase  44.81 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.021607  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  38.64 
 
 
226 aa  82  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0036  dethiobiotin synthase  34.3 
 
 
206 aa  82  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2053  dithiobiotin synthetase  34.55 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0534973 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1474  dithiobiotin synthetase  34.8 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  34.64 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2778  dithiobiotin synthetase  35.07 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.352107  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  37.57 
 
 
213 aa  81.3  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>