More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0088 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0088  dethiobiotin synthase  100 
 
 
223 aa  427  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.021607  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0076  dethiobiotin synthase  96.41 
 
 
223 aa  353  1e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0070  dethiobiotin synthase  95.07 
 
 
223 aa  347  7e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338425  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  72.65 
 
 
223 aa  283  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  51.81 
 
 
262 aa  161  8.000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  51.81 
 
 
251 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  47.89 
 
 
234 aa  159  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  41.78 
 
 
248 aa  149  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  44.83 
 
 
263 aa  144  9e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  43.06 
 
 
228 aa  143  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  48.02 
 
 
242 aa  142  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  47.78 
 
 
244 aa  142  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  38.04 
 
 
217 aa  137  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  41.09 
 
 
242 aa  136  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  47.43 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  45.64 
 
 
226 aa  135  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  44.02 
 
 
249 aa  135  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  41.87 
 
 
242 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  45.93 
 
 
241 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  42.36 
 
 
242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  41.87 
 
 
242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  41.87 
 
 
242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  41.87 
 
 
242 aa  132  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  40.1 
 
 
213 aa  132  5e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  39.57 
 
 
254 aa  131  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  41.38 
 
 
242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  41.38 
 
 
242 aa  129  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  41.38 
 
 
242 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  41.1 
 
 
226 aa  129  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  45.98 
 
 
243 aa  129  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  41.38 
 
 
242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  41.38 
 
 
242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0529  dethiobiotin synthase  45.07 
 
 
237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.256581  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  45.51 
 
 
233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  50 
 
 
220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  45.81 
 
 
266 aa  126  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  42.29 
 
 
243 aa  125  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  43.6 
 
 
248 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  36.31 
 
 
211 aa  124  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  41.76 
 
 
238 aa  123  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  42.29 
 
 
221 aa  123  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0304  dethiobiotin synthase  36.59 
 
 
225 aa  122  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  34.97 
 
 
646 aa  122  5e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2384  dethiobiotin synthase  44.39 
 
 
238 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.393597  normal  0.141052 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  46.07 
 
 
239 aa  121  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  43.82 
 
 
245 aa  121  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  42.86 
 
 
228 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  42.86 
 
 
230 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0323  dethiobiotin synthase  42.65 
 
 
227 aa  119  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0117307 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  42.29 
 
 
228 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  44.89 
 
 
239 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  42.29 
 
 
228 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  43.82 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  41.71 
 
 
230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  41.67 
 
 
230 aa  118  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  40.34 
 
 
225 aa  118  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  44.57 
 
 
240 aa  118  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2133  dethiobiotin synthase  43.58 
 
 
223 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  41.48 
 
 
226 aa  116  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  40.94 
 
 
238 aa  116  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0292  dethiobiotin synthase  47.49 
 
 
237 aa  116  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0765643  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  34.71 
 
 
212 aa  116  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  40.57 
 
 
225 aa  115  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45930  dithiobiotin synthetase  44.57 
 
 
231 aa  115  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  40.57 
 
 
225 aa  115  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  40.57 
 
 
225 aa  115  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  40.57 
 
 
225 aa  115  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  41.34 
 
 
226 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  40 
 
 
225 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  40 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  39.9 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  40 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0261  dethiobiotin synthase  34.13 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.909674  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  40 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1571  dethiobiotin synthase  49.43 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.706287 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  37.38 
 
 
243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1009  dethiobiotin synthase  47.51 
 
 
247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997802 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  42.56 
 
 
232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  34.23 
 
 
245 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  28.5 
 
 
228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  42.56 
 
 
230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  34.23 
 
 
240 aa  112  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2051  dethiobiotin synthase  42.13 
 
 
219 aa  112  5e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366532  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1373  dithiobiotin synthetase  44.13 
 
 
235 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.409918  normal  0.0708007 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0813  dethiobiotin synthase  36.23 
 
 
229 aa  112  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.448575  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0820  dethiobiotin synthase  36.18 
 
 
186 aa  111  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.22019  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  39.91 
 
 
234 aa  111  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  39.91 
 
 
234 aa  111  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  39.32 
 
 
210 aa  111  9e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1437  dithiobiotin synthetase  45.4 
 
 
235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.581627 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4031  dethiobiotin synthase  39.59 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.677394 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  33.78 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0392  dithiobiotin synthetase  39.66 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4836  dithiobiotin synthetase  40.78 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.519377 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0682  dethiobiotin synthase  44.81 
 
 
241 aa  109  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.199224  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  38.64 
 
 
226 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0621  dethiobiotin synthase  40.88 
 
 
219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  34.29 
 
 
244 aa  108  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  40.3 
 
 
216 aa  108  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  39.2 
 
 
227 aa  108  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>