More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2454 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2454  dethiobiotin synthase  100 
 
 		 224 aa  454  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.101684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2186  dethiobiotin synthase  62.5 
 
 		 227 aa  269  2.9999999999999997e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2835  dethiobiotin synthase  56.62 
 
 		 225 aa  254  6e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2426  dithiobiotin synthetase  59.35 
 
 		 229 aa  251  4.0000000000000004e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0082  dithiobiotin synthetase  55.19 
 
 		 227 aa  238  4e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0116  dithiobiotin synthetase  54.07 
 
 		 224 aa  223  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2066  dithiobiotin synthetase  52.15 
 
 		 231 aa  210  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1163  dethiobiotin synthase  48.94 
 
 		 255 aa  208  6e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0362  dithiobiotin synthetase  48 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356251  normal  0.0664813 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0329  dithiobiotin synthetase  47.84 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2053  dithiobiotin synthetase  48.34 
 
 		 217 aa  200  9.999999999999999e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0534973 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1160  dethiobiotin synthase  39.22 
 
 		 296 aa  171  5.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  39.77 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  37.16 
 
 		 239 aa  118  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  37.16 
 
 		 239 aa  118  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  37.77 
 
 		 242 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  36.52 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  33.86 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  35.59 
 
 		 226 aa  108  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  34.68 
 
 		 225 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  32.46 
 
 		 646 aa  106  3e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  36.52 
 
 		 240 aa  105  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  33.72 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  34.1 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  34.1 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  34.1 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  36.84 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  32.89 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  36.84 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  34.1 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  37.79 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  34.1 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  34.68 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  33.33 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  34.09 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  33.53 
 
 		 225 aa  102  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  33.53 
 
 		 225 aa  102  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  35.96 
 
 		 243 aa  101  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2946  dethiobiotin synthase  34.97 
 
 		 239 aa  101  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00040484  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  33.71 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  32.95 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  32.39 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0633  dithiobiotin synthetase  32.78 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  32.75 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  35.56 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  36.21 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1553  dethiobiotin synthetase  37.14 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  32.77 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  32.77 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  32.76 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  32.47 
 
 		 243 aa  99  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  35.5 
 
 		 242 aa  98.6  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  33.17 
 
 		 243 aa  98.2  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  32.16 
 
 		 245 aa  98.2  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  32.2 
 
 		 230 aa  98.2  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  34.32 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  32.2 
 
 		 228 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  32.2 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  38.89 
 
 		 241 aa  97.4  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5562  dethiobiotin synthase  37.87 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  34.32 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  29.56 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  31.12 
 
 		 226 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3711  dethiobiotin synthase  32.8 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00204232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  35.12 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0857  dithiobiotin synthetase  32.35 
 
 		 227 aa  96.3  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1431  dethiobiotin synthetase  36 
 
 		 212 aa  95.9  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16611  putative dethiobiotin synthase  32.94 
 
 		 232 aa  95.9  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1564  dethiobiotin synthase  32.94 
 
 		 221 aa  95.1  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1910  dethiobiotin synthase  33.52 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  34.71 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  33.52 
 
 		 248 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1009  dethiobiotin synthase  33.72 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997802 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16731  putative dethiobiotin synthase  32.35 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  34.71 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  34.12 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  34.29 
 
 		 266 aa  93.2  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  34.12 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1568  dethiobiotin synthase  32.47 
 
 		 231 aa  92.8  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248853  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3643  dethiobiotin synthase  32.77 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  34.71 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0682  dethiobiotin synthase  33.33 
 
 		 241 aa  92.4  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.199224  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  34.12 
 
 		 242 aa  92  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  34.12 
 
 		 242 aa  92  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01810  dithiobiotin synthetase  32.76 
 
 		 227 aa  92  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  34.32 
 
 		 210 aa  91.7  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  33.52 
 
 		 254 aa  92  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  33.16 
 
 		 244 aa  90.9  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4330  dithiobiotin synthetase  25.12 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15911  putative dethiobiotin synthase  34.86 
 
 		 242 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.454357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0823  dethiobiotin synthase  30.29 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2051  dethiobiotin synthase  34.27 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  32.29 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  35.06 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  31.25 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0003  dethiobiotin synthase  30.81 
 
 		 186 aa  90.9  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003868  dethiobiotin synthetase  32.18 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0820  dethiobiotin synthase  36.61 
 
 		 186 aa  90.1  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.22019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  30.05 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  32.06 
 
 		 245 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0554323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>