293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0082 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0082  dithiobiotin synthetase  100 
 
 
227 aa  462  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2835  dethiobiotin synthase  61.43 
 
 
225 aa  270  2e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2426  dithiobiotin synthetase  58.74 
 
 
229 aa  261  4.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0116  dithiobiotin synthetase  59.64 
 
 
224 aa  255  4e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2186  dethiobiotin synthase  56.44 
 
 
227 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2454  dethiobiotin synthase  55.19 
 
 
224 aa  238  4e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.101684  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2066  dithiobiotin synthetase  55.66 
 
 
231 aa  233  3e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0329  dithiobiotin synthetase  52.43 
 
 
239 aa  199  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0362  dithiobiotin synthetase  50.49 
 
 
239 aa  194  8.000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356251  normal  0.0664813 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1163  dethiobiotin synthase  54.4 
 
 
255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2053  dithiobiotin synthetase  51 
 
 
217 aa  188  5e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0534973 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1160  dethiobiotin synthase  45.99 
 
 
296 aa  167  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  36.07 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  35.23 
 
 
646 aa  108  8.000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  35.27 
 
 
226 aa  108  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  31.44 
 
 
263 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  36.98 
 
 
242 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  38.89 
 
 
226 aa  105  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  32.4 
 
 
243 aa  105  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  34.3 
 
 
243 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  37.16 
 
 
241 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  33.53 
 
 
211 aa  102  6e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  34.43 
 
 
228 aa  102  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  31.15 
 
 
239 aa  99.8  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  34.25 
 
 
217 aa  99.8  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  35.47 
 
 
264 aa  99.8  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  31.15 
 
 
239 aa  98.6  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  34.18 
 
 
238 aa  97.8  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2946  dethiobiotin synthase  33.16 
 
 
239 aa  95.9  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00040484  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  32.86 
 
 
254 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  36.47 
 
 
234 aa  93.2  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1568  dethiobiotin synthase  38.34 
 
 
231 aa  93.2  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248853  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  36.47 
 
 
234 aa  93.2  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  27.75 
 
 
228 aa  92.8  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  29.24 
 
 
212 aa  92.4  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1564  dethiobiotin synthase  32.06 
 
 
221 aa  92  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  32.93 
 
 
242 aa  91.7  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16611  putative dethiobiotin synthase  31.73 
 
 
232 aa  91.7  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  37.36 
 
 
249 aa  90.9  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0823  dethiobiotin synthase  27.91 
 
 
228 aa  91.7  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3711  dethiobiotin synthase  35.84 
 
 
237 aa  91.3  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00204232  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  31.94 
 
 
243 aa  90.1  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3096  dethiobiotin synthase  31.98 
 
 
238 aa  89.4  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0682  dethiobiotin synthase  32.54 
 
 
241 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.199224  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  33.18 
 
 
245 aa  89  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2778  dithiobiotin synthetase  39.16 
 
 
210 aa  88.6  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.352107  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  32.38 
 
 
248 aa  88.6  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  31.07 
 
 
240 aa  88.6  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  32.71 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  34.43 
 
 
234 aa  87.8  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  37.2 
 
 
241 aa  87.8  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  30.28 
 
 
210 aa  87  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  34.76 
 
 
244 aa  87  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4239  dithiobiotin synthetase  40.12 
 
 
212 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.528424 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2815  dithiobiotin synthetase  36.72 
 
 
212 aa  87  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1474  dithiobiotin synthetase  35.39 
 
 
202 aa  87  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  30.51 
 
 
245 aa  86.7  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  31.14 
 
 
242 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  30.51 
 
 
240 aa  86.7  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2919  dithiobiotin synthetase  37.08 
 
 
213 aa  86.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  31.03 
 
 
213 aa  86.3  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  31.82 
 
 
230 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  31.14 
 
 
242 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  31.46 
 
 
228 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2918  dithiobiotin synthetase  39.05 
 
 
202 aa  85.5  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.295464  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0490  dithiobiotin synthetase  37.5 
 
 
212 aa  85.1  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0428  dithiobiotin synthetase  37.5 
 
 
212 aa  85.1  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16731  putative dethiobiotin synthase  29.67 
 
 
221 aa  85.1  9e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  31.66 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  31.28 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  30.34 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  31.25 
 
 
228 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  31.14 
 
 
242 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5562  dethiobiotin synthase  37.06 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  30.34 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  30.34 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2420  dithiobiotin synthetase  37.29 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.401456  normal  0.0742626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  30.34 
 
 
225 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2051  dethiobiotin synthase  34.64 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366532  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  31.25 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  30.9 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0717  dithiobiotin synthetase  35.39 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  31.25 
 
 
230 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1009  dethiobiotin synthase  33.33 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997802 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  30 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  31.14 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  30.54 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  34.44 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0245  dethiobiotin synthase  29.76 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.67584  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  34.86 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3699  dethiobiotin synthase  36.67 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0969414  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0811  dethiobiotin synthase  32.18 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.624971  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  29.94 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  29.94 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85593  dethiobiotin synthetase  32.45 
 
 
217 aa  82  0.000000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  29.78 
 
 
225 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1553  dethiobiotin synthetase  30.5 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  30.94 
 
 
226 aa  81.6  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  29.78 
 
 
225 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  29.52 
 
 
242 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>