296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2835 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2835  dethiobiotin synthase  100 
 
 		 225 aa  450  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0082  dithiobiotin synthetase  61.43 
 
 		 227 aa  270  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2426  dithiobiotin synthetase  62.83 
 
 		 229 aa  266  2e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2454  dethiobiotin synthase  56.62 
 
 		 224 aa  254  6e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.101684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0116  dithiobiotin synthetase  58.93 
 
 		 224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2186  dethiobiotin synthase  57.66 
 
 		 227 aa  241  9e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2066  dithiobiotin synthetase  55.24 
 
 		 231 aa  225  5.0000000000000005e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1163  dethiobiotin synthase  52.61 
 
 		 255 aa  194  8.000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0362  dithiobiotin synthetase  51.92 
 
 		 239 aa  190  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356251  normal  0.0664813 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0329  dithiobiotin synthetase  50 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2053  dithiobiotin synthetase  49 
 
 		 217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0534973 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1160  dethiobiotin synthase  36.1 
 
 		 296 aa  149  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  37.89 
 
 		 242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  38.15 
 
 		 211 aa  113  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  34.18 
 
 		 646 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  35.42 
 
 		 217 aa  108  8.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  35.52 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  33.33 
 
 		 243 aa  105  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  33.88 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  35.2 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  35.2 
 
 		 239 aa  105  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  34.54 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  37.21 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  32.96 
 
 		 243 aa  101  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  35.63 
 
 		 244 aa  99  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0003  dethiobiotin synthase  31.85 
 
 		 186 aa  98.2  8e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  37.93 
 
 		 266 aa  97.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  35.96 
 
 		 234 aa  96.3  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0820  dethiobiotin synthase  30.41 
 
 		 186 aa  96.3  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.22019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  39.43 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  33.91 
 
 		 228 aa  95.5  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0823  dethiobiotin synthase  30.06 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  34.91 
 
 		 213 aa  94  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  31.66 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  30.26 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0682  dethiobiotin synthase  30.33 
 
 		 241 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.199224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  35.79 
 
 		 248 aa  92.4  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  35.84 
 
 		 234 aa  92  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1097  dethiobiotin synthase  31.68 
 
 		 190 aa  92  7e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110147  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  35.84 
 
 		 234 aa  92  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  33.7 
 
 		 249 aa  91.7  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  31.58 
 
 		 240 aa  91.7  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  35.06 
 
 		 226 aa  91.7  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1568  dethiobiotin synthase  34.54 
 
 		 231 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248853  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  32.18 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  36 
 
 		 254 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  30.99 
 
 		 240 aa  89.7  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  33.53 
 
 		 227 aa  90.1  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  33.33 
 
 		 262 aa  89.7  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  34.5 
 
 		 221 aa  90.1  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  33.5 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85593  dethiobiotin synthetase  35.98 
 
 		 217 aa  90.1  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  34.5 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  31.03 
 
 		 243 aa  89  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1431  dethiobiotin synthetase  32.45 
 
 		 212 aa  89  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  31.82 
 
 		 225 aa  89  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  32.76 
 
 		 225 aa  89  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  32.37 
 
 		 238 aa  88.2  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1553  dethiobiotin synthetase  32.98 
 
 		 212 aa  88.2  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  30.99 
 
 		 245 aa  88.6  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  32.39 
 
 		 226 aa  88.2  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  32.18 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  32.18 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  31.82 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  32.18 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2946  dethiobiotin synthase  35.14 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00040484  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  32.75 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  32.75 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  33.81 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  36 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  32.75 
 
 		 230 aa  85.9  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  31.61 
 
 		 225 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  32.75 
 
 		 228 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1009  dethiobiotin synthase  32.16 
 
 		 247 aa  85.5  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997802 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  31.61 
 
 		 225 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  32.75 
 
 		 228 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  30.17 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  30.6 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  32.94 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3096  dethiobiotin synthase  34.25 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  29.52 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  31.44 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1300  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  32 
 
 		 708 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0734897  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  30.68 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4330  dithiobiotin synthetase  27.18 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  32.43 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  35.29 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2420  dithiobiotin synthetase  37.65 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.401456  normal  0.0742626 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16611  putative dethiobiotin synthase  33.33 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3643  dethiobiotin synthase  31.82 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16731  putative dethiobiotin synthase  33.33 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  31.76 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0738  dethiobiotin synthase  31.87 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.232851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2815  dithiobiotin synthetase  34.88 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2919  dithiobiotin synthetase  37.29 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0030  dethiobiotin synthase  36.13 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82628  normal  0.806655 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18711  putative dethiobiotin synthase  33.15 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  30.26 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0460  dethiobiotin synthase  31.13 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00232018  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2051  dethiobiotin synthase  32.97 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366532  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>