More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0398 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  100 
 
 		 213 aa  436  1e-121  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  43.1 
 
 		 228 aa  138  7e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  37.56 
 
 		 243 aa  132  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0857  dithiobiotin synthetase  36.77 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  38.92 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  36.45 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  39.51 
 
 		 266 aa  128  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  33.63 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  35.37 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3643  dethiobiotin synthase  42.29 
 
 		 236 aa  126  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  35.47 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  39.41 
 
 		 248 aa  125  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  32.11 
 
 		 245 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0304  dethiobiotin synthase  33.02 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  32.11 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01810  dithiobiotin synthetase  37.31 
 
 		 227 aa  125  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  34.36 
 
 		 226 aa  124  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  37.19 
 
 		 242 aa  125  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  35.81 
 
 		 247 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  35.47 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  35.47 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  34.91 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  35.47 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  34.09 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2554  dethiobiotin synthase  38.83 
 
 		 287 aa  123  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0309873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  34.98 
 
 		 225 aa  123  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  36.45 
 
 		 230 aa  122  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  31.65 
 
 		 240 aa  122  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  35.56 
 
 		 254 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  34.98 
 
 		 225 aa  122  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  34.98 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  34.98 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  35.47 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  35.59 
 
 		 230 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  37.98 
 
 		 239 aa  121  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  37.29 
 
 		 238 aa  121  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  35.59 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  32.02 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  34.95 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  35.03 
 
 		 228 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0249  dithiobiotin synthetase  35.12 
 
 		 225 aa  119  1.9999999999999998e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  35.03 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  35.03 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1921  dethiobiotin synthase  31.46 
 
 		 235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0147663  decreased coverage  0.00139462 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  34.46 
 
 		 230 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02208  cobyrinic acid a,c-diamide synthase:dethiobiotin synthase  33.49 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.020926  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2773  dethiobiotin synthase  32.16 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0046697  hitchhiker  0.00857242 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0633  dithiobiotin synthetase  38.76 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  32.09 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5172  dithiobiotin synthetase  36.63 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0206613  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003868  dethiobiotin synthetase  35.82 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  33.33 
 
 		 225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4031  dethiobiotin synthase  40.68 
 
 		 240 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.677394 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2516  dithiobiotin synthetase  35.34 
 
 		 231 aa  115  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000238987 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2428  dithiobiotin synthetase  35.78 
 
 		 231 aa  115  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4084  dithiobiotin synthetase  36.76 
 
 		 228 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4836  dithiobiotin synthetase  35.78 
 
 		 226 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.519377 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  35.96 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2737  dithiobiotin synthetase  34.05 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  32.39 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2356  dithiobiotin synthetase  36.21 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1437  dithiobiotin synthetase  39.5 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.581627 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  34.34 
 
 		 217 aa  112  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1868  putative dithiobiotin synthetase  36.89 
 
 		 222 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218738  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1980  putative dithiobiotin synthetase  36.89 
 
 		 222 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1869  dethiobiotin synthase  36.36 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  decreased coverage  0.000000281099 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  32.16 
 
 		 242 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  36.62 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1373  dithiobiotin synthetase  38.5 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.409918  normal  0.0708007 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  36.27 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45930  dithiobiotin synthetase  36.63 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  34.42 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  37.57 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1798  dithiobiotin synthetase  32.38 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121118  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1804  dethiobiotin synthase  36.11 
 
 		 221 aa  108  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511205  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  33.82 
 
 		 226 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0498  dethiobiotin synthetase  35.15 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  37.44 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0392  dithiobiotin synthetase  33.82 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  37.13 
 
 		 240 aa  106  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2284  dethiobiotin synthase  34.65 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.165561 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2597  dethiobiotin synthase  30.73 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.204799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  40.98 
 
 		 241 aa  106  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  33.33 
 
 		 234 aa  106  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  33.33 
 
 		 234 aa  106  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0529  dethiobiotin synthase  36.49 
 
 		 237 aa  106  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.256581  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  34.33 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0329  dithiobiotin synthetase  35.83 
 
 		 239 aa  105  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1895  putative dithiobiotin synthetase  32.47 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  32.42 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2753  dithiobiotin synthetase  33.63 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  34.25 
 
 		 239 aa  104  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  32.88 
 
 		 226 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2045  putative dithiobiotin synthetase  38.42 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.154785  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  35 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0366  dithiobiotin synthetase  33.33 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.55843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1920  putative dithiobiotin synthetase  33.33 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0323  dethiobiotin synthase  38.51 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0117307 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1441  dithiobiotin synthetase  34.72 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00254947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1580  dithiobiotin synthetase  34.39 
 
 		 270 aa  102  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0294479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>