More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0323 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0323  dethiobiotin synthase  100 
 
 		 227 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0117307 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  54.73 
 
 		 226 aa  218  7e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  55.72 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  51.17 
 
 		 243 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0366  dithiobiotin synthetase  46.48 
 
 		 226 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.55843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  46.48 
 
 		 226 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0392  dithiobiotin synthetase  46.48 
 
 		 226 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4836  dithiobiotin synthetase  46.48 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.519377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4084  dithiobiotin synthetase  48.77 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  49.75 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0498  dethiobiotin synthetase  47.14 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  46.85 
 
 		 226 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  44.66 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  45.69 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1921  dethiobiotin synthase  42.36 
 
 		 235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0147663  decreased coverage  0.00139462 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  44.23 
 
 		 238 aa  172  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45930  dithiobiotin synthetase  46.45 
 
 		 231 aa  171  9e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5172  dithiobiotin synthetase  45.93 
 
 		 226 aa  170  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0206613  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1580  dithiobiotin synthetase  50 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0294479  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  46.7 
 
 		 245 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0529  dethiobiotin synthase  49.33 
 
 		 237 aa  169  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.256581  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  45.97 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1637  dithiobiotin synthetase  49.52 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  40.89 
 
 		 242 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2356  dithiobiotin synthetase  42.4 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  49.48 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1804  dethiobiotin synthase  41.95 
 
 		 221 aa  165  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511205  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2516  dithiobiotin synthetase  41.94 
 
 		 231 aa  166  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000238987 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0857  dithiobiotin synthetase  41.38 
 
 		 227 aa  165  5.9999999999999996e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  50.76 
 
 		 232 aa  164  8e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01810  dithiobiotin synthetase  41.9 
 
 		 227 aa  164  8e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  47.89 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2737  dithiobiotin synthetase  41.94 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2428  dithiobiotin synthetase  41.47 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1798  dithiobiotin synthetase  37.6 
 
 		 246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121118  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1722  dethiobiotin synthase  42.04 
 
 		 237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000192281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1163  dethiobiotin synthase  43.04 
 
 		 237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003868  dethiobiotin synthetase  42.38 
 
 		 228 aa  161  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2554  dethiobiotin synthase  42.08 
 
 		 287 aa  161  9e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0309873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0604  dithiobiotin synthetase  51.47 
 
 		 228 aa  161  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1129  dethiobiotin synthetase  51.22 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06570  dithiobiotin synthetase  50 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0633  dithiobiotin synthetase  41.38 
 
 		 238 aa  158  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2284  dethiobiotin synthase  42.18 
 
 		 223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.165561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  46.7 
 
 		 233 aa  155  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2773  dethiobiotin synthase  40.78 
 
 		 226 aa  155  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0046697  hitchhiker  0.00857242 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1661  dithiobiotin synthetase  41.28 
 
 		 231 aa  154  8e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0959  dethiobiotin synthase  48.64 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  42.36 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  45.19 
 
 		 248 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  40.89 
 
 		 245 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  42.65 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  40.89 
 
 		 240 aa  152  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4031  dethiobiotin synthase  48.11 
 
 		 240 aa  152  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.677394 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6277  dithiobiotin synthetase  48.8 
 
 		 239 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3643  dethiobiotin synthase  48.97 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  44.28 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  44.28 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1869  dethiobiotin synthase  38.36 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  decreased coverage  0.000000281099 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  40.39 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  39.45 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  40.98 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  39.82 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  39.82 
 
 		 228 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1478  dithiobiotin synthetase  39.82 
 
 		 236 aa  149  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  42.44 
 
 		 226 aa  148  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  39.37 
 
 		 228 aa  148  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1373  dithiobiotin synthetase  46.05 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.409918  normal  0.0708007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  38.53 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  40.38 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  40.98 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2132  putative dithiobiotin synthetase  38.71 
 
 		 223 aa  146  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2753  dithiobiotin synthetase  43.33 
 
 		 234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1754  dithiobiotin synthetase  38.43 
 
 		 246 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.235022  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0292  dethiobiotin synthase  46.08 
 
 		 237 aa  145  6e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0765643  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  40.87 
 
 		 225 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  40.87 
 
 		 225 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  40.87 
 
 		 225 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  40.87 
 
 		 225 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  40.87 
 
 		 225 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  40.87 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  40.87 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  41.18 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1868  putative dithiobiotin synthetase  38.35 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218738  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  41.71 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1980  putative dithiobiotin synthetase  38.35 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1895  putative dithiobiotin synthetase  39.15 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02208  cobyrinic acid a,c-diamide synthase:dethiobiotin synthase  40.09 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.020926  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0410  dithiobiotin synthetase  49.3 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0572  dithiobiotin synthetase  49.3 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  40.87 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1437  dithiobiotin synthetase  46.05 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.581627 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0389  dithiobiotin synthetase  49.3 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2342  dithiobiotin synthetase  39.47 
 
 		 247 aa  143  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2524  dithiobiotin synthetase  38.14 
 
 		 246 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.161209  normal  0.3539 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1761  dithiobiotin synthetase  38.14 
 
 		 246 aa  141  9e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2045  putative dithiobiotin synthetase  39.15 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.154785  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  40.1 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0249  dithiobiotin synthetase  39.72 
 
 		 225 aa  139  4.999999999999999e-32  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3842  dethiobiotin synthase  50 
 
 		 194 aa  138  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>