More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2887 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  100 
 
 		 226 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2384  dethiobiotin synthase  54.59 
 
 		 238 aa  198  5e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.393597  normal  0.141052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  50.24 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  50.24 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  45.54 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0261  dethiobiotin synthase  42.42 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.909674  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1887  dethiobiotin synthase  43.92 
 
 		 254 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4836  dithiobiotin synthetase  42.11 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.519377 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  40.59 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5172  dithiobiotin synthetase  40.95 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0206613  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2554  dethiobiotin synthase  37.16 
 
 		 287 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0309873  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  40 
 
 		 248 aa  126  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  40 
 
 		 239 aa  125  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0498  dethiobiotin synthetase  40.38 
 
 		 226 aa  124  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  40.19 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45930  dithiobiotin synthetase  42.38 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0392  dithiobiotin synthetase  39.23 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0529  dethiobiotin synthase  46.04 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.256581  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3643  dethiobiotin synthase  44.94 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  39.3 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  44.17 
 
 		 232 aa  122  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  39.5 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  41.79 
 
 		 248 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4084  dithiobiotin synthetase  43.14 
 
 		 228 aa  121  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  41.75 
 
 		 226 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4031  dethiobiotin synthase  41.55 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.677394 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  38.81 
 
 		 263 aa  119  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  41.95 
 
 		 266 aa  119  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0366  dithiobiotin synthetase  38.76 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.55843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  43.63 
 
 		 245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  36 
 
 		 240 aa  118  7.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  36 
 
 		 245 aa  118  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  38.6 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  39.11 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  42.16 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  39.71 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  36.68 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  39.5 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  35.5 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0292  dethiobiotin synthase  43.9 
 
 		 237 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0765643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1804  dethiobiotin synthase  39.71 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511205  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  43.08 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  33.33 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  43.84 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  36.18 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  36.18 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  35.68 
 
 		 238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  36.18 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  35.58 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  42.64 
 
 		 233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  38.92 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  36.18 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  40.57 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0323  dethiobiotin synthase  40.49 
 
 		 227 aa  112  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0117307 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  36.18 
 
 		 225 aa  112  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  35.68 
 
 		 225 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  35.68 
 
 		 225 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0088  dethiobiotin synthase  45.64 
 
 		 223 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.021607  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  34.67 
 
 		 230 aa  111  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0070  dethiobiotin synthase  45.64 
 
 		 223 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338425  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  36.18 
 
 		 225 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  39.43 
 
 		 264 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  34.17 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  34.17 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  34.17 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  34.67 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0813  dethiobiotin synthase  35.24 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.448575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1580  dithiobiotin synthetase  39.71 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0294479  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0304  dethiobiotin synthase  30.88 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  34.5 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  35.18 
 
 		 227 aa  108  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2876  dethiobiotin synthase  40.44 
 
 		 230 aa  108  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0082  dithiobiotin synthetase  35.27 
 
 		 227 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  36.14 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  37.44 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  28.24 
 
 		 646 aa  107  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2737  dithiobiotin synthetase  37.33 
 
 		 231 aa  106  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1637  dithiobiotin synthetase  39.22 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  33.33 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  40.56 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  42.7 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  39.52 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02208  cobyrinic acid a,c-diamide synthase:dethiobiotin synthase  33.96 
 
 		 233 aa  105  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.020926  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2428  dithiobiotin synthetase  36.67 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2516  dithiobiotin synthetase  36.87 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000238987 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0076  dethiobiotin synthase  45.64 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1163  dethiobiotin synthase  39.17 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  36.95 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2753  dithiobiotin synthetase  35.98 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  37.5 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  33.17 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2454  dethiobiotin synthase  32.89 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.101684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2356  dithiobiotin synthetase  36.67 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2133  dethiobiotin synthase  33.5 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  32.84 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  37.37 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  32.84 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  40.54 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  40.54 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  34.65 
 
 		 227 aa  102  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>