More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2384 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2384  dethiobiotin synthase  100 
 
 		 238 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.393597  normal  0.141052 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  54.59 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  49.26 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  49.26 
 
 		 251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0261  dethiobiotin synthase  40 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.909674  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  44.33 
 
 		 228 aa  132  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1887  dethiobiotin synthase  41.38 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  37.14 
 
 		 263 aa  122  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  40.78 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  40.91 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4084  dithiobiotin synthetase  44.28 
 
 		 228 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  43.48 
 
 		 232 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  40.34 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  42.86 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  41.87 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45930  dithiobiotin synthetase  42.86 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0498  dethiobiotin synthetase  42.93 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  35.48 
 
 		 242 aa  115  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4836  dithiobiotin synthetase  41.87 
 
 		 226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.519377 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5172  dithiobiotin synthetase  43.43 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0206613  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  40.17 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  43.94 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  38.84 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0392  dithiobiotin synthetase  41.95 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  41.46 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  41.71 
 
 		 248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  38.71 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  39.66 
 
 		 264 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  40.72 
 
 		 239 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  38.65 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0366  dithiobiotin synthetase  41.46 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.55843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2133  dethiobiotin synthase  38.83 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  39.35 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  37.68 
 
 		 238 aa  108  8.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0070  dethiobiotin synthase  43.35 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338425  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  34.09 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1804  dethiobiotin synthase  38.5 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511205  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2554  dethiobiotin synthase  35.85 
 
 		 287 aa  105  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0309873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  36.19 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1869  dethiobiotin synthase  36.36 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  decreased coverage  0.000000281099 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0088  dethiobiotin synthase  42.86 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.021607  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  39.58 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0292  dethiobiotin synthase  43.78 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0765643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  36.59 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1867  dethiobiotin synthase  39.89 
 
 		 223 aa  101  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  36.59 
 
 		 240 aa  102  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0738  dethiobiotin synthase  39.11 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.232851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  33.19 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6356  dethiobiotin synthase  42.78 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2773  dethiobiotin synthase  34.1 
 
 		 226 aa  99.4  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0046697  hitchhiker  0.00857242 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3643  dethiobiotin synthase  42.86 
 
 		 236 aa  99.8  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  34.74 
 
 		 248 aa  99  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  43.18 
 
 		 223 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  37.22 
 
 		 254 aa  98.6  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  41.48 
 
 		 233 aa  98.6  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0076  dethiobiotin synthase  43.41 
 
 		 223 aa  98.2  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2737  dithiobiotin synthetase  36.53 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  42.86 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  39.46 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  42.86 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2428  dithiobiotin synthetase  37.56 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1345  dethiobiotin synthase  34.54 
 
 		 221 aa  97.4  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.408659  normal  0.0545266 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5169  dethiobiotin synthase  43.89 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456743  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0813  dethiobiotin synthase  33.63 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.448575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0529  dethiobiotin synthase  40.59 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.256581  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1373  dithiobiotin synthetase  41.67 
 
 		 235 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.409918  normal  0.0708007 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  33 
 
 		 242 aa  95.9  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2356  dithiobiotin synthetase  37.56 
 
 		 231 aa  95.9  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  38.35 
 
 		 266 aa  95.9  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2611  dethiobiotin synthase  35.85 
 
 		 225 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  32.51 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1437  dithiobiotin synthetase  40.61 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.581627 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4031  dethiobiotin synthase  43.65 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.677394 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0323  dethiobiotin synthase  37.16 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0117307 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  32.51 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2516  dithiobiotin synthetase  38.46 
 
 		 231 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000238987 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  38.29 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0304  dethiobiotin synthase  31 
 
 		 225 aa  93.6  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  37.78 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  38.76 
 
 		 230 aa  92.8  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  32.37 
 
 		 211 aa  92.8  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  35.18 
 
 		 220 aa  92.8  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  33.49 
 
 		 213 aa  92.4  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  31.53 
 
 		 242 aa  92  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  32.51 
 
 		 242 aa  92  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  34.67 
 
 		 225 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  33.5 
 
 		 238 aa  91.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  27.44 
 
 		 646 aa  90.9  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  35.35 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6277  dithiobiotin synthetase  45.56 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2332  dethiobiotin synthase  34.91 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.323651  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  35.35 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  35.35 
 
 		 225 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0410  dithiobiotin synthetase  46.15 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  35.35 
 
 		 225 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  27.51 
 
 		 243 aa  89.7  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0572  dithiobiotin synthetase  46.15 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  35.35 
 
 		 225 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  37.36 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0389  dithiobiotin synthetase  46.15 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>