More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1459 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  100 
 
 
244 aa  476  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  46.64 
 
 
243 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  47.23 
 
 
240 aa  181  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  46.15 
 
 
264 aa  174  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  46.41 
 
 
243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  46.38 
 
 
239 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  45.53 
 
 
241 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  44.81 
 
 
239 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  42.93 
 
 
242 aa  154  9e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  43.86 
 
 
234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  43.13 
 
 
242 aa  146  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  43.13 
 
 
242 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  41.63 
 
 
263 aa  145  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  41.35 
 
 
242 aa  145  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  41.83 
 
 
242 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  45.37 
 
 
241 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  41.95 
 
 
242 aa  143  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  40.87 
 
 
242 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  40.09 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  41.23 
 
 
242 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  41.23 
 
 
242 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  41.23 
 
 
242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  41.23 
 
 
242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  35.44 
 
 
244 aa  135  8e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  43.75 
 
 
234 aa  132  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  43.75 
 
 
234 aa  132  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  40.28 
 
 
249 aa  129  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  39.91 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  42.13 
 
 
220 aa  125  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  35.22 
 
 
211 aa  125  7e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  39.09 
 
 
217 aa  124  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  37.5 
 
 
245 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  37.5 
 
 
247 aa  121  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  44.85 
 
 
223 aa  121  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  36.54 
 
 
212 aa  121  9e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0304  dethiobiotin synthase  36.16 
 
 
225 aa  121  9e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  40 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  39.74 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  38.73 
 
 
266 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  32.16 
 
 
238 aa  118  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  41.62 
 
 
228 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  38.6 
 
 
233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0076  dethiobiotin synthase  47.78 
 
 
223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0088  dethiobiotin synthase  47.78 
 
 
223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.021607  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1437  dithiobiotin synthetase  39.38 
 
 
235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.581627 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  35.89 
 
 
230 aa  111  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1373  dithiobiotin synthetase  39.21 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.409918  normal  0.0708007 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  36.56 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  34.83 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  34.1 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0070  dethiobiotin synthase  46.8 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338425  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  39.01 
 
 
226 aa  109  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1568  dethiobiotin synthase  41.54 
 
 
231 aa  109  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248853  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2384  dethiobiotin synthase  37.12 
 
 
238 aa  108  6e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.393597  normal  0.141052 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0820  dethiobiotin synthase  33.15 
 
 
186 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.22019  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  37.16 
 
 
226 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  41.38 
 
 
232 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3643  dethiobiotin synthase  35.89 
 
 
236 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1722  dethiobiotin synthase  35.81 
 
 
237 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000192281  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0261  dethiobiotin synthase  33.68 
 
 
219 aa  106  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.909674  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2753  dithiobiotin synthetase  35.96 
 
 
234 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  38.01 
 
 
210 aa  105  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0498  dethiobiotin synthetase  36.62 
 
 
226 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0362  dithiobiotin synthetase  32.18 
 
 
239 aa  105  9e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356251  normal  0.0664813 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0329  dithiobiotin synthetase  32.43 
 
 
239 aa  104  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1911  dethiobiotin synthase  35.44 
 
 
227 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3699  dethiobiotin synthase  40.49 
 
 
240 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0969414  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  40 
 
 
248 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4084  dithiobiotin synthetase  37.75 
 
 
228 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610971  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2428  dithiobiotin synthetase  31.2 
 
 
231 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  37.5 
 
 
226 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45930  dithiobiotin synthetase  37.26 
 
 
231 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6277  dithiobiotin synthetase  37.5 
 
 
239 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2454  dethiobiotin synthase  37.79 
 
 
224 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.101684  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0572  dithiobiotin synthetase  41.15 
 
 
240 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0410  dithiobiotin synthetase  41.15 
 
 
240 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2356  dithiobiotin synthetase  31.2 
 
 
231 aa  102  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0389  dithiobiotin synthetase  41.15 
 
 
240 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  45.45 
 
 
216 aa  101  8e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0003  dethiobiotin synthase  34.62 
 
 
186 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  29.25 
 
 
243 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2053  dithiobiotin synthetase  36.41 
 
 
217 aa  100  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0534973 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2946  dethiobiotin synthase  28.83 
 
 
239 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00040484  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  34.48 
 
 
254 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1804  dethiobiotin synthase  33.66 
 
 
221 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511205  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0529  dethiobiotin synthase  40.86 
 
 
237 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.256581  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4836  dithiobiotin synthetase  34.74 
 
 
226 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.519377 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2737  dithiobiotin synthetase  31.62 
 
 
231 aa  100  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1097  dethiobiotin synthase  34.18 
 
 
190 aa  99.8  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110147  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  34.48 
 
 
225 aa  99  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  34.84 
 
 
474 aa  99  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0813  dethiobiotin synthase  38.29 
 
 
229 aa  99  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.448575  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2835  dethiobiotin synthase  35.63 
 
 
225 aa  99  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0392  dithiobiotin synthetase  34.42 
 
 
226 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4031  dethiobiotin synthase  34.45 
 
 
240 aa  98.2  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.677394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  34.74 
 
 
226 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1910  dethiobiotin synthase  33.33 
 
 
204 aa  97.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10780  dethiobiotin synthase  40.98 
 
 
240 aa  97.1  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  34.65 
 
 
230 aa  97.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  32.54 
 
 
210 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>