More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2369 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  100 
 
 
264 aa  530  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  60.83 
 
 
243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  56.54 
 
 
243 aa  276  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  61.28 
 
 
240 aa  275  4e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  59.15 
 
 
239 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  58.72 
 
 
239 aa  271  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  61.6 
 
 
241 aa  270  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  46.15 
 
 
244 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  43.64 
 
 
263 aa  172  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  41.63 
 
 
242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  45.35 
 
 
211 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  40.95 
 
 
242 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  45.27 
 
 
241 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  40.99 
 
 
242 aa  142  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  42.59 
 
 
228 aa  142  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  39.66 
 
 
242 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  40.72 
 
 
242 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  38.39 
 
 
242 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  38.79 
 
 
242 aa  139  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  40.27 
 
 
242 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  43.89 
 
 
234 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  40.27 
 
 
242 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  40.27 
 
 
242 aa  135  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  40.27 
 
 
242 aa  135  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  40.27 
 
 
242 aa  135  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0823  dethiobiotin synthase  34.8 
 
 
228 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  37.57 
 
 
217 aa  130  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4330  dithiobiotin synthetase  32.46 
 
 
228 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112465  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  37.73 
 
 
245 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  36.87 
 
 
238 aa  123  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  32.6 
 
 
228 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  38.51 
 
 
212 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  38.22 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  41.48 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  41.48 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  31.48 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0820  dethiobiotin synthase  40.94 
 
 
186 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.22019  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  30.99 
 
 
243 aa  120  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  37 
 
 
230 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0304  dethiobiotin synthase  35.05 
 
 
225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1097  dethiobiotin synthase  39.22 
 
 
190 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110147  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  35 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  35.91 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1568  dethiobiotin synthase  40.21 
 
 
231 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248853  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0003  dethiobiotin synthase  38.82 
 
 
186 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0323  dethiobiotin synthase  44.61 
 
 
227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0117307 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  42.7 
 
 
226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  39.43 
 
 
226 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1752  dethiobiotin synthase  35.71 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00909358  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3711  dethiobiotin synthase  36.57 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00204232  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3096  dethiobiotin synthase  31.98 
 
 
238 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  34.5 
 
 
239 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0517  dethiobiotin synthase  37.71 
 
 
221 aa  108  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0354098  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1129  dethiobiotin synthetase  46.06 
 
 
228 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4084  dithiobiotin synthetase  35.29 
 
 
228 aa  106  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610971  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  35.12 
 
 
221 aa  105  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  42.25 
 
 
223 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2186  dethiobiotin synthase  35.09 
 
 
227 aa  104  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  33.49 
 
 
226 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  35.04 
 
 
242 aa  104  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  35.32 
 
 
474 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  33.5 
 
 
248 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3699  dethiobiotin synthase  35 
 
 
240 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0969414  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  35.5 
 
 
213 aa  103  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2835  dethiobiotin synthase  37.21 
 
 
225 aa  103  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0070  dethiobiotin synthase  46.86 
 
 
223 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338425  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1474  dithiobiotin synthetase  37.1 
 
 
202 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0030  dethiobiotin synthase  37.5 
 
 
210 aa  103  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82628  normal  0.806655 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0088  dethiobiotin synthase  47.43 
 
 
223 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.021607  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  36.78 
 
 
220 aa  102  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2384  dethiobiotin synthase  39.34 
 
 
238 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.393597  normal  0.141052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8310  Dethiobiotin synthase  34.98 
 
 
240 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  35.35 
 
 
238 aa  102  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  36.65 
 
 
226 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  33 
 
 
227 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2133  dethiobiotin synthase  38.86 
 
 
223 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0498  dethiobiotin synthetase  36.89 
 
 
226 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6277  dithiobiotin synthetase  36.45 
 
 
239 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2946  dethiobiotin synthase  28.27 
 
 
239 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00040484  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  34.84 
 
 
226 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0292  dethiobiotin synthase  36.56 
 
 
237 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0765643  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  37.27 
 
 
210 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0682  dethiobiotin synthase  36.99 
 
 
241 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.199224  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  33.48 
 
 
266 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1910  dethiobiotin synthase  34.31 
 
 
204 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2454  dethiobiotin synthase  35.56 
 
 
224 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.101684  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  34.45 
 
 
225 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0082  dithiobiotin synthetase  35.47 
 
 
227 aa  99.8  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4836  dithiobiotin synthetase  33.04 
 
 
226 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.519377 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0633  dithiobiotin synthetase  33.33 
 
 
238 aa  99.4  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  31.98 
 
 
646 aa  99.4  5e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0076  dethiobiotin synthase  46.86 
 
 
223 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  36.63 
 
 
234 aa  99  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  36.63 
 
 
234 aa  99  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  33.77 
 
 
254 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0857  dithiobiotin synthetase  32.79 
 
 
227 aa  98.2  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  38.29 
 
 
248 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0717  dithiobiotin synthetase  39.77 
 
 
206 aa  97.4  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  31.46 
 
 
225 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  33.62 
 
 
232 aa  96.3  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.579086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>