297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2133 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2133  dethiobiotin synthase  100 
 
 
223 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0813  dethiobiotin synthase  54.91 
 
 
229 aa  228  4e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.448575  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1867  dethiobiotin synthase  47.03 
 
 
223 aa  179  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0738  dethiobiotin synthase  45.37 
 
 
223 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.232851  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0040  dethiobiotin synthase  49.5 
 
 
215 aa  165  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2876  dethiobiotin synthase  50 
 
 
230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1345  dethiobiotin synthase  44.65 
 
 
221 aa  161  7e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.408659  normal  0.0545266 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6356  dethiobiotin synthase  51.87 
 
 
225 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5169  dethiobiotin synthase  48.34 
 
 
225 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456743  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0888  dethiobiotin synthase  38.76 
 
 
231 aa  150  2e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1110  dethiobiotin synthetase  37.43 
 
 
230 aa  148  8e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.588199  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2287  dethiobiotin synthase  42.58 
 
 
225 aa  139  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2611  dethiobiotin synthase  43.48 
 
 
225 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2332  dethiobiotin synthase  43.48 
 
 
225 aa  138  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.323651  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1431  dethiobiotin synthetase  35.15 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1553  dethiobiotin synthetase  35.78 
 
 
212 aa  129  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  39.46 
 
 
234 aa  123  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  40.11 
 
 
251 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  40.11 
 
 
262 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  37.09 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  37.62 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1300  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  43.86 
 
 
708 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0734897  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  33.17 
 
 
646 aa  113  3e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  43.48 
 
 
216 aa  106  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5172  dithiobiotin synthetase  39.9 
 
 
226 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0206613  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  35.44 
 
 
239 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  33.5 
 
 
226 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  33.78 
 
 
264 aa  102  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1910  dethiobiotin synthase  37.5 
 
 
204 aa  102  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2384  dethiobiotin synthase  36.59 
 
 
238 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.393597  normal  0.141052 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  33.99 
 
 
213 aa  102  5e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  33.17 
 
 
221 aa  101  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  32.63 
 
 
230 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0030  dethiobiotin synthase  34.23 
 
 
210 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82628  normal  0.806655 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1163  dethiobiotin synthase  35.33 
 
 
255 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  31.93 
 
 
238 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  34.83 
 
 
248 aa  99.8  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0304  dethiobiotin synthase  33 
 
 
225 aa  99.4  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  31.71 
 
 
242 aa  99  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  35.39 
 
 
242 aa  99  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  35.96 
 
 
226 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  29.56 
 
 
217 aa  98.2  9e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0392  dithiobiotin synthetase  35.96 
 
 
226 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  35.38 
 
 
228 aa  97.8  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0362  dithiobiotin synthetase  31.5 
 
 
239 aa  97.8  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356251  normal  0.0664813 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  29.5 
 
 
242 aa  97.1  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  36.11 
 
 
226 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  27.72 
 
 
228 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2753  dithiobiotin synthetase  35.1 
 
 
234 aa  97.1  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4084  dithiobiotin synthetase  36.14 
 
 
228 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610971  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  38.33 
 
 
254 aa  95.5  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  37.28 
 
 
210 aa  95.1  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  29.27 
 
 
242 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0329  dithiobiotin synthetase  30.17 
 
 
239 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5562  dethiobiotin synthase  36.36 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02208  cobyrinic acid a,c-diamide synthase:dethiobiotin synthase  32.08 
 
 
233 aa  94.4  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.020926  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2186  dethiobiotin synthase  37.02 
 
 
227 aa  94  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2098  dithiobiotin synthetase  39.63 
 
 
209 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.250318  normal  0.47001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0366  dithiobiotin synthetase  35.47 
 
 
226 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.55843  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  30.73 
 
 
242 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  32.84 
 
 
226 aa  94  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  29.27 
 
 
242 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45930  dithiobiotin synthetase  35.21 
 
 
231 aa  94  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1163  dethiobiotin synthase  39.18 
 
 
237 aa  93.2  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  30.73 
 
 
242 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4031  dethiobiotin synthase  36.84 
 
 
240 aa  93.2  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.677394 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  40.45 
 
 
223 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  33.67 
 
 
226 aa  92.4  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4330  dithiobiotin synthetase  27.15 
 
 
228 aa  92  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112465  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  34 
 
 
225 aa  92  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0036  dethiobiotin synthase  35.32 
 
 
206 aa  92  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  36.57 
 
 
243 aa  92  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0529  dethiobiotin synthase  37.25 
 
 
237 aa  91.7  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.256581  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0088  dethiobiotin synthase  43.02 
 
 
223 aa  91.7  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.021607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  35.44 
 
 
240 aa  90.9  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  35.5 
 
 
234 aa  90.1  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  35.5 
 
 
234 aa  90.1  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  35.44 
 
 
245 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  33.83 
 
 
226 aa  90.5  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0498  dethiobiotin synthetase  35.02 
 
 
226 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4836  dithiobiotin synthetase  34.48 
 
 
226 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.519377 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  32.77 
 
 
242 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  33.82 
 
 
242 aa  89.7  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  30.88 
 
 
230 aa  90.1  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  34 
 
 
225 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  34 
 
 
225 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  34 
 
 
225 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  35.44 
 
 
240 aa  89.4  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  30.73 
 
 
220 aa  89  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  36.78 
 
 
210 aa  89  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  30.69 
 
 
225 aa  88.6  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16611  putative dethiobiotin synthase  27.36 
 
 
232 aa  88.6  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  33.33 
 
 
244 aa  88.6  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  32.97 
 
 
249 aa  88.6  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1564  dethiobiotin synthase  26.6 
 
 
221 aa  88.6  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15911  putative dethiobiotin synthase  34.1 
 
 
242 aa  88.2  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.454357  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1002  dethiobiotin synthase  33.7 
 
 
216 aa  88.6  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  34 
 
 
225 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  32.66 
 
 
225 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1921  dethiobiotin synthase  28.71 
 
 
235 aa  88.6  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0147663  decreased coverage  0.00139462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>