297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0261 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0261  dethiobiotin synthase  100 
 
 		 219 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.909674  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  42.42 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  38.16 
 
 		 251 aa  142  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  38.16 
 
 		 262 aa  142  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2384  dethiobiotin synthase  40 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.393597  normal  0.141052 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  39.91 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  42.35 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  40 
 
 		 238 aa  118  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  36.36 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  35.58 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  38 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0498  dethiobiotin synthetase  40.51 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0392  dithiobiotin synthetase  43.26 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  32.73 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  38.1 
 
 		 263 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45930  dithiobiotin synthetase  40.1 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0304  dethiobiotin synthase  35.5 
 
 		 225 aa  108  8.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0366  dithiobiotin synthetase  42.7 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.55843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  33.33 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  37.2 
 
 		 266 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  41.21 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  39.2 
 
 		 247 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  41.75 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  39.06 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  38.59 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2753  dithiobiotin synthetase  39.29 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  35.82 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  35.82 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0329  dithiobiotin synthetase  36.32 
 
 		 239 aa  106  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  43.26 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5172  dithiobiotin synthetase  41.21 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0206613  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  35.82 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  33.68 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1804  dethiobiotin synthase  37.86 
 
 		 221 aa  106  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511205  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  35.82 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  35.32 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  35.32 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  35.32 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  35.82 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  34.15 
 
 		 240 aa  105  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  34.15 
 
 		 245 aa  104  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  37.07 
 
 		 243 aa  104  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4836  dithiobiotin synthetase  42.86 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.519377 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  36.81 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  36.19 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4084  dithiobiotin synthetase  40.86 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  35.32 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  36.16 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1163  dethiobiotin synthase  41.11 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02208  cobyrinic acid a,c-diamide synthase:dethiobiotin synthase  35.48 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.020926  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  33.66 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  32.85 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2773  dethiobiotin synthase  37.02 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0046697  hitchhiker  0.00857242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0529  dethiobiotin synthase  38.92 
 
 		 237 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.256581  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1373  dithiobiotin synthetase  41.01 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.409918  normal  0.0708007 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  34.95 
 
 		 234 aa  101  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  34.95 
 
 		 234 aa  101  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2554  dethiobiotin synthase  34.98 
 
 		 287 aa  101  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0309873  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0362  dithiobiotin synthetase  34.04 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356251  normal  0.0664813 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  33.33 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  39.18 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2737  dithiobiotin synthetase  37.62 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  32.54 
 
 		 242 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  33.98 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1437  dithiobiotin synthetase  38.38 
 
 		 235 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.581627 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  32.54 
 
 		 242 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2428  dithiobiotin synthetase  37.07 
 
 		 231 aa  99  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  34.46 
 
 		 228 aa  98.6  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  34.46 
 
 		 230 aa  98.2  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  31.88 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  35.2 
 
 		 228 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  31.88 
 
 		 242 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  31.58 
 
 		 242 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  35.2 
 
 		 230 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  35.2 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  31.88 
 
 		 242 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  31.88 
 
 		 242 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1887  dethiobiotin synthase  31.36 
 
 		 254 aa  97.1  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0323  dethiobiotin synthase  36.68 
 
 		 227 aa  96.3  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0117307 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0076  dethiobiotin synthase  34.13 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1553  dethiobiotin synthetase  35.32 
 
 		 212 aa  95.5  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  36.11 
 
 		 239 aa  95.9  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  32.06 
 
 		 242 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2516  dithiobiotin synthetase  35.05 
 
 		 231 aa  95.5  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000238987 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  34.46 
 
 		 238 aa  95.9  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1798  dithiobiotin synthetase  35.84 
 
 		 246 aa  95.5  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121118  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  32.45 
 
 		 213 aa  95.5  6e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1661  dithiobiotin synthetase  39.09 
 
 		 231 aa  95.1  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  36.31 
 
 		 239 aa  95.1  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2356  dithiobiotin synthetase  36.59 
 
 		 231 aa  95.1  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1479  dithiobiotin synthetase  41.44 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0324532  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  36.87 
 
 		 264 aa  94.4  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0070  dethiobiotin synthase  34.62 
 
 		 223 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338425  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1869  dethiobiotin synthase  38.1 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  decreased coverage  0.000000281099 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  34.86 
 
 		 226 aa  93.2  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  37.3 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0088  dethiobiotin synthase  34.13 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.021607  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  30.92 
 
 		 242 aa  93.2  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1431  dethiobiotin synthetase  33.33 
 
 		 212 aa  92.8  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0292  dethiobiotin synthase  37.57 
 
 		 237 aa  91.7  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0765643  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>