299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1431 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1431  dethiobiotin synthetase  100 
 
 
212 aa  439  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1553  dethiobiotin synthetase  96.7 
 
 
212 aa  429  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  39.73 
 
 
242 aa  165  4e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1722  dethiobiotin synthase  39.71 
 
 
237 aa  159  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000192281  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  42.05 
 
 
228 aa  159  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1804  dethiobiotin synthase  40.76 
 
 
221 aa  157  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511205  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2773  dethiobiotin synthase  41.29 
 
 
226 aa  155  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0046697  hitchhiker  0.00857242 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2428  dithiobiotin synthetase  39.35 
 
 
231 aa  154  8e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2356  dithiobiotin synthetase  39.35 
 
 
231 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5172  dithiobiotin synthetase  41 
 
 
226 aa  152  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0206613  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02208  cobyrinic acid a,c-diamide synthase:dethiobiotin synthase  40.74 
 
 
233 aa  151  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.020926  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2737  dithiobiotin synthetase  38.43 
 
 
231 aa  151  8e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  42 
 
 
226 aa  151  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4084  dithiobiotin synthetase  40.39 
 
 
228 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610971  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2554  dethiobiotin synthase  40.48 
 
 
287 aa  149  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0309873  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2516  dithiobiotin synthetase  38.14 
 
 
231 aa  149  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000238987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1798  dithiobiotin synthetase  36.52 
 
 
246 aa  147  8e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121118  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1869  dethiobiotin synthase  39.6 
 
 
222 aa  143  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  decreased coverage  0.000000281099 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2597  dethiobiotin synthase  35.98 
 
 
263 aa  143  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.204799  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  37.38 
 
 
226 aa  143  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  38.46 
 
 
230 aa  143  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  38.35 
 
 
226 aa  142  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1478  dithiobiotin synthetase  37.56 
 
 
236 aa  142  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0392  dithiobiotin synthetase  36.63 
 
 
226 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  37.5 
 
 
227 aa  142  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0498  dethiobiotin synthetase  39.5 
 
 
226 aa  141  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4836  dithiobiotin synthetase  36.14 
 
 
226 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.519377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  36.14 
 
 
226 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  37.09 
 
 
226 aa  139  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0366  dithiobiotin synthetase  36.14 
 
 
226 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.55843  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45930  dithiobiotin synthetase  38 
 
 
231 aa  138  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1441  dithiobiotin synthetase  36.59 
 
 
230 aa  138  7e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00254947  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  37.69 
 
 
238 aa  137  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  37.68 
 
 
228 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  37.62 
 
 
225 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  38.12 
 
 
243 aa  136  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  36.82 
 
 
226 aa  136  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  37.38 
 
 
221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  37.68 
 
 
230 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  37.56 
 
 
225 aa  135  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  37.56 
 
 
225 aa  135  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  37.56 
 
 
225 aa  135  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  37.68 
 
 
230 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  37.68 
 
 
228 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  37.68 
 
 
228 aa  134  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  37.2 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1761  dithiobiotin synthetase  37.38 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  37.2 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  37.2 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  37.75 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2753  dithiobiotin synthetase  34.5 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1754  dithiobiotin synthetase  37.33 
 
 
246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.235022  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  37.07 
 
 
225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  36.32 
 
 
225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  36.32 
 
 
245 aa  132  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1921  dethiobiotin synthase  36.92 
 
 
235 aa  132  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0147663  decreased coverage  0.00139462 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  36.32 
 
 
240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  35.96 
 
 
230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  37.07 
 
 
225 aa  132  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  36.68 
 
 
227 aa  131  6.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  37.5 
 
 
245 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2133  dethiobiotin synthase  34.98 
 
 
223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2524  dithiobiotin synthetase  36.09 
 
 
246 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.161209  normal  0.3539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  34.65 
 
 
266 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  35.85 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  35.44 
 
 
239 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2342  dithiobiotin synthetase  37.17 
 
 
247 aa  129  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1661  dithiobiotin synthetase  37.24 
 
 
231 aa  129  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  37.02 
 
 
254 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  37.5 
 
 
247 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1163  dethiobiotin synthase  38.14 
 
 
237 aa  127  9.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0633  dithiobiotin synthetase  35.92 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  34.47 
 
 
238 aa  126  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  37 
 
 
248 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0857  dithiobiotin synthetase  34.8 
 
 
227 aa  125  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01810  dithiobiotin synthetase  32.84 
 
 
227 aa  125  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003868  dethiobiotin synthetase  32.84 
 
 
228 aa  123  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06570  dithiobiotin synthetase  40.78 
 
 
228 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803425  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0604  dithiobiotin synthetase  38.92 
 
 
228 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  34.48 
 
 
233 aa  121  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0249  dithiobiotin synthetase  35.47 
 
 
225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3643  dethiobiotin synthase  35.42 
 
 
236 aa  118  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0529  dethiobiotin synthase  35.47 
 
 
237 aa  117  9e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.256581  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1895  putative dithiobiotin synthetase  36.24 
 
 
221 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  32.47 
 
 
646 aa  114  7.999999999999999e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0813  dethiobiotin synthase  32.84 
 
 
229 aa  114  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.448575  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  32.24 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  32.24 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1373  dithiobiotin synthetase  34.34 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.409918  normal  0.0708007 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2346  putative dithiobiotin synthetase  34.68 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.237745  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1580  dithiobiotin synthetase  34.18 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0294479  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6277  dithiobiotin synthetase  36.89 
 
 
239 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1437  dithiobiotin synthetase  34.85 
 
 
235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.581627 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2045  putative dithiobiotin synthetase  35.07 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.154785  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1637  dithiobiotin synthetase  33.17 
 
 
226 aa  111  9e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0323  dethiobiotin synthase  33.5 
 
 
227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0117307 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0292  dethiobiotin synthase  37.37 
 
 
237 aa  109  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0765643  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2132  putative dithiobiotin synthetase  32.86 
 
 
223 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0410  dithiobiotin synthetase  36.14 
 
 
240 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0389  dithiobiotin synthetase  36.14 
 
 
240 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>