287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2597 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2597  dethiobiotin synthase  100 
 
 		 263 aa  541  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.204799  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02208  cobyrinic acid a,c-diamide synthase:dethiobiotin synthase  42.97 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.020926  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2554  dethiobiotin synthase  45.26 
 
 		 287 aa  185  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0309873  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1921  dethiobiotin synthase  41.34 
 
 		 235 aa  175  6e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0147663  decreased coverage  0.00139462 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2737  dithiobiotin synthetase  39.08 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2428  dithiobiotin synthetase  38.08 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2356  dithiobiotin synthetase  38.7 
 
 		 231 aa  166  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2516  dithiobiotin synthetase  38.7 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000238987 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1804  dethiobiotin synthase  41.99 
 
 		 221 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511205  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  37.55 
 
 		 242 aa  159  4e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  37.92 
 
 		 230 aa  158  8e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1798  dithiobiotin synthetase  38.87 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121118  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5172  dithiobiotin synthetase  36.55 
 
 		 226 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0206613  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  37.39 
 
 		 225 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1478  dithiobiotin synthetase  40.81 
 
 		 236 aa  152  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  36.55 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1661  dithiobiotin synthetase  39.74 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2773  dethiobiotin synthase  37.24 
 
 		 226 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0046697  hitchhiker  0.00857242 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45930  dithiobiotin synthetase  37.72 
 
 		 231 aa  145  8.000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1722  dethiobiotin synthase  35.29 
 
 		 237 aa  145  9e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000192281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  37.05 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0366  dithiobiotin synthetase  33.74 
 
 		 226 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.55843  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0498  dethiobiotin synthetase  35.02 
 
 		 226 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0857  dithiobiotin synthetase  36.13 
 
 		 227 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1869  dethiobiotin synthase  37.76 
 
 		 222 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  decreased coverage  0.000000281099 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1441  dithiobiotin synthetase  39.48 
 
 		 230 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00254947  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1431  dethiobiotin synthetase  35.98 
 
 		 212 aa  143  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  35.71 
 
 		 226 aa  143  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0392  dithiobiotin synthetase  33.74 
 
 		 226 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  33.33 
 
 		 240 aa  142  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01810  dithiobiotin synthetase  36.29 
 
 		 227 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  33.33 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  33.61 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  33.33 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4084  dithiobiotin synthetase  36.4 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  33.33 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4836  dithiobiotin synthetase  35.22 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.519377 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1761  dithiobiotin synthetase  39.27 
 
 		 246 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1553  dethiobiotin synthetase  35.15 
 
 		 212 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  32.92 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2524  dithiobiotin synthetase  39.11 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.161209  normal  0.3539 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003868  dethiobiotin synthetase  38.02 
 
 		 228 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0633  dithiobiotin synthetase  35.34 
 
 		 238 aa  139  7e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  32.52 
 
 		 225 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  31.58 
 
 		 230 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1754  dithiobiotin synthetase  38.87 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.235022  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  31.58 
 
 		 228 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  31.58 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  32.52 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  31.58 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  32.52 
 
 		 225 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  32.52 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  32.52 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  32.52 
 
 		 225 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  32.52 
 
 		 225 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  31.17 
 
 		 228 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  34.27 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  32.22 
 
 		 226 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  35.27 
 
 		 238 aa  135  8e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0604  dithiobiotin synthetase  38.1 
 
 		 228 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  32.52 
 
 		 225 aa  135  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06570  dithiobiotin synthetase  37.02 
 
 		 228 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2342  dithiobiotin synthetase  40.16 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  32.52 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  34.5 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2753  dithiobiotin synthetase  39.2 
 
 		 234 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  31.25 
 
 		 227 aa  131  9e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1163  dethiobiotin synthase  33.47 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  31.45 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  32.77 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  31.65 
 
 		 226 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1895  putative dithiobiotin synthetase  33.86 
 
 		 221 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3643  dethiobiotin synthase  35.62 
 
 		 236 aa  126  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  36.24 
 
 		 232 aa  125  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  37.39 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  36.53 
 
 		 245 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  34.33 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  36.04 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2346  putative dithiobiotin synthetase  33.98 
 
 		 221 aa  122  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.237745  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1637  dithiobiotin synthetase  33.62 
 
 		 226 aa  122  6e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1580  dithiobiotin synthetase  33.62 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0294479  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2284  dethiobiotin synthase  30.86 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.165561 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0323  dethiobiotin synthase  35.19 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0117307 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2045  putative dithiobiotin synthetase  33.46 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.154785  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2132  putative dithiobiotin synthetase  31.66 
 
 		 223 aa  119  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0249  dithiobiotin synthetase  32.5 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0292  dethiobiotin synthase  33.33 
 
 		 237 aa  118  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0765643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  32.03 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4031  dethiobiotin synthase  38.39 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.677394 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  32.2 
 
 		 243 aa  116  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1129  dethiobiotin synthetase  34.17 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  31.36 
 
 		 266 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6277  dithiobiotin synthetase  37.56 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  34.25 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1920  putative dithiobiotin synthetase  31.58 
 
 		 231 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0959  dethiobiotin synthase  31.71 
 
 		 236 aa  109  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  32.67 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  32.67 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  30.73 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1850  putative dithiobiotin synthetase  29.8 
 
 		 231 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>