294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0116 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0116  dithiobiotin synthetase  100 
 
 
224 aa  450  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2426  dithiobiotin synthetase  63.43 
 
 
229 aa  277  1e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0082  dithiobiotin synthetase  59.64 
 
 
227 aa  255  4e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2835  dethiobiotin synthase  58.93 
 
 
225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2066  dithiobiotin synthetase  58.96 
 
 
231 aa  236  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2454  dethiobiotin synthase  54.07 
 
 
224 aa  223  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.101684  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2186  dethiobiotin synthase  50.93 
 
 
227 aa  207  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2053  dithiobiotin synthetase  46.77 
 
 
217 aa  181  7e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0534973 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1163  dethiobiotin synthase  48.56 
 
 
255 aa  181  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0329  dithiobiotin synthetase  44.5 
 
 
239 aa  170  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0362  dithiobiotin synthetase  44.5 
 
 
239 aa  168  5e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356251  normal  0.0664813 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1160  dethiobiotin synthase  37.37 
 
 
296 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  34.39 
 
 
263 aa  114  8.999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  38.37 
 
 
242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  31.44 
 
 
646 aa  101  8e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1910  dethiobiotin synthase  36.93 
 
 
204 aa  97.1  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  33.91 
 
 
225 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  38.46 
 
 
244 aa  96.7  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  33.33 
 
 
225 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  33.33 
 
 
225 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  33.33 
 
 
225 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  33.33 
 
 
225 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  32.64 
 
 
226 aa  95.5  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  33.52 
 
 
243 aa  95.1  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  35.47 
 
 
228 aa  95.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  35.47 
 
 
230 aa  95.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  32.95 
 
 
239 aa  94.4  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  33.33 
 
 
239 aa  94.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  33.33 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  32.76 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  32.76 
 
 
225 aa  94  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  32.76 
 
 
225 aa  94  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  34.88 
 
 
230 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  34.88 
 
 
228 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  35.58 
 
 
266 aa  93.2  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  33.92 
 
 
264 aa  93.2  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  32.75 
 
 
217 aa  93.2  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  34.88 
 
 
228 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  34.48 
 
 
226 aa  92.8  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  34.29 
 
 
228 aa  92.4  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  29.03 
 
 
228 aa  92.4  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  35.47 
 
 
226 aa  91.7  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  33.53 
 
 
243 aa  91.7  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  34.32 
 
 
242 aa  90.9  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  34.21 
 
 
248 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2051  dethiobiotin synthase  36.52 
 
 
219 aa  90.9  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366532  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5562  dethiobiotin synthase  36.09 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  32.95 
 
 
240 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1002  dethiobiotin synthase  37.87 
 
 
216 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  29.74 
 
 
212 aa  89.7  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1568  dethiobiotin synthase  37.16 
 
 
231 aa  89.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248853  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  33.33 
 
 
254 aa  89.4  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18711  putative dethiobiotin synthase  37.87 
 
 
216 aa  89  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0823  dethiobiotin synthase  28.32 
 
 
228 aa  89  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15911  putative dethiobiotin synthase  35.47 
 
 
242 aa  88.2  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.454357  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  33.91 
 
 
226 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  32.37 
 
 
240 aa  88.2  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  33.71 
 
 
245 aa  87.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3096  dethiobiotin synthase  33.16 
 
 
238 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  35.29 
 
 
223 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1431  dethiobiotin synthetase  30.96 
 
 
212 aa  87  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  34.48 
 
 
227 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  31.72 
 
 
238 aa  86.3  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  35.11 
 
 
234 aa  86.7  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  35.11 
 
 
234 aa  86.7  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  32.37 
 
 
240 aa  86.3  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1553  dethiobiotin synthetase  30.21 
 
 
212 aa  86.3  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0003  dethiobiotin synthase  35.14 
 
 
186 aa  85.5  6e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2946  dethiobiotin synthase  31.19 
 
 
239 aa  85.5  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00040484  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  30.77 
 
 
211 aa  85.5  6e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  32.97 
 
 
242 aa  85.1  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  33.33 
 
 
238 aa  85.1  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0030  dethiobiotin synthase  37.28 
 
 
210 aa  85.1  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82628  normal  0.806655 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  31.22 
 
 
221 aa  84.7  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  30.99 
 
 
226 aa  84.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  31.58 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003868  dethiobiotin synthetase  32.2 
 
 
228 aa  84  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1009  dethiobiotin synthase  38.27 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997802 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  31.4 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  32.16 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  33.53 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  32.54 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3643  dethiobiotin synthase  28.79 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1097  dethiobiotin synthase  35.19 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  32.54 
 
 
242 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  32.54 
 
 
242 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0820  dethiobiotin synthase  34.95 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.22019  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4239  dithiobiotin synthetase  35.83 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.528424 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  32.54 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16731  putative dethiobiotin synthase  31.25 
 
 
221 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2778  dithiobiotin synthetase  34.34 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.352107  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  33.53 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1752  dethiobiotin synthase  29.23 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00909358  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  33.72 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0621  dethiobiotin synthase  34.3 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  32.54 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0633  dithiobiotin synthetase  30.51 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0682  dethiobiotin synthase  36.84 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.199224  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  31.55 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1867  dethiobiotin synthase  31.22 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>