More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1047 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  100 
 
 
216 aa  436  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  52.68 
 
 
210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2815  dithiobiotin synthetase  44.85 
 
 
212 aa  159  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2420  dithiobiotin synthetase  45.79 
 
 
213 aa  153  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.401456  normal  0.0742626 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  45.64 
 
 
474 aa  153  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4343  dithiobiotin synthetase  46.15 
 
 
213 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0906504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2778  dithiobiotin synthetase  44.22 
 
 
210 aa  151  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.352107  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0036  dethiobiotin synthase  44.67 
 
 
206 aa  149  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0030  dethiobiotin synthase  44.88 
 
 
210 aa  148  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82628  normal  0.806655 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18711  putative dethiobiotin synthase  38.61 
 
 
216 aa  148  7e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2098  dithiobiotin synthetase  40.7 
 
 
209 aa  147  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.250318  normal  0.47001 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1002  dethiobiotin synthase  38.61 
 
 
216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04561  putative dethiobiotin synthase  44.67 
 
 
232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1910  dethiobiotin synthase  36.68 
 
 
204 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4239  dithiobiotin synthetase  42.71 
 
 
212 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.528424 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2821  dithiobiotin synthetase  39.38 
 
 
212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3319  dithiobiotin synthetase  43.85 
 
 
212 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0490  dithiobiotin synthetase  40.51 
 
 
212 aa  135  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1255  dithiobiotin synthetase  41.94 
 
 
209 aa  135  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.52735 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0428  dithiobiotin synthetase  40.51 
 
 
212 aa  135  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0717  dithiobiotin synthetase  39.9 
 
 
206 aa  135  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5562  dethiobiotin synthase  44.31 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2918  dithiobiotin synthetase  43.41 
 
 
202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.295464  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2051  dethiobiotin synthase  41.85 
 
 
219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366532  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1690  dethiobiotin synthase  37.5 
 
 
202 aa  131  7.999999999999999e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.439314  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15911  putative dethiobiotin synthase  36.27 
 
 
242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.454357  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0811  dethiobiotin synthase  39.75 
 
 
210 aa  129  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.624971  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1474  dithiobiotin synthetase  42.13 
 
 
202 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  40.41 
 
 
210 aa  128  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  38.97 
 
 
242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2919  dithiobiotin synthetase  42.19 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0621  dethiobiotin synthase  38.38 
 
 
219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85593  dethiobiotin synthetase  39.66 
 
 
217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16511  putative dethiobiotin synthase  31.91 
 
 
221 aa  125  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  38.46 
 
 
242 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  37.95 
 
 
242 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16731  putative dethiobiotin synthase  30.85 
 
 
221 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16611  putative dethiobiotin synthase  31.38 
 
 
232 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  37.44 
 
 
242 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  37.95 
 
 
242 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  37.95 
 
 
242 aa  122  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  37.95 
 
 
242 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1564  dethiobiotin synthase  30.35 
 
 
221 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  37.95 
 
 
242 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  37.95 
 
 
242 aa  122  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  38.89 
 
 
242 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  37.24 
 
 
242 aa  122  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  42.57 
 
 
242 aa  121  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  37.56 
 
 
212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  44.89 
 
 
234 aa  119  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05390  dethiobiotin synthetase  33.83 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.198587  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  42.56 
 
 
248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0617  dethiobiotin synthase  29.39 
 
 
249 aa  116  3e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0451088  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  37.11 
 
 
211 aa  116  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2977  dethiobiotin synthetase  36.14 
 
 
206 aa  115  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  29.86 
 
 
244 aa  108  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  34.52 
 
 
217 aa  107  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2133  dethiobiotin synthase  43.48 
 
 
223 aa  106  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  37.44 
 
 
263 aa  103  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  44.19 
 
 
262 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  44.19 
 
 
251 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  40.56 
 
 
239 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0003  dethiobiotin synthase  35.58 
 
 
186 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  45.45 
 
 
244 aa  101  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  43.02 
 
 
240 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  40 
 
 
239 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  33.65 
 
 
225 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1553  dethiobiotin synthetase  38.99 
 
 
212 aa  99.4  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1097  dethiobiotin synthase  34.97 
 
 
190 aa  99  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110147  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0820  dethiobiotin synthase  36.2 
 
 
186 aa  99  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.22019  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1658  dethiobiotin synthetase  30.37 
 
 
201 aa  98.6  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.222948  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  42.29 
 
 
241 aa  98.6  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1431  dethiobiotin synthetase  38.99 
 
 
212 aa  98.2  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1300  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  37.3 
 
 
708 aa  98.2  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0734897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  32.88 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  32.88 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0330  dethiobiotin synthetase  29.84 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0353  dethiobiotin synthetase  29.84 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.789555  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  38.35 
 
 
226 aa  97.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  32.43 
 
 
225 aa  96.7  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  32.43 
 
 
225 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  32.43 
 
 
225 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0083  dethiobiotin synthase  30.58 
 
 
203 aa  96.7  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  32.43 
 
 
225 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  32.43 
 
 
225 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  32.43 
 
 
225 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2663  dethiobiotin synthase  39.04 
 
 
238 aa  95.1  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265102  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2186  dethiobiotin synthase  36.55 
 
 
227 aa  95.1  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  33.89 
 
 
646 aa  94.7  9e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1390  dethiobiotin synthetase  28.57 
 
 
190 aa  94.7  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  33.04 
 
 
228 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  34.98 
 
 
230 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  35.36 
 
 
243 aa  92.8  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  39.9 
 
 
264 aa  93.2  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  29.67 
 
 
243 aa  92.4  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  38.24 
 
 
226 aa  92.4  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0070  dethiobiotin synthase  40.3 
 
 
223 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338425  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  32.6 
 
 
228 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  33.99 
 
 
228 aa  91.3  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1867  dethiobiotin synthase  37.3 
 
 
223 aa  90.9  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>