More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_10780 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_10780  dethiobiotin synthase  100 
 
 		 240 aa  459  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5739  dethiobiotin synthase  70.82 
 
 		 242 aa  297  9e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.945686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8310  Dethiobiotin synthase  61.54 
 
 		 240 aa  228  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0968  dithiobiotin synthetase  59.83 
 
 		 238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1632  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3699  dethiobiotin synthase  55.79 
 
 		 240 aa  224  8e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0969414  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7723  dithiobiotin synthetase  59.48 
 
 		 242 aa  220  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3762  dithiobiotin synthetase  59.15 
 
 		 238 aa  216  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.531948  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0613  dethiobiotin synthase  61.67 
 
 		 245 aa  216  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661073  normal  0.951436 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2973  dethiobiotin synthase  54.55 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.109922  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1571  dethiobiotin synthase  49.57 
 
 		 246 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.706287 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3412  dethiobiotin synthase  45.15 
 
 		 281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1052  dethiobiotin synthase  45.22 
 
 		 238 aa  142  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.802225  normal  0.0589723 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1520  dethiobiotin synthase  49.57 
 
 		 234 aa  142  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000244558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0472  dethiobiotin synthase  42.66 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322044 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2000  dethiobiotin synthase  47.27 
 
 		 236 aa  135  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2790  dithiobiotin synthetase  48.9 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.615305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3076  dithiobiotin synthetase  46.58 
 
 		 229 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3136  dithiobiotin synthetase  46.58 
 
 		 229 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3093  dithiobiotin synthetase  46.58 
 
 		 229 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842884  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  37.66 
 
 		 249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  40.29 
 
 		 241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3627  dithiobiotin synthetase  47.89 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  40 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  40.98 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  39.42 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  34.65 
 
 		 242 aa  105  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  38.1 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  35.14 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  36.57 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  32.44 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  34.23 
 
 		 242 aa  99  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  35.61 
 
 		 264 aa  99  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  33.63 
 
 		 242 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  33.33 
 
 		 242 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  37.74 
 
 		 234 aa  97.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  33.33 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  34.74 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  35.96 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2946  dethiobiotin synthase  30.49 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00040484  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  35.96 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  32.13 
 
 		 242 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  32.88 
 
 		 242 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  32.13 
 
 		 242 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  32.88 
 
 		 242 aa  92.4  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3096  dethiobiotin synthase  33.48 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0329  dithiobiotin synthetase  36.96 
 
 		 239 aa  89.4  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  35.61 
 
 		 241 aa  89.4  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  37.5 
 
 		 220 aa  88.2  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0304  dethiobiotin synthase  31.16 
 
 		 225 aa  87  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  29.95 
 
 		 217 aa  86.3  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0362  dithiobiotin synthetase  35.87 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356251  normal  0.0664813 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  30.86 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  40.68 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  40.68 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  43.35 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  37.81 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  37.81 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4330  dithiobiotin synthetase  26.11 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0088  dethiobiotin synthase  42.36 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.021607  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1910  dethiobiotin synthase  34.12 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  24.39 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18711  putative dethiobiotin synthase  29.6 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0076  dethiobiotin synthase  40.89 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0617  dethiobiotin synthase  30.1 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0451088  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2051  dethiobiotin synthase  35.32 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1911  dethiobiotin synthase  36.73 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1002  dethiobiotin synthase  29.15 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  24.03 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  38.64 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  29.41 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0070  dethiobiotin synthase  42.36 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338425  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  28.43 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  33.48 
 
 		 210 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  30.05 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11602  dithiobiotin synthetase  44.68 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000527679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  31.86 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1752  dethiobiotin synthase  31.45 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00909358  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2454  dethiobiotin synthase  34.64 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.101684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  38.37 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04561  putative dethiobiotin synthase  33.49 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  33.49 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  29.86 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  36.21 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0717  dithiobiotin synthetase  34.43 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2066  dithiobiotin synthetase  36.67 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1009  dethiobiotin synthase  35.55 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997802 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85593  dethiobiotin synthetase  31.25 
 
 		 217 aa  72  0.000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0820  dethiobiotin synthase  29.61 
 
 		 186 aa  72  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.22019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2384  dethiobiotin synthase  35.32 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.393597  normal  0.141052 
 
 
-
 
NC_002950  PG2053  dithiobiotin synthetase  33.15 
 
 		 217 aa  71.6  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0534973 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  33.33 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  32.6 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16511  putative dethiobiotin synthase  27.69 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0490  dithiobiotin synthetase  37.5 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16731  putative dethiobiotin synthase  27.64 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0428  dithiobiotin synthetase  37.5 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16611  putative dethiobiotin synthase  28.86 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2835  dethiobiotin synthase  32.98 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1564  dethiobiotin synthase  27.14 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  33 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>