More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5739 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5739  dethiobiotin synthase  100 
 
 		 242 aa  464  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.945686  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10780  dethiobiotin synthase  70.82 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3699  dethiobiotin synthase  57.46 
 
 		 240 aa  231  9e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0969414  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7723  dithiobiotin synthetase  56.9 
 
 		 242 aa  220  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8310  Dethiobiotin synthase  59.05 
 
 		 240 aa  215  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0613  dethiobiotin synthase  59.91 
 
 		 245 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661073  normal  0.951436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0968  dithiobiotin synthetase  56.03 
 
 		 238 aa  210  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1632  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3762  dithiobiotin synthetase  56.22 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.531948  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2973  dethiobiotin synthase  55.24 
 
 		 272 aa  172  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.109922  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1052  dethiobiotin synthase  46.55 
 
 		 238 aa  162  6e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.802225  normal  0.0589723 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1571  dethiobiotin synthase  49.34 
 
 		 246 aa  155  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.706287 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0472  dethiobiotin synthase  46.36 
 
 		 219 aa  151  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322044 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1520  dethiobiotin synthase  49.78 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000244558 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2000  dethiobiotin synthase  47.73 
 
 		 236 aa  134  9e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2790  dithiobiotin synthetase  46.38 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.615305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3412  dethiobiotin synthase  43.22 
 
 		 281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3627  dithiobiotin synthetase  45.36 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3076  dithiobiotin synthetase  45.45 
 
 		 229 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3136  dithiobiotin synthetase  45.45 
 
 		 229 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  45.63 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3093  dithiobiotin synthetase  45.45 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842884  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  37.27 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  40.47 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  40.1 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  36.82 
 
 		 242 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  35.91 
 
 		 242 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  37.27 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  35.91 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  38.28 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  35.45 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  38.76 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  35.29 
 
 		 264 aa  102  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  33.2 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  33.2 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  37.14 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  33.2 
 
 		 242 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  33.2 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  36.53 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  36.07 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  38.76 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  37.68 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  32.89 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11602  dithiobiotin synthetase  43.65 
 
 		 226 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000527679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  38.83 
 
 		 241 aa  93.2  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  37.86 
 
 		 234 aa  92.8  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  43.75 
 
 		 223 aa  92.4  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  26.47 
 
 		 228 aa  87  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4330  dithiobiotin synthetase  27.27 
 
 		 228 aa  85.1  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  34.1 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  33.82 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0304  dethiobiotin synthase  31.66 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  39.6 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  39.6 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  37.31 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  32.63 
 
 		 646 aa  83.2  0.000000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  39.66 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  28.43 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  34.82 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3096  dethiobiotin synthase  31.88 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1002  dethiobiotin synthase  32.83 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  32.45 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0329  dithiobiotin synthetase  34.05 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18711  putative dethiobiotin synthase  32.32 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1752  dethiobiotin synthase  28.43 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00909358  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0088  dethiobiotin synthase  44 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.021607  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  41.14 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0076  dethiobiotin synthase  47.95 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2946  dethiobiotin synthase  28.5 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00040484  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  28.57 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  32.02 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  41.14 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  38.92 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1009  dethiobiotin synthase  36.28 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997802 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2051  dethiobiotin synthase  35.27 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  32.38 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2066  dithiobiotin synthetase  37.57 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0813  dethiobiotin synthase  32.3 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.448575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  25.36 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0070  dethiobiotin synthase  40.59 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338425  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2384  dethiobiotin synthase  36.94 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.393597  normal  0.141052 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0617  dethiobiotin synthase  29.15 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0451088  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  32.24 
 
 		 213 aa  78.2  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  38.89 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1869  dethiobiotin synthase  32.85 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  decreased coverage  0.000000281099 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1163  dethiobiotin synthase  35.62 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0082  dithiobiotin synthetase  32.44 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16731  putative dethiobiotin synthase  29.56 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2426  dithiobiotin synthetase  34.39 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1910  dethiobiotin synthase  33.33 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  32.74 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  37.71 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0030  dethiobiotin synthase  38.42 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82628  normal  0.806655 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  33.17 
 
 		 210 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0490  dithiobiotin synthetase  39.05 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0460  dethiobiotin synthase  32.5 
 
 		 220 aa  75.1  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00232018  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0428  dithiobiotin synthetase  39.05 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2977  dethiobiotin synthetase  35.93 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85593  dethiobiotin synthetase  32.06 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  34.4 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  31.88 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>