298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2973 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2973  dethiobiotin synthase  100 
 
 		 272 aa  519  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.109922  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3699  dethiobiotin synthase  55.24 
 
 		 240 aa  195  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0969414  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0613  dethiobiotin synthase  59.52 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661073  normal  0.951436 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5739  dethiobiotin synthase  55.24 
 
 		 242 aa  181  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.945686  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7723  dithiobiotin synthetase  53.27 
 
 		 242 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10780  dethiobiotin synthase  54.55 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8310  Dethiobiotin synthase  54.29 
 
 		 240 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2000  dethiobiotin synthase  52.79 
 
 		 236 aa  162  7e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3762  dithiobiotin synthetase  51.53 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.531948  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0968  dithiobiotin synthetase  50.95 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1632  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1571  dethiobiotin synthase  47.95 
 
 		 246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.706287 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1052  dethiobiotin synthase  47.47 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.802225  normal  0.0589723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2790  dithiobiotin synthetase  47.89 
 
 		 226 aa  143  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.615305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0472  dethiobiotin synthase  45.12 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322044 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1520  dethiobiotin synthase  47.51 
 
 		 234 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000244558 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3627  dithiobiotin synthetase  44.6 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3412  dethiobiotin synthase  41.35 
 
 		 281 aa  125  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3093  dithiobiotin synthetase  45.58 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842884  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3076  dithiobiotin synthetase  45.58 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3136  dithiobiotin synthetase  45.58 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  41.15 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  34.04 
 
 		 242 aa  112  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  38.28 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  34.31 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  33.47 
 
 		 242 aa  109  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  32.41 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  37.56 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  41.83 
 
 		 241 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  36.14 
 
 		 243 aa  106  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  33.19 
 
 		 242 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  41.26 
 
 		 241 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  32.77 
 
 		 242 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  32.34 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  35.68 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  35.02 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  32.77 
 
 		 242 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  32.77 
 
 		 242 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  35.19 
 
 		 264 aa  102  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  36.73 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  44.5 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  32.77 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  32.77 
 
 		 242 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  35.27 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  34.42 
 
 		 239 aa  97.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11602  dithiobiotin synthetase  44.1 
 
 		 226 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000527679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4330  dithiobiotin synthetase  28.9 
 
 		 228 aa  96.3  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1911  dethiobiotin synthase  38.02 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  37.2 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  41.52 
 
 		 234 aa  90.1  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  41.52 
 
 		 234 aa  90.1  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  26.79 
 
 		 211 aa  89.4  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  33.02 
 
 		 239 aa  89.4  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  24.56 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  31.16 
 
 		 646 aa  87  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1009  dethiobiotin synthase  36.36 
 
 		 247 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997802 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0329  dithiobiotin synthetase  33.88 
 
 		 239 aa  85.9  6e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0823  dethiobiotin synthase  28.37 
 
 		 228 aa  85.9  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  31.25 
 
 		 213 aa  85.9  7e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1163  dethiobiotin synthase  37.2 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  25.63 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0304  dethiobiotin synthase  29.7 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3711  dethiobiotin synthase  32.52 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00204232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3096  dethiobiotin synthase  31.44 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1752  dethiobiotin synthase  25.85 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00909358  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0717  dithiobiotin synthetase  37.75 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2066  dithiobiotin synthetase  36.07 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  29.53 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1117  dethiobiotin synthase  36.02 
 
 		 232 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  40.59 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  27.45 
 
 		 212 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2396  dethiobiotin synthase  30.11 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1910  dethiobiotin synthase  27.8 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2946  dethiobiotin synthase  27.27 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00040484  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0082  dithiobiotin synthetase  31.67 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0362  dithiobiotin synthetase  31.15 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356251  normal  0.0664813 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1804  dethiobiotin synthase  36.1 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511205  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05390  dethiobiotin synthetase  31.66 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.198587  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  31.98 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1921  dethiobiotin synthase  31.43 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0147663  decreased coverage  0.00139462 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  34.48 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0030  dethiobiotin synthase  36.93 
 
 		 210 aa  78.2  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82628  normal  0.806655 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  37.87 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  36.54 
 
 		 226 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2133  dethiobiotin synthase  32.2 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0682  dethiobiotin synthase  34.45 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.199224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  35.75 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0617  dethiobiotin synthase  30 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0451088  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  38.46 
 
 		 474 aa  76.6  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1097  dethiobiotin synthase  25.54 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110147  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0529  dethiobiotin synthase  40.45 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.256581  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1163  dethiobiotin synthase  30.05 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  32.24 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2876  dethiobiotin synthase  37.37 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  35.32 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0036  dethiobiotin synthase  35.47 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85593  dethiobiotin synthetase  30.73 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2773  dethiobiotin synthase  33.5 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0046697  hitchhiker  0.00857242 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  38.37 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0003  dethiobiotin synthase  30.13 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  33.5 
 
 		 210 aa  75.1  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>