299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3762 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3762  dithiobiotin synthetase  100 
 
 		 238 aa  451  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.531948  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0968  dithiobiotin synthetase  71.61 
 
 		 238 aa  295  5e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1632  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3699  dethiobiotin synthase  64.22 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0969414  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7723  dithiobiotin synthetase  64.14 
 
 		 242 aa  263  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8310  Dethiobiotin synthase  66.53 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10780  dethiobiotin synthase  61.21 
 
 		 240 aa  228  6e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5739  dethiobiotin synthase  57.2 
 
 		 242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.945686  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0613  dethiobiotin synthase  61.57 
 
 		 245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661073  normal  0.951436 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2973  dethiobiotin synthase  53.3 
 
 		 272 aa  159  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.109922  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3412  dethiobiotin synthase  46.61 
 
 		 281 aa  149  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0472  dethiobiotin synthase  45.21 
 
 		 219 aa  149  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322044 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1052  dethiobiotin synthase  46.12 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.802225  normal  0.0589723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2790  dithiobiotin synthetase  48.53 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.615305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1571  dethiobiotin synthase  47.48 
 
 		 246 aa  135  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.706287 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3627  dithiobiotin synthetase  48.97 
 
 		 226 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1520  dethiobiotin synthase  47.9 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000244558 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3093  dithiobiotin synthetase  47.77 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842884  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3076  dithiobiotin synthetase  47.32 
 
 		 229 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3136  dithiobiotin synthetase  47.32 
 
 		 229 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2000  dethiobiotin synthase  44.83 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  39.09 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  35.43 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  38.72 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  43.69 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  34.53 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  34.08 
 
 		 242 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  33.48 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  37.38 
 
 		 242 aa  99.8  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  35.54 
 
 		 239 aa  99  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  35.96 
 
 		 264 aa  98.6  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  35.54 
 
 		 239 aa  98.2  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  36.06 
 
 		 243 aa  98.2  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  33.18 
 
 		 242 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  32.29 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  33.63 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0617  dethiobiotin synthase  31.31 
 
 		 249 aa  95.9  4e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0451088  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  34.58 
 
 		 263 aa  95.5  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  32.29 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  32.29 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  42.13 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  42.13 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  31.84 
 
 		 242 aa  92.4  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  31.84 
 
 		 242 aa  92.4  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  33.47 
 
 		 249 aa  92.4  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  36.44 
 
 		 243 aa  91.7  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  30.85 
 
 		 646 aa  89.7  3e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  35.26 
 
 		 217 aa  89  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  38.54 
 
 		 241 aa  88.6  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1911  dethiobiotin synthase  39.7 
 
 		 227 aa  85.9  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  40.89 
 
 		 234 aa  85.5  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  40.89 
 
 		 234 aa  85.5  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11602  dithiobiotin synthetase  44.39 
 
 		 226 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000527679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1842  dithiobiotin synthetase  30.39 
 
 		 244 aa  85.5  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.709275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0717  dithiobiotin synthetase  36.82 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  40.7 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  37.63 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  30.36 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2946  dethiobiotin synthase  27.45 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00040484  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  37.16 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0076  dethiobiotin synthase  39.9 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  39.31 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  38.27 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  30 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  38.92 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0304  dethiobiotin synthase  29.35 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2396  dethiobiotin synthase  26.44 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0088  dethiobiotin synthase  39.9 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.021607  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  27.75 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2678  dithiobiotin synthetase  32.21 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  34.76 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3426  dithiobiotin synthetase  32.21 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0070  dethiobiotin synthase  40.1 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338425  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  40.23 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  37.36 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  34.32 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1009  dethiobiotin synthase  34.58 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997802 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  38.46 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3096  dethiobiotin synthase  30.73 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1163  dethiobiotin synthase  36.2 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1373  dithiobiotin synthetase  33.01 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.265061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2663  dethiobiotin synthase  32.38 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265102  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  32.54 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  23.53 
 
 		 228 aa  72  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2053  dithiobiotin synthetase  35.14 
 
 		 217 aa  72  0.000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0534973 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0682  dethiobiotin synthase  35.44 
 
 		 241 aa  72  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.199224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3643  dethiobiotin synthase  35.65 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2384  dethiobiotin synthase  38.86 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.393597  normal  0.141052 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0529  dethiobiotin synthase  38.8 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.256581  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  30.43 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4330  dithiobiotin synthetase  28.65 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  35 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0329  dithiobiotin synthetase  32.61 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2066  dithiobiotin synthetase  36.31 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1474  dithiobiotin synthetase  35.71 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1752  dethiobiotin synthase  29.38 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00909358  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  36.07 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  26.74 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1002  dethiobiotin synthase  28.71 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1910  dethiobiotin synthase  34.29 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1869  dethiobiotin synthase  32.54 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  decreased coverage  0.000000281099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>