285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1520 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1520  dethiobiotin synthase  100 
 
 
234 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000244558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1571  dethiobiotin synthase  94.85 
 
 
246 aa  400  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.706287 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1052  dethiobiotin synthase  54.46 
 
 
238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.802225  normal  0.0589723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0472  dethiobiotin synthase  53.39 
 
 
219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3699  dethiobiotin synthase  50.88 
 
 
240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0969414  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5739  dethiobiotin synthase  49.78 
 
 
242 aa  165  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.945686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8310  Dethiobiotin synthase  52.4 
 
 
240 aa  164  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10780  dethiobiotin synthase  49.57 
 
 
240 aa  157  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0613  dethiobiotin synthase  49.79 
 
 
245 aa  156  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661073  normal  0.951436 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7723  dithiobiotin synthetase  47.26 
 
 
242 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0968  dithiobiotin synthetase  48.47 
 
 
238 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1632  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2973  dethiobiotin synthase  47.51 
 
 
272 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.109922  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3762  dithiobiotin synthetase  45.95 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.531948  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2000  dethiobiotin synthase  45.02 
 
 
236 aa  128  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2790  dithiobiotin synthetase  46.26 
 
 
226 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.615305  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  51.83 
 
 
223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3076  dithiobiotin synthetase  44.05 
 
 
229 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3136  dithiobiotin synthetase  44.05 
 
 
229 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3093  dithiobiotin synthetase  43.61 
 
 
229 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842884  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3627  dithiobiotin synthetase  45.96 
 
 
226 aa  112  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.379996  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3412  dethiobiotin synthase  42.06 
 
 
281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  36.99 
 
 
217 aa  101  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  41.38 
 
 
242 aa  99.8  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  38.86 
 
 
249 aa  99.8  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  31.35 
 
 
212 aa  98.2  9e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  32.16 
 
 
646 aa  97.4  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  40.84 
 
 
241 aa  97.1  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0088  dethiobiotin synthase  50 
 
 
223 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.021607  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0070  dethiobiotin synthase  50 
 
 
223 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338425  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0076  dethiobiotin synthase  49.43 
 
 
223 aa  95.9  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  41.28 
 
 
234 aa  94.7  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  36.73 
 
 
263 aa  94.7  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  35.94 
 
 
243 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  38.86 
 
 
244 aa  89.4  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  35.96 
 
 
228 aa  88.6  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0517  dethiobiotin synthase  31.09 
 
 
221 aa  87.4  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0354098  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  38.8 
 
 
248 aa  87.8  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  34.03 
 
 
239 aa  86.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  34.92 
 
 
243 aa  86.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  39.3 
 
 
266 aa  86.3  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  40.7 
 
 
220 aa  86.3  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  39.23 
 
 
233 aa  85.9  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  34.45 
 
 
239 aa  85.1  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  29.89 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1009  dethiobiotin synthase  39.38 
 
 
247 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997802 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0682  dethiobiotin synthase  38.46 
 
 
241 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.199224  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  33.78 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0823  dethiobiotin synthase  27.93 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  37.99 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  37.99 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2946  dethiobiotin synthase  29.95 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00040484  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  31.69 
 
 
264 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11602  dithiobiotin synthetase  45.95 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000527679  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  42.7 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0617  dethiobiotin synthase  31 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0451088  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  34.96 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2554  dethiobiotin synthase  32.68 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0309873  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  42.7 
 
 
251 aa  80.1  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1002  dethiobiotin synthase  34.81 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  37 
 
 
226 aa  79  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  33.78 
 
 
242 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  34.22 
 
 
242 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2396  dethiobiotin synthase  28.65 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0036  dethiobiotin synthase  37.3 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18711  putative dethiobiotin synthase  34.81 
 
 
216 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  37.43 
 
 
242 aa  77  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  32.89 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4330  dithiobiotin synthetase  27.86 
 
 
228 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112465  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  34.27 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1911  dethiobiotin synthase  36.19 
 
 
227 aa  77  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2051  dethiobiotin synthase  37.95 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366532  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0490  dithiobiotin synthetase  36.09 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0428  dithiobiotin synthetase  36.09 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3711  dethiobiotin synthase  35.53 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00204232  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0717  dithiobiotin synthetase  41.46 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  32.44 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  37.1 
 
 
248 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  32.44 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  36.42 
 
 
243 aa  75.1  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  35.48 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  35 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0460  dethiobiotin synthase  28.64 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00232018  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  34.43 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  36.52 
 
 
474 aa  74.7  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  32.86 
 
 
226 aa  74.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  30.81 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  32.44 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3096  dethiobiotin synthase  29.1 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  30.81 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  34.55 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  32.44 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  30.81 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2821  dithiobiotin synthetase  31.36 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  34.57 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2663  dethiobiotin synthase  36.7 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265102  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1117  dethiobiotin synthase  38.73 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  34.44 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  29.72 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0820  dethiobiotin synthase  29.34 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.22019  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  30.33 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>