292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5169 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5169  dethiobiotin synthase  100 
 
 
225 aa  428  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456743  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6356  dethiobiotin synthase  87.95 
 
 
225 aa  350  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2287  dethiobiotin synthase  71.1 
 
 
225 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2611  dethiobiotin synthase  70.37 
 
 
225 aa  261  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2332  dethiobiotin synthase  69.44 
 
 
225 aa  259  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.323651  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0738  dethiobiotin synthase  69.44 
 
 
223 aa  240  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.232851  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2133  dethiobiotin synthase  48.34 
 
 
223 aa  172  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0040  dethiobiotin synthase  48.42 
 
 
215 aa  162  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0813  dethiobiotin synthase  43.87 
 
 
229 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.448575  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1867  dethiobiotin synthase  47.34 
 
 
223 aa  154  8e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1345  dethiobiotin synthase  42.86 
 
 
221 aa  149  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.408659  normal  0.0545266 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0888  dethiobiotin synthase  34.47 
 
 
231 aa  135  4e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1110  dethiobiotin synthetase  33.64 
 
 
230 aa  135  4e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.588199  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2876  dethiobiotin synthase  49.48 
 
 
230 aa  128  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1300  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  39.55 
 
 
708 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0734897  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  38.57 
 
 
234 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  41.85 
 
 
262 aa  106  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  41.85 
 
 
251 aa  106  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2384  dethiobiotin synthase  41.21 
 
 
238 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.393597  normal  0.141052 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1910  dethiobiotin synthase  31.55 
 
 
204 aa  99  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  38.74 
 
 
220 aa  97.4  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0362  dithiobiotin synthetase  32.98 
 
 
239 aa  96.7  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356251  normal  0.0664813 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  37.23 
 
 
228 aa  95.5  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  32.72 
 
 
239 aa  94.7  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1431  dethiobiotin synthetase  32.2 
 
 
212 aa  94.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  36.73 
 
 
242 aa  94.4  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  32.69 
 
 
239 aa  93.6  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1163  dethiobiotin synthase  33.68 
 
 
255 aa  94  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  38.14 
 
 
245 aa  92.8  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  32.97 
 
 
242 aa  92.8  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0329  dithiobiotin synthetase  32.98 
 
 
239 aa  92.8  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  36.02 
 
 
247 aa  92  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  39.88 
 
 
230 aa  90.9  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  33.33 
 
 
226 aa  91.3  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  36.41 
 
 
226 aa  91.3  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  38.99 
 
 
230 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  38.99 
 
 
228 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  39.88 
 
 
232 aa  90.1  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  40.12 
 
 
239 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  33.71 
 
 
221 aa  90.1  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1553  dethiobiotin synthetase  32.2 
 
 
212 aa  89.7  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  34.76 
 
 
226 aa  89.4  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  38.36 
 
 
228 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  38.36 
 
 
228 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2186  dethiobiotin synthase  35.36 
 
 
227 aa  88.6  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  37.74 
 
 
230 aa  88.6  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  35.2 
 
 
227 aa  88.6  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  35.5 
 
 
238 aa  88.6  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  33.69 
 
 
225 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  39.07 
 
 
223 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  34.22 
 
 
225 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  34.22 
 
 
225 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  34.22 
 
 
225 aa  87  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  24.65 
 
 
646 aa  87.4  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  34.22 
 
 
225 aa  87  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  31.84 
 
 
249 aa  87  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  34.22 
 
 
225 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  34.22 
 
 
225 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  34.22 
 
 
225 aa  87  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  31.32 
 
 
242 aa  86.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  34.76 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  31.32 
 
 
242 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2835  dethiobiotin synthase  32.77 
 
 
225 aa  85.9  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  36.14 
 
 
226 aa  85.9  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4084  dithiobiotin synthetase  40.8 
 
 
228 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610971  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  33.69 
 
 
225 aa  85.5  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  31.87 
 
 
242 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  30.22 
 
 
242 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  30.22 
 
 
242 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  32.73 
 
 
248 aa  85.5  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0529  dethiobiotin synthase  36.98 
 
 
237 aa  85.1  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.256581  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  40.94 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  35.71 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  33.52 
 
 
226 aa  84.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  40.94 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2053  dithiobiotin synthetase  29.73 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0534973 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0823  dethiobiotin synthase  24.15 
 
 
228 aa  84  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  32.96 
 
 
240 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  32.96 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  25.33 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  31.32 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2426  dithiobiotin synthetase  34.46 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  33.17 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1373  dithiobiotin synthetase  40.62 
 
 
235 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.409918  normal  0.0708007 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  36.48 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  37.11 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  34.18 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  32.4 
 
 
245 aa  82  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  30.22 
 
 
242 aa  82  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  30.22 
 
 
242 aa  82  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  31.58 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  38.15 
 
 
243 aa  81.6  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0857  dithiobiotin synthetase  30.11 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  32.14 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1437  dithiobiotin synthetase  40.62 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.581627 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0261  dethiobiotin synthase  26.92 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.909674  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  30.22 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  26.57 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  36.57 
 
 
226 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02208  cobyrinic acid a,c-diamide synthase:dethiobiotin synthase  32.84 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.020926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>